74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3992 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1784  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  38.8 
 
 		 1164 aa  733    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0724834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4321  hypothetical protein  82.86 
 
 		 1126 aa  1871    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3992  hypothetical protein  100 
 
 		 1126 aa  2293    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4016  hypothetical protein  36.49 
 
 		 1100 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00472  hypothetical protein  34.27 
 
 		 1049 aa  463  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0358017  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  32.06 
 
 		 1094 aa  353  8.999999999999999e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  31.8 
 
 		 1157 aa  344  4e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1889  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1092 aa  312  2e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1899  hypothetical protein  43.18 
 
 		 549 aa  310  9e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.571929  hitchhiker  0.00194399 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1989  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  33.8 
 
 		 605 aa  271  5.9999999999999995e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0620689  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  38.1 
 
 		 1056 aa  257  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1898  hypothetical protein  32.81 
 
 		 498 aa  245  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170657 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  38.52 
 
 		 1087 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  38.19 
 
 		 1220 aa  234  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2785  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  33.58 
 
 		 1477 aa  215  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.464639 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3443  superfamily I DNA/RNA helicase  34.67 
 
 		 1061 aa  207  7e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  22.45 
 
 		 1132 aa  108  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1176 aa  92.4  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23060  hypothetical protein  47.71 
 
 		 178 aa  90.1  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.18 
 
 		 1196 aa  84.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0412  hypothetical protein  27.64 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.629297  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  24.93 
 
 		 975 aa  80.1  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  25.67 
 
 		 1185 aa  78.6  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  27.78 
 
 		 1171 aa  78.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  28.4 
 
 		 946 aa  74.7  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  24.83 
 
 		 632 aa  74.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 636 aa  73.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  24.85 
 
 		 1178 aa  73.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  23.48 
 
 		 1620 aa  72  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2810  hypothetical protein  26.83 
 
 		 985 aa  71.6  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157063  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5347  DNA topoisomerase  24.33 
 
 		 1335 aa  69.3  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195498 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  24.7 
 
 		 1190 aa  68.9  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  22.62 
 
 		 1178 aa  68.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.01 
 
 		 1203 aa  67  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  23.36 
 
 		 958 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  23.3 
 
 		 914 aa  66.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  20.65 
 
 		 1002 aa  65.1  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  23.05 
 
 		 635 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1062 aa  61.2  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  23.19 
 
 		 903 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  21.89 
 
 		 925 aa  55.5  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  23.03 
 
 		 636 aa  53.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  23.3 
 
 		 906 aa  52.8  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  24.39 
 
 		 1629 aa  52.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  21.85 
 
 		 932 aa  51.6  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  22.95 
 
 		 1077 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  23.37 
 
 		 928 aa  49.7  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  25 
 
 		 1652 aa  50.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25 
 
 		 1363 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  23.51 
 
 		 609 aa  49.3  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  22.49 
 
 		 629 aa  49.3  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  28.47 
 
 		 622 aa  49.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  23.97 
 
 		 914 aa  48.5  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  28.23 
 
 		 619 aa  48.1  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  21.5 
 
 		 1090 aa  48.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1018 aa  47.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  28.23 
 
 		 622 aa  47.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  22.48 
 
 		 922 aa  46.6  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  20.82 
 
 		 1904 aa  47.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  22.67 
 
 		 2096 aa  46.6  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  26 
 
 		 2123 aa  46.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  21.41 
 
 		 1403 aa  46.6  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  26.79 
 
 		 1697 aa  46.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  35.09 
 
 		 1722 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  26.83 
 
 		 651 aa  45.8  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.24 
 
 		 752 aa  45.8  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  28.17 
 
 		 1622 aa  45.8  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  24.09 
 
 		 606 aa  45.8  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  44.19 
 
 		 1888 aa  45.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  24.8 
 
 		 1489 aa  45.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  22.81 
 
 		 1585 aa  45.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  22.62 
 
 		 1175 aa  45.1  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  22.81 
 
 		 1585 aa  45.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  37.5 
 
 		 1589 aa  45.1  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>