11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1922 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1922  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000370327 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4770  hypothetical protein  80.85 
 
 		 282 aa  484  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6906  hypothetical protein  32.75 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0844727  normal  0.78542 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0327  hypothetical protein  30 
 
 		 278 aa  116  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5086  hypothetical protein  31.97 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000000190539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2235  hypothetical protein  28.66 
 
 		 327 aa  67  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0152639 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0159  hypothetical protein  31.13 
 
 		 845 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249575  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2133  hypothetical protein  27.64 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0873  hypothetical protein  36.76 
 
 		 100 aa  46.2  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.889939 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4642  hypothetical protein  27.18 
 
 		 176 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6063  hypothetical protein  29.46 
 
 		 234 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>