259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4335 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  100 
 
 
752 aa  1521    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  37.92 
 
 
619 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  39.03 
 
 
622 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  38.34 
 
 
622 aa  190  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  30.82 
 
 
611 aa  182  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  36.22 
 
 
902 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  37.08 
 
 
934 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  29.9 
 
 
716 aa  169  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  35.28 
 
 
651 aa  168  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  31.61 
 
 
636 aa  167  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  28.31 
 
 
952 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  31.99 
 
 
632 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  31.9 
 
 
686 aa  164  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  34.24 
 
 
901 aa  164  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  33.93 
 
 
986 aa  157  6e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  37.91 
 
 
643 aa  157  9e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  31.74 
 
 
464 aa  154  5.9999999999999996e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  29.75 
 
 
635 aa  153  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  33.01 
 
 
1077 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  37.82 
 
 
754 aa  152  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  32.91 
 
 
655 aa  151  4e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  37.15 
 
 
650 aa  151  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  37.5 
 
 
650 aa  150  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  30.13 
 
 
636 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  32.78 
 
 
1090 aa  147  6e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  39.21 
 
 
609 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  30.97 
 
 
797 aa  145  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  32.05 
 
 
466 aa  145  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  34.02 
 
 
902 aa  144  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  34.72 
 
 
479 aa  142  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  28.9 
 
 
1097 aa  136  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  32.75 
 
 
748 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  36.5 
 
 
633 aa  134  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  34.3 
 
 
633 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  30.1 
 
 
606 aa  124  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  35.64 
 
 
941 aa  124  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  38.49 
 
 
268 aa  122  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  34.31 
 
 
633 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  32.99 
 
 
388 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  27.58 
 
 
1048 aa  120  9e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  28.99 
 
 
486 aa  118  5e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  34.44 
 
 
633 aa  117  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  26.89 
 
 
585 aa  114  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  30.63 
 
 
715 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  28.27 
 
 
1038 aa  110  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  31.34 
 
 
629 aa  110  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  29.39 
 
 
1999 aa  110  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  29.01 
 
 
1653 aa  109  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  33.96 
 
 
315 aa  109  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  30.22 
 
 
521 aa  105  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  28.93 
 
 
1099 aa  104  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  26.75 
 
 
1126 aa  104  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  30.26 
 
 
795 aa  103  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  32.56 
 
 
553 aa  103  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  32.56 
 
 
553 aa  103  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  32.01 
 
 
2245 aa  102  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  29.77 
 
 
1270 aa  101  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  29.21 
 
 
1118 aa  100  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  28.68 
 
 
1121 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  28.09 
 
 
1116 aa  99  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  25.06 
 
 
1172 aa  97.8  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  32.34 
 
 
1018 aa  97.4  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  28.61 
 
 
1082 aa  96.3  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  28.07 
 
 
1153 aa  95.1  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  27.78 
 
 
1111 aa  94.4  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  29.35 
 
 
1620 aa  94  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  28.96 
 
 
1408 aa  93.6  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  29.12 
 
 
1143 aa  94  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  29.09 
 
 
1139 aa  94  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  27.36 
 
 
1284 aa  92.8  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  26.49 
 
 
759 aa  92.4  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  32.43 
 
 
1189 aa  90.9  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  29.12 
 
 
1143 aa  90.9  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  29.12 
 
 
1143 aa  90.9  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  25.54 
 
 
759 aa  90.9  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  26.25 
 
 
759 aa  90.5  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  26.25 
 
 
759 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  33.48 
 
 
237 aa  89.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  26.01 
 
 
759 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  26.01 
 
 
759 aa  89.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  26.01 
 
 
759 aa  89.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  25.6 
 
 
769 aa  89.7  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  29.7 
 
 
1108 aa  89.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  26.25 
 
 
759 aa  89  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  25.3 
 
 
769 aa  88.6  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  26.01 
 
 
759 aa  87.8  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  30.74 
 
 
1651 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  28.22 
 
 
1151 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  26.86 
 
 
1247 aa  84.7  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  28.53 
 
 
1198 aa  84.3  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  29.58 
 
 
1185 aa  84.3  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  25.67 
 
 
1280 aa  83.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  29.92 
 
 
932 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  28.74 
 
 
283 aa  82.4  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  27.37 
 
 
1163 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  26.43 
 
 
1250 aa  81.6  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  29.02 
 
 
1228 aa  81.3  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.262679 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  27 
 
 
2310 aa  80.5  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  26.18 
 
 
1002 aa  80.1  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  25.68 
 
 
1271 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.18518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>