38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1130 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1130  NERD domain-containing protein  100 
 
 		 199 aa  411  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4033  NERD domain-containing protein  63.98 
 
 		 256 aa  223  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0649  DNA topoisomerase I  57.3 
 
 		 267 aa  218  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2988  NERD domain-containing protein  51.23 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0707223  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2522  DNA-binding NERD domain-containing protein  53.57 
 
 		 269 aa  190  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  49.73 
 
 		 260 aa  185  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2416  DNA-binding protein  52.69 
 
 		 267 aa  175  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00817944  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3613  NERD domain protein  47.1 
 
 		 228 aa  164  9e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646238  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0751  NERD domain protein  49.35 
 
 		 355 aa  161  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.234498  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1615  hypothetical protein  42.69 
 
 		 329 aa  153  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.269609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1847  DNA topoisomerase I  46.45 
 
 		 338 aa  149  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.791369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2012  NERD domain protein  51.43 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1708  hypothetical protein  49.34 
 
 		 259 aa  145  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352686  normal  0.0530118 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4233  NERD domain-containing protein  38.97 
 
 		 207 aa  141  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1607  NERD domain protein  39.77 
 
 		 211 aa  123  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2211  NERD domain-containing protein  38.65 
 
 		 353 aa  115  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  55 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  55 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  55 
 
 		 212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0003  hypothetical protein  55 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1309  NERD domain protein  41.71 
 
 		 262 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1118  NERD domain protein  36.26 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.2197  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07440  hypothetical protein  54.44 
 
 		 111 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316107  normal  0.202998 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3691  NERD domain-containing protein  42.97 
 
 		 259 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.003996  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1610  hypothetical protein  35.43 
 
 		 387 aa  94  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00290154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1889  hypothetical protein  56 
 
 		 139 aa  91.3  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.344159 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0388  hypothetical protein  76 
 
 		 169 aa  77.4  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871251 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1109  hypothetical protein  33.86 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2594  NERD domain protein  32.5 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.173089  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0503  NERD domain-containing protein  25.9 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.180514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1416  NERD domain-containing protein  24.68 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0849  NERD domain protein  34.31 
 
 		 286 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0334  NERD domain-containing protein  25.55 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0988306  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3513  NERD domain-containing protein  28.57 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0711  NERD domain-containing protein  31.3 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3664  hypothetical protein  27.33 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1002  NERD domain-containing protein  32.85 
 
 		 281 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.435611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5568  NERD domain-containing protein  33.85 
 
 		 233 aa  41.6  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.539565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>