158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3025 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  100 
 
 		 1176 aa  2432    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  30.64 
 
 		 1171 aa  442  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  31.21 
 
 		 1178 aa  431  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  30.39 
 
 		 1190 aa  432  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  31.49 
 
 		 975 aa  429  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  30.05 
 
 		 1178 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5347  DNA topoisomerase  28.72 
 
 		 1335 aa  306  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195498 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  40.38 
 
 		 914 aa  277  7e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  34.8 
 
 		 1062 aa  208  4e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  35.05 
 
 		 1185 aa  206  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  24.43 
 
 		 1132 aa  106  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  28.31 
 
 		 1056 aa  99.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  24.43 
 
 		 1094 aa  99.4  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  27.61 
 
 		 1157 aa  92.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1220 aa  88.6  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  27.04 
 
 		 1087 aa  87.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.14 
 
 		 1196 aa  85.5  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3992  hypothetical protein  22.11 
 
 		 1126 aa  81.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4016  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1100 aa  80.9  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00472  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1049 aa  79  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0358017  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  26.03 
 
 		 958 aa  78.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1899  hypothetical protein  27.67 
 
 		 549 aa  78.6  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.571929  hitchhiker  0.00194399 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1889  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1092 aa  78.2  0.0000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.04 
 
 		 1203 aa  77  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1989  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.88 
 
 		 605 aa  76.3  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0620689  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1784  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.67 
 
 		 1164 aa  76.3  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0724834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  27.09 
 
 		 925 aa  76.3  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  24.61 
 
 		 629 aa  75.5  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  28.97 
 
 		 932 aa  75.1  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2785  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.77 
 
 		 1477 aa  74.7  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.464639 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4321  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1126 aa  74.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  22.7 
 
 		 1002 aa  71.2  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  22.39 
 
 		 906 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  26.9 
 
 		 1490 aa  69.3  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.47 
 
 		 1363 aa  69.3  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3443  superfamily I DNA/RNA helicase  26.14 
 
 		 1061 aa  68.6  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  26.09 
 
 		 916 aa  68.2  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  24.82 
 
 		 903 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  25.66 
 
 		 922 aa  67.4  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  23.23 
 
 		 759 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  23.45 
 
 		 759 aa  66.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  25 
 
 		 946 aa  66.2  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  27.09 
 
 		 1189 aa  65.5  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  23.45 
 
 		 759 aa  65.1  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  23.45 
 
 		 759 aa  65.1  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  21.96 
 
 		 759 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  23.23 
 
 		 759 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  23.01 
 
 		 759 aa  63.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  22.1 
 
 		 1801 aa  63.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  23.62 
 
 		 769 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  25.23 
 
 		 759 aa  63.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  23.01 
 
 		 769 aa  63.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1722 aa  62.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1247 aa  62.8  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  24.37 
 
 		 2045 aa  62.8  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  23.98 
 
 		 1090 aa  62.4  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  24.53 
 
 		 1585 aa  62.4  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  23.24 
 
 		 1980 aa  62.4  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  25.36 
 
 		 635 aa  62.4  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  22.79 
 
 		 759 aa  62  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  24.53 
 
 		 1585 aa  62  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  28.48 
 
 		 928 aa  62  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  23.08 
 
 		 2207 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  26.37 
 
 		 1523 aa  60.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  25.75 
 
 		 464 aa  60.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  24.55 
 
 		 1077 aa  59.7  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  22.99 
 
 		 1803 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  23.19 
 
 		 2204 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1018 aa  58.5  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.8 
 
 		 752 aa  58.5  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  23.12 
 
 		 1593 aa  58.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  24.53 
 
 		 2222 aa  57  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  25.66 
 
 		 1620 aa  57  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  30.37 
 
 		 758 aa  56.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  21.58 
 
 		 1888 aa  56.2  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  25.57 
 
 		 1328 aa  56.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  25.44 
 
 		 1099 aa  56.6  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  25.68 
 
 		 1649 aa  56.2  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  24.14 
 
 		 632 aa  56.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  24.93 
 
 		 2013 aa  55.8  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  22.37 
 
 		 2759 aa  55.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  24.23 
 
 		 1950 aa  55.5  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  26.6 
 
 		 1790 aa  55.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1904 aa  54.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  25 
 
 		 1296 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  25.08 
 
 		 1151 aa  54.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  23.78 
 
 		 1991 aa  53.5  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  22.42 
 
 		 908 aa  53.5  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  23.05 
 
 		 2016 aa  53.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  24.64 
 
 		 659 aa  53.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  36.7 
 
 		 748 aa  53.1  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  22.73 
 
 		 1983 aa  53.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  24.76 
 
 		 914 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  24.68 
 
 		 1867 aa  52.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  22.7 
 
 		 900 aa  52.8  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  23.16 
 
 		 1041 aa  52.4  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  23.6 
 
 		 1754 aa  52  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  25.12 
 
 		 1489 aa  52.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  23.93 
 
 		 1958 aa  52.4  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  24.29 
 
 		 1367 aa  51.6  0.00008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>