202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2916 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  63.92 
 
 
902 aa  1153    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  80.94 
 
 
986 aa  1429    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  65.62 
 
 
901 aa  1140    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  65.89 
 
 
934 aa  1177    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  100 
 
 
902 aa  1811    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  25.41 
 
 
1048 aa  243  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  31.08 
 
 
606 aa  209  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  33.41 
 
 
1097 aa  204  5e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  35.24 
 
 
619 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  35.21 
 
 
622 aa  198  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  35.21 
 
 
622 aa  197  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  34.93 
 
 
651 aa  189  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  28.68 
 
 
636 aa  185  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  29.16 
 
 
636 aa  180  8e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  29.04 
 
 
611 aa  179  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  36.99 
 
 
650 aa  178  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  33.01 
 
 
655 aa  176  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  34.14 
 
 
754 aa  175  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  36.3 
 
 
650 aa  174  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  34.39 
 
 
643 aa  174  7.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  34.55 
 
 
633 aa  174  7.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  28.35 
 
 
635 aa  173  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  30.81 
 
 
486 aa  171  7e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  28.94 
 
 
632 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  33.46 
 
 
633 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  34.55 
 
 
479 aa  160  7e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  33.46 
 
 
633 aa  160  8e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  32.72 
 
 
633 aa  159  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  30.53 
 
 
686 aa  158  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  30.95 
 
 
1077 aa  157  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  29.56 
 
 
629 aa  155  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  30.09 
 
 
609 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34.18 
 
 
752 aa  151  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  31.13 
 
 
466 aa  150  9e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  29.91 
 
 
1090 aa  147  8.000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  28.44 
 
 
797 aa  144  7e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  22.99 
 
 
1111 aa  144  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  31.21 
 
 
748 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  32.73 
 
 
388 aa  131  6e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  28.41 
 
 
715 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  27.17 
 
 
952 aa  127  9e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  29.65 
 
 
1082 aa  125  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  25.36 
 
 
1116 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  31.96 
 
 
716 aa  122  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  33.01 
 
 
464 aa  122  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  26.27 
 
 
1126 aa  119  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  26.05 
 
 
1118 aa  117  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  30.61 
 
 
1196 aa  117  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  27.09 
 
 
585 aa  115  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  35.48 
 
 
268 aa  115  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  34.53 
 
 
941 aa  109  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  28.53 
 
 
1250 aa  108  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  25.23 
 
 
759 aa  108  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  22.99 
 
 
1172 aa  108  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  30.71 
 
 
1408 aa  107  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  29.48 
 
 
1427 aa  107  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  29.72 
 
 
1215 aa  107  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  25.35 
 
 
759 aa  106  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  31.15 
 
 
1121 aa  106  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  24.94 
 
 
759 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  24.94 
 
 
759 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  25.58 
 
 
769 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  25.72 
 
 
769 aa  105  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  25.12 
 
 
759 aa  105  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  28.57 
 
 
1999 aa  104  6e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  25.12 
 
 
759 aa  104  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  25.12 
 
 
759 aa  104  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  27.3 
 
 
1247 aa  104  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  30.43 
 
 
1189 aa  103  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  29.2 
 
 
1139 aa  102  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.35 
 
 
1428 aa  102  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  27.76 
 
 
521 aa  102  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  28.04 
 
 
1153 aa  102  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  28.38 
 
 
1099 aa  101  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  29.89 
 
 
2245 aa  101  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  30.27 
 
 
283 aa  100  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  24.88 
 
 
759 aa  101  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  28.34 
 
 
1215 aa  100  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  28.69 
 
 
1143 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  33.97 
 
 
1018 aa  99.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  28.29 
 
 
1271 aa  99  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  29.46 
 
 
1143 aa  97.8  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  29.46 
 
 
1143 aa  97.8  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  27.99 
 
 
1151 aa  97.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  27.74 
 
 
1270 aa  97.4  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  28.96 
 
 
1228 aa  96.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  25.62 
 
 
1255 aa  95.5  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  27.64 
 
 
1163 aa  94  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  27.43 
 
 
1653 aa  93.2  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  31.85 
 
 
553 aa  92.8  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  31.85 
 
 
553 aa  92.8  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  28.12 
 
 
795 aa  91.7  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  28.57 
 
 
659 aa  91.3  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  25 
 
 
1275 aa  90.9  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  27.94 
 
 
1198 aa  90.9  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  25.59 
 
 
1038 aa  89.7  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  29.69 
 
 
1175 aa  89.4  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.26 
 
 
1324 aa  87  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  23.48 
 
 
1284 aa  86.3  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  25.94 
 
 
1403 aa  85.1  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>