23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1898 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1898  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  1025    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170657 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4016  hypothetical protein  40.53 
 
 		 1100 aa  346  5e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3992  hypothetical protein  32.81 
 
 		 1126 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4321  hypothetical protein  32.42 
 
 		 1126 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1784  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  31.5 
 
 		 1164 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0724834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00472  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1049 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0358017  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  39.71 
 
 		 1220 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  34.8 
 
 		 1157 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  25.59 
 
 		 1056 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  34.21 
 
 		 1094 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  28.15 
 
 		 1087 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1889  hypothetical protein  34.62 
 
 		 1092 aa  95.9  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2785  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  42.96 
 
 		 1477 aa  90.5  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.464639 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3443  superfamily I DNA/RNA helicase  34.33 
 
 		 1061 aa  83.2  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0412  hypothetical protein  35.66 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.629297  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23060  hypothetical protein  45 
 
 		 178 aa  77.8  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  36.84 
 
 		 914 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  63.33 
 
 		 975 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0088  ABC transporter related  29.46 
 
 		 373 aa  47  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  25.9 
 
 		 369 aa  44.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1805  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.03 
 
 		 307 aa  44.7  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00130612  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  29.25 
 
 		 368 aa  43.9  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  34.69 
 
 		 633 aa  43.9  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>