12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5086 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5086  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  639    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000000190539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2235  hypothetical protein  45.17 
 
 		 327 aa  228  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0152639 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2133  hypothetical protein  37.43 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0327  hypothetical protein  40.74 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4770  hypothetical protein  28.81 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1922  hypothetical protein  31.97 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000370327 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6906  hypothetical protein  26.4 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0844727  normal  0.78542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0159  hypothetical protein  27.93 
 
 		 845 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249575  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1745  hypothetical protein  25.58 
 
 		 181 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134758  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1077  topoisomerase DNA binding C4 zinc finger domain-containing protein  47.17 
 
 		 174 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4642  hypothetical protein  31.46 
 
 		 176 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0873  hypothetical protein  40.79 
 
 		 100 aa  43.5  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.889939 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>