102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3984 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  100 
 
 		 1087 aa  2222    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  71.48 
 
 		 1094 aa  1593    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  33.95 
 
 		 1056 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  30.69 
 
 		 1220 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4016  hypothetical protein  39.52 
 
 		 1100 aa  273  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2785  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.96 
 
 		 1477 aa  259  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.464639 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1889  hypothetical protein  41.86 
 
 		 1092 aa  250  1e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1784  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  39.47 
 
 		 1164 aa  238  6e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0724834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3992  hypothetical protein  38.1 
 
 		 1126 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1989  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34.17 
 
 		 605 aa  230  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0620689  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00472  hypothetical protein  35.11 
 
 		 1049 aa  229  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0358017  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3443  superfamily I DNA/RNA helicase  37.8 
 
 		 1061 aa  228  7e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1899  hypothetical protein  34.07 
 
 		 549 aa  226  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.571929  hitchhiker  0.00194399 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4321  hypothetical protein  33.79 
 
 		 1126 aa  225  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  37.5 
 
 		 1157 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  27.76 
 
 		 1132 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1898  hypothetical protein  28.15 
 
 		 498 aa  107  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170657 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  28.42 
 
 		 958 aa  95.9  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23060  hypothetical protein  46.43 
 
 		 178 aa  95.5  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 		 1196 aa  92.8  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  27.21 
 
 		 1185 aa  89.4  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1176 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.29 
 
 		 1203 aa  86.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  23.67 
 
 		 914 aa  85.1  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  26.53 
 
 		 1171 aa  79.7  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2810  hypothetical protein  41.6 
 
 		 985 aa  79  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157063  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  23.18 
 
 		 1002 aa  78.6  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0412  hypothetical protein  33.53 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.629297  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  23.89 
 
 		 1178 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  26.64 
 
 		 946 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  23.75 
 
 		 975 aa  77  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  27.18 
 
 		 1620 aa  73.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  25.84 
 
 		 1190 aa  73.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5347  DNA topoisomerase  25.5 
 
 		 1335 aa  72  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195498 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  23.88 
 
 		 1178 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  23.9 
 
 		 932 aa  68.9  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  25.42 
 
 		 934 aa  68.6  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1062 aa  67.8  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  27.47 
 
 		 629 aa  65.5  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.12 
 
 		 752 aa  65.5  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  24.67 
 
 		 902 aa  65.5  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  25.45 
 
 		 922 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  23.34 
 
 		 1099 aa  63.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  29.12 
 
 		 464 aa  63.2  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  25.67 
 
 		 986 aa  62.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  26.57 
 
 		 619 aa  62  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  26.67 
 
 		 901 aa  62  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  27.24 
 
 		 928 aa  60.8  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  25.66 
 
 		 902 aa  60.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  24.71 
 
 		 925 aa  59.7  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  30.91 
 
 		 606 aa  58.9  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  25.18 
 
 		 916 aa  58.5  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  25.83 
 
 		 622 aa  57.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  25.26 
 
 		 914 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  24.21 
 
 		 754 aa  57  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  25.83 
 
 		 622 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  22.57 
 
 		 633 aa  55.8  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  24.39 
 
 		 758 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  23.34 
 
 		 797 aa  54.7  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  24.39 
 
 		 1097 aa  52.8  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  21.43 
 
 		 633 aa  52.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  23.08 
 
 		 650 aa  52.4  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  23.82 
 
 		 1038 aa  52.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  21.29 
 
 		 643 aa  52  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  24.92 
 
 		 715 aa  51.6  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  26.62 
 
 		 1280 aa  51.6  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  22.69 
 
 		 650 aa  51.6  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  24.48 
 
 		 1629 aa  51.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  21.05 
 
 		 633 aa  51.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  25.36 
 
 		 609 aa  50.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0634  superfamily I DNA/RNA helicase  21.21 
 
 		 1584 aa  51.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  23.34 
 
 		 908 aa  50.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  20.42 
 
 		 633 aa  50.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  25.36 
 
 		 1651 aa  49.7  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1126 aa  49.3  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.35 
 
 		 1363 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1116 aa  49.3  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  23.47 
 
 		 1090 aa  48.9  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  28.84 
 
 		 651 aa  48.9  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  30.11 
 
 		 1722 aa  48.9  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  29.3 
 
 		 1215 aa  48.5  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  23.34 
 
 		 479 aa  48.9  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  28.48 
 
 		 1048 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  22.87 
 
 		 748 aa  47.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  20.73 
 
 		 611 aa  47.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  29.82 
 
 		 297 aa  47.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  26.19 
 
 		 655 aa  47.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  36.49 
 
 		 2045 aa  47.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1247 aa  47  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  24.75 
 
 		 585 aa  46.2  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  32.04 
 
 		 716 aa  46.6  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  26.18 
 
 		 1228 aa  46.2  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  25.93 
 
 		 466 aa  45.8  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  23.4 
 
 		 1367 aa  46.2  0.004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  19.05 
 
 		 1284 aa  46.2  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  23.88 
 
 		 553 aa  45.8  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  23.88 
 
 		 553 aa  45.8  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  23.02 
 
 		 635 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  22.18 
 
 		 1077 aa  45.4  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  25.45 
 
 		 1980 aa  45.4  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>