220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3691 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3691  NERD domain-containing protein  100 
 
 		 259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.003996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1607  NERD domain protein  50 
 
 		 211 aa  193  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1309  NERD domain protein  40.26 
 
 		 262 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  37.08 
 
 		 262 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  35.66 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1118  NERD domain protein  38.1 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.2197  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  33.47 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3613  NERD domain protein  34.63 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646238  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  37.34 
 
 		 269 aa  139  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2012  NERD domain protein  36.21 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  32.56 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1708  hypothetical protein  33.98 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352686  normal  0.0530118 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2416  DNA-binding protein  34.38 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00817944  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  37.19 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  40 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  40 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  39.44 
 
 		 212 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  37.5 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0751  NERD domain protein  31.6 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.234498  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  36.07 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1130  NERD domain-containing protein  40.94 
 
 		 199 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509839 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4233  NERD domain-containing protein  32.61 
 
 		 207 aa  95.9  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2211  NERD domain-containing protein  33.93 
 
 		 353 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1416  NERD domain-containing protein  30.32 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0503  NERD domain-containing protein  30.43 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.180514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1610  hypothetical protein  26.78 
 
 		 387 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00290154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0334  NERD domain-containing protein  30 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0988306  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1109  hypothetical protein  27.54 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2594  NERD domain protein  26.73 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.173089  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3513  NERD domain-containing protein  20.28 
 
 		 226 aa  62  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1889  hypothetical protein  38.37 
 
 		 139 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.344159 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  60.61 
 
 		 817 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3961  NERD domain-containing protein  23.66 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0609224  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  45.1 
 
 		 812 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0319  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  39.62 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.020229  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3879  topoisomerase DNA binding C4 zinc finger domain-containing protein  39.62 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000865305  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0620  topoisomerase DNA binding C4 zinc finger domain-containing protein  39.62 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000280134  normal  0.0216681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1002  NERD domain-containing protein  25.21 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.435611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  54.55 
 
 		 814 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  54.55 
 
 		 814 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  53.12 
 
 		 743 aa  54.3  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  51.61 
 
 		 694 aa  54.3  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07440  hypothetical protein  34.94 
 
 		 111 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316107  normal  0.202998 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1208  DNA topoisomerase I  37.74 
 
 		 721 aa  52.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000400838  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3205  NERD domain protein  34.69 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.474591  normal  0.680793 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  35.85 
 
 		 694 aa  51.6  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  28.57 
 
 		 694 aa  51.6  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  37.74 
 
 		 704 aa  51.6  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0849  NERD domain protein  35.05 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0028  DNA topoisomerase I  42.86 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0369311  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  43.75 
 
 		 702 aa  50.8  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  46.88 
 
 		 689 aa  51.2  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  60 
 
 		 793 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5568  NERD domain-containing protein  30.7 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.539565 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  45.45 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  29.63 
 
 		 708 aa  50.4  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  39.22 
 
 		 853 aa  50.4  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00387  DNA topoisomerase A  48.39 
 
 		 188 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2529  DNA topoisomerase III  51.52 
 
 		 722 aa  50.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3579  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  51.61 
 
 		 180 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0127763  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3766  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  51.61 
 
 		 180 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000848781  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002062  Zn-finger domain-containing protein  45.45 
 
 		 189 aa  49.7  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2469  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  42.5 
 
 		 190 aa  49.7  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1644  DNA topoisomerase I  53.12 
 
 		 762 aa  48.9  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0028  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  40.48 
 
 		 187 aa  48.9  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3600  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain protein  45.95 
 
 		 180 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0707644  normal  0.764114 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0442  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  48.39 
 
 		 185 aa  48.9  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0826807  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0312  NERD domain protein  31.25 
 
 		 256 aa  48.9  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000707319  normal  0.0160162 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  51.61 
 
 		 845 aa  48.9  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03134  predicted DNA topoisomerase  51.61 
 
 		 180 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103667  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0430  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  51.61 
 
 		 180 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00343806  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3770  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  53.33 
 
 		 180 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.380857  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  40.74 
 
 		 759 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6548  NERD domain-containing protein  26.05 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03085  hypothetical protein  51.61 
 
 		 180 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15137  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  50 
 
 		 831 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5243  nerd domain protein  25 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  50 
 
 		 831 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3742  hypothetical protein  28.07 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4606  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain protein  51.61 
 
 		 180 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00790504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3599  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain protein  53.33 
 
 		 180 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000119283  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  51.52 
 
 		 849 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0665  HRDC domain-containing protein  30 
 
 		 361 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.126203  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3672  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain protein  53.33 
 
 		 180 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3707  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  53.33 
 
 		 180 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0281277  normal  0.131734 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  50 
 
 		 831 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  34.04 
 
 		 686 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  43.59 
 
 		 684 aa  48.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3477  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  51.61 
 
 		 180 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000183076  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0079  DNA topoisomerase  40.48 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.870328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0430  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  51.61 
 
 		 180 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00156622  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3715  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  46.15 
 
 		 180 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  hitchhiker  0.00891628 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0036  topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain-containing protein  38.1 
 
 		 188 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  48.48 
 
 		 1041 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0033  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  38.1 
 
 		 187 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.417367  hitchhiker  0.00409265 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0031  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  38.1 
 
 		 187 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0039  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  38.1 
 
 		 187 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.125507  hitchhiker  0.00000514659 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  50 
 
 		 758 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0043  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  38.1 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804086  normal  0.370158 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2218  DNA topoisomerase type IA Zn finger domain-containing protein  36.84 
 
 		 171 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.19178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>