250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1698 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1059  helicase  65.95 
 
 		 986 aa  1093    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  65.51 
 
 		 902 aa  1129    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  100 
 
 		 901 aa  1811    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  65.29 
 
 		 902 aa  1157    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  63.26 
 
 		 934 aa  1150    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  26.85 
 
 		 1048 aa  251  4e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  27.15 
 
 		 1097 aa  231  4e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  36.19 
 
 		 619 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  35.48 
 
 		 622 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  35.28 
 
 		 622 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  31.51 
 
 		 606 aa  197  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  28.26 
 
 		 635 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  37.78 
 
 		 650 aa  191  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  37.14 
 
 		 650 aa  189  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  28.08 
 
 		 636 aa  187  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  35.06 
 
 		 651 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  34 
 
 		 486 aa  182  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  27.84 
 
 		 636 aa  180  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  30.61 
 
 		 611 aa  180  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  33.57 
 
 		 655 aa  171  4e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  33.1 
 
 		 643 aa  169  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  35.49 
 
 		 754 aa  169  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34.92 
 
 		 752 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  33.48 
 
 		 609 aa  167  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  24.49 
 
 		 1111 aa  161  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  34.57 
 
 		 633 aa  160  8e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  28.86 
 
 		 632 aa  160  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  31.73 
 
 		 466 aa  157  6e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  36.16 
 
 		 633 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  35.42 
 
 		 633 aa  154  5e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  27.09 
 
 		 748 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  31.37 
 
 		 1077 aa  150  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  31.28 
 
 		 1090 aa  147  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  35.42 
 
 		 633 aa  146  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  31.44 
 
 		 686 aa  145  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  29.22 
 
 		 952 aa  145  5e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  33.79 
 
 		 479 aa  145  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  29.98 
 
 		 797 aa  143  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  29.61 
 
 		 715 aa  140  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  33.33 
 
 		 629 aa  125  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  33.33 
 
 		 464 aa  125  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  31.81 
 
 		 388 aa  123  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  33.22 
 
 		 716 aa  122  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  28.37 
 
 		 1999 aa  115  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  26.67 
 
 		 1099 aa  112  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  33.51 
 
 		 1121 aa  112  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  31.49 
 
 		 1139 aa  110  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  25 
 
 		 1116 aa  107  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  33.87 
 
 		 941 aa  106  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  30.45 
 
 		 1082 aa  105  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  29.57 
 
 		 1255 aa  103  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  30.51 
 
 		 1143 aa  103  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1275 aa  101  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  30.96 
 
 		 2245 aa  100  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  32.59 
 
 		 268 aa  99.8  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  30.17 
 
 		 1143 aa  97.8  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  30.17 
 
 		 1143 aa  97.8  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  28.54 
 
 		 1271 aa  97.8  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1126 aa  97.8  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  29.04 
 
 		 1151 aa  97.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  31.05 
 
 		 1189 aa  96.3  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  31.2 
 
 		 585 aa  96.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  29.87 
 
 		 795 aa  95.5  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  32.89 
 
 		 1018 aa  95.1  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  29.11 
 
 		 1408 aa  94.7  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1118 aa  94.7  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  29.02 
 
 		 1153 aa  94.7  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  28.78 
 
 		 659 aa  94.4  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1247 aa  94  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  30.22 
 
 		 283 aa  92.8  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  28.47 
 
 		 1163 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  23.04 
 
 		 1172 aa  92.8  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  28.4 
 
 		 521 aa  92.4  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  32.87 
 
 		 553 aa  92  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  32.87 
 
 		 553 aa  92  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  28.92 
 
 		 1198 aa  91.7  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  28.95 
 
 		 1196 aa  90.5  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  30.48 
 
 		 1228 aa  89.4  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  28.1 
 
 		 922 aa  89  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  23.48 
 
 		 759 aa  88.6  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  29.82 
 
 		 928 aa  87  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  32.6 
 
 		 237 aa  87.4  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  27.84 
 
 		 916 aa  86.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  23.27 
 
 		 769 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  27.98 
 
 		 1250 aa  85.5  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  23.48 
 
 		 759 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  23.27 
 
 		 759 aa  84.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  23.27 
 
 		 759 aa  84.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1215 aa  84  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  22.9 
 
 		 759 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.91 
 
 		 1428 aa  83.2  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  23.06 
 
 		 759 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0774  ATP-binding protein  31.67 
 
 		 904 aa  82.8  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00601607  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  28.47 
 
 		 932 aa  82.4  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  26.04 
 
 		 1284 aa  81.6  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  28.49 
 
 		 1270 aa  81.6  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  23.32 
 
 		 759 aa  81.6  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  24.42 
 
 		 769 aa  81.3  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  23.57 
 
 		 2310 aa  80.9  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  26.73 
 
 		 1653 aa  80.9  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>