22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0873 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0873  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  202  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.889939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1077  topoisomerase DNA binding C4 zinc finger domain-containing protein  43.96 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2432  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  41.67 
 
 		 206 aa  57  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3908  hypothetical protein  35.48 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4251  hypothetical protein  36.9 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00586984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0159  hypothetical protein  43.48 
 
 		 845 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249575  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0637  hypothetical protein  35 
 
 		 189 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6906  hypothetical protein  39.22 
 
 		 285 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0844727  normal  0.78542 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0292  topoisomerase-associated Zn-finger domain-containing protein  31.25 
 
 		 255 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000454917  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  37.5 
 
 		 928 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1922  hypothetical protein  36.76 
 
 		 282 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000370327 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0472  hypothetical protein  33.72 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.517722 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0437  hypothetical protein  33.72 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.813761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4770  hypothetical protein  38.24 
 
 		 282 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4642  hypothetical protein  42.11 
 
 		 176 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5086  hypothetical protein  40.26 
 
 		 316 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000000190539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3054  hypothetical protein  34.62 
 
 		 192 aa  41.6  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0029  hypothetical protein  30.86 
 
 		 188 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531504  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  35.71 
 
 		 932 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  32.47 
 
 		 925 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3331  hypothetical protein  30 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.090397  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1745  hypothetical protein  37.14 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134758  normal  0.207444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>