78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4321 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4321  hypothetical protein  100 
 
 		 1126 aa  2305    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3992  hypothetical protein  82.86 
 
 		 1126 aa  1862    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1784  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  38.43 
 
 		 1164 aa  727    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0724834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4016  hypothetical protein  35.43 
 
 		 1100 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  31.93 
 
 		 1056 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  29.06 
 
 		 1094 aa  350  6e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  30.65 
 
 		 1087 aa  325  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1899  hypothetical protein  44.36 
 
 		 549 aa  322  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.571929  hitchhiker  0.00194399 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1889  hypothetical protein  30.59 
 
 		 1092 aa  319  2e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00472  hypothetical protein  40 
 
 		 1049 aa  272  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0358017  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1989  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34 
 
 		 605 aa  270  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0620689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  39.7 
 
 		 1157 aa  248  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  38.15 
 
 		 1220 aa  237  7e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1898  hypothetical protein  32.42 
 
 		 498 aa  237  8e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170657 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2785  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34.86 
 
 		 1477 aa  218  7e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.464639 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3443  superfamily I DNA/RNA helicase  35.25 
 
 		 1061 aa  209  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  25.1 
 
 		 1132 aa  97.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  28.99 
 
 		 1171 aa  87.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.93 
 
 		 1196 aa  87.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1176 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  26 
 
 		 1185 aa  83.2  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  24.92 
 
 		 636 aa  81.3  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23060  hypothetical protein  43.12 
 
 		 178 aa  80.9  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  29.28 
 
 		 946 aa  80.9  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  23.5 
 
 		 975 aa  79  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  23.4 
 
 		 1178 aa  78.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  23.81 
 
 		 1178 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  27.22 
 
 		 632 aa  75.5  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0412  hypothetical protein  29.79 
 
 		 308 aa  73.6  0.00000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.629297  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  23.36 
 
 		 958 aa  71.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  23.62 
 
 		 1620 aa  71.6  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5347  DNA topoisomerase  25.66 
 
 		 1335 aa  70.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195498 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  24.38 
 
 		 1190 aa  70.9  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1062 aa  67.8  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  21.59 
 
 		 1002 aa  67.8  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  22.41 
 
 		 635 aa  65.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  22.99 
 
 		 914 aa  65.5  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.95 
 
 		 1203 aa  64.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  20.6 
 
 		 925 aa  61.2  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  24.48 
 
 		 906 aa  60.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  22.22 
 
 		 636 aa  60.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2810  hypothetical protein  45.45 
 
 		 985 aa  58.2  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157063  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  23.78 
 
 		 932 aa  57  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  22.83 
 
 		 903 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  23.84 
 
 		 928 aa  55.5  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  24.76 
 
 		 922 aa  55.1  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  24.78 
 
 		 1284 aa  55.1  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  23 
 
 		 1099 aa  53.5  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  24.12 
 
 		 629 aa  52.4  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1247 aa  52  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1018 aa  52  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  27.99 
 
 		 622 aa  51.6  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  27.4 
 
 		 619 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  24.91 
 
 		 914 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  23.82 
 
 		 1585 aa  50.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  23.82 
 
 		 1585 aa  50.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  24.61 
 
 		 916 aa  50.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  27.74 
 
 		 622 aa  50.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  23.37 
 
 		 754 aa  49.3  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.95 
 
 		 752 aa  49.3  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  23.33 
 
 		 1629 aa  49.3  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  24.26 
 
 		 908 aa  48.9  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  22.11 
 
 		 585 aa  48.9  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  22.85 
 
 		 606 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  21.41 
 
 		 1403 aa  48.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  23.55 
 
 		 902 aa  48.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  24.39 
 
 		 986 aa  47.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  25.35 
 
 		 651 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  22.35 
 
 		 2096 aa  46.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  23.4 
 
 		 902 aa  46.2  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  20.89 
 
 		 1090 aa  46.2  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  42.22 
 
 		 1722 aa  46.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  39.39 
 
 		 1980 aa  46.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  23 
 
 		 1077 aa  45.8  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  31.87 
 
 		 2123 aa  45.8  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  24.19 
 
 		 905 aa  45.4  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  20.18 
 
 		 1904 aa  45.1  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25 
 
 		 1324 aa  44.7  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>