264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0014 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  100 
 
 		 925 aa  1907    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  32.59 
 
 		 916 aa  480  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  32.37 
 
 		 922 aa  476  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  31.83 
 
 		 932 aa  469  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  36.77 
 
 		 914 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  37.05 
 
 		 758 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  30.17 
 
 		 928 aa  403  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0774  ATP-binding protein  35.02 
 
 		 904 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00601607  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.91 
 
 		 1196 aa  144  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  24.83 
 
 		 905 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  25.04 
 
 		 905 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  25.08 
 
 		 905 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  25 
 
 		 907 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  24.59 
 
 		 908 aa  127  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  25.26 
 
 		 900 aa  126  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  24.29 
 
 		 903 aa  125  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.38 
 
 		 1203 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  24.87 
 
 		 905 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  29.39 
 
 		 629 aa  109  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  29.02 
 
 		 905 aa  108  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  23.19 
 
 		 906 aa  105  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  25.65 
 
 		 946 aa  104  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  29.67 
 
 		 975 aa  102  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  31.51 
 
 		 1171 aa  98.2  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1062 aa  96.7  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  26.95 
 
 		 1002 aa  94.4  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  25.65 
 
 		 606 aa  91.7  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  24.13 
 
 		 1523 aa  91.3  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  25.82 
 
 		 902 aa  91.3  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  29.58 
 
 		 958 aa  88.2  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  29.04 
 
 		 1132 aa  87.4  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  28.24 
 
 		 1557 aa  86.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  28.76 
 
 		 759 aa  86.3  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  29.08 
 
 		 769 aa  86.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  28.28 
 
 		 769 aa  85.1  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  27.8 
 
 		 1408 aa  85.1  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  24.76 
 
 		 1157 aa  85.1  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  28.76 
 
 		 759 aa  85.1  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  29.02 
 
 		 585 aa  84.7  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  23.15 
 
 		 1585 aa  84.7  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  23.15 
 
 		 1585 aa  84.3  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  28.76 
 
 		 759 aa  84.3  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  28.76 
 
 		 759 aa  84.3  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  28.76 
 
 		 759 aa  84.3  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  28.43 
 
 		 759 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  29.27 
 
 		 643 aa  84  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  29.01 
 
 		 1178 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  28.87 
 
 		 914 aa  84  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  25.95 
 
 		 633 aa  83.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  29.19 
 
 		 1178 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  28.1 
 
 		 759 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  28.28 
 
 		 759 aa  82.8  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  28.43 
 
 		 759 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  25.64 
 
 		 622 aa  82.8  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  25.64 
 
 		 619 aa  81.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  28.88 
 
 		 1116 aa  81.6  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  24.25 
 
 		 1803 aa  81.3  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  28 
 
 		 1056 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  26.2 
 
 		 1185 aa  80.9  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  25.27 
 
 		 622 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  31.65 
 
 		 1121 aa  80.1  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  23.53 
 
 		 633 aa  79.3  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5347  DNA topoisomerase  24.41 
 
 		 1335 aa  79  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195498 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1126 aa  79  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1724 aa  78.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  23.79 
 
 		 2207 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  27.15 
 
 		 1041 aa  77.8  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  26.59 
 
 		 901 aa  77  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  26.24 
 
 		 934 aa  77  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1176 aa  76.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  25.45 
 
 		 651 aa  75.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  25.47 
 
 		 1280 aa  76.3  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  27.06 
 
 		 655 aa  75.5  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  26.7 
 
 		 2002 aa  75.1  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  28.57 
 
 		 2125 aa  75.1  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  25.45 
 
 		 986 aa  75.1  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  27.41 
 
 		 1250 aa  75.1  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  28.57 
 
 		 2125 aa  75.1  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  24.39 
 
 		 1973 aa  74.3  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  23.7 
 
 		 1575 aa  74.3  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.52 
 
 		 1324 aa  74.3  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  23.96 
 
 		 633 aa  73.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  23.54 
 
 		 2016 aa  73.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  25 
 
 		 650 aa  73.6  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.41 
 
 		 1363 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  20 
 
 		 1108 aa  73.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  27.08 
 
 		 1099 aa  73.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  23.99 
 
 		 686 aa  72.8  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  24.52 
 
 		 633 aa  72.8  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  24.91 
 
 		 650 aa  72.8  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1118 aa  72.8  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  24.93 
 
 		 1163 aa  72  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1440  RAP domain protein  29.82 
 
 		 1081 aa  71.6  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.112962  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  25.43 
 
 		 1190 aa  71.6  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  27.89 
 
 		 1489 aa  71.2  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  30.6 
 
 		 1296 aa  71.6  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  21.85 
 
 		 754 aa  71.2  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  22.96 
 
 		 2204 aa  71.2  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  25 
 
 		 1153 aa  71.2  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  26.92 
 
 		 1653 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>