264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3080 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  71.5 
 
 		 636 aa  954    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  74.96 
 
 		 635 aa  1014    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  73.93 
 
 		 632 aa  994    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 636 aa  1318    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  42.6 
 
 		 611 aa  487  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  36.08 
 
 		 651 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  35.99 
 
 		 619 aa  343  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  37.55 
 
 		 622 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  35.88 
 
 		 622 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  35.51 
 
 		 609 aa  288  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  31.61 
 
 		 754 aa  287  5e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  31.51 
 
 		 655 aa  278  2e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  31.37 
 
 		 650 aa  273  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  31.37 
 
 		 650 aa  271  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  31.05 
 
 		 633 aa  258  3e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  31.45 
 
 		 633 aa  256  7e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  30.62 
 
 		 643 aa  253  1e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  33.53 
 
 		 686 aa  251  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  28.77 
 
 		 748 aa  246  6.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  30.19 
 
 		 633 aa  244  3e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  32.09 
 
 		 716 aa  242  2e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  29.41 
 
 		 633 aa  231  4e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  30.69 
 
 		 1090 aa  226  7e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  32.68 
 
 		 797 aa  224  4e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  32.62 
 
 		 1077 aa  219  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  33.12 
 
 		 952 aa  210  7e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  30.18 
 
 		 1097 aa  209  1e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  32.98 
 
 		 466 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  29.25 
 
 		 902 aa  201  5e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  30.23 
 
 		 464 aa  192  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  30.3 
 
 		 1048 aa  190  8e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  31 
 
 		 2245 aa  189  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  29.19 
 
 		 986 aa  180  7e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  28.19 
 
 		 901 aa  177  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  27.32 
 
 		 1999 aa  173  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  30.63 
 
 		 902 aa  172  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  31.17 
 
 		 479 aa  169  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  29.68 
 
 		 1099 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  28.17 
 
 		 486 aa  151  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  28.99 
 
 		 553 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  28.99 
 
 		 553 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  30.54 
 
 		 752 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  28.75 
 
 		 715 aa  147  8.000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  33.22 
 
 		 388 aa  140  7.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  26.54 
 
 		 795 aa  140  8.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  25.97 
 
 		 606 aa  137  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  30.16 
 
 		 934 aa  136  9e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  33.81 
 
 		 268 aa  130  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  27.92 
 
 		 629 aa  128  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  30.6 
 
 		 941 aa  124  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  27.05 
 
 		 585 aa  123  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  29.38 
 
 		 1189 aa  122  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  27.37 
 
 		 521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  26.25 
 
 		 1038 aa  111  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  32.02 
 
 		 237 aa  110  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  29.97 
 
 		 1653 aa  109  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1018 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  25.74 
 
 		 769 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  29.97 
 
 		 315 aa  105  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  29.64 
 
 		 1651 aa  101  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  23.72 
 
 		 1111 aa  97.4  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  29.53 
 
 		 283 aa  97.4  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  24.07 
 
 		 759 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  25.28 
 
 		 769 aa  95.5  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  24.8 
 
 		 759 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  24.8 
 
 		 759 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  26.3 
 
 		 1151 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  24.6 
 
 		 759 aa  94.4  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  24.71 
 
 		 759 aa  94.4  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  24.68 
 
 		 759 aa  94  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  24.89 
 
 		 759 aa  94  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  24.68 
 
 		 759 aa  93.6  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  24.6 
 
 		 759 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  24.52 
 
 		 1585 aa  91.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  24.52 
 
 		 1585 aa  91.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  23.2 
 
 		 1175 aa  91.3  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  26.43 
 
 		 1620 aa  90.9  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  26.6 
 
 		 297 aa  90.1  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  25.71 
 
 		 1427 aa  89  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  25.47 
 
 		 1108 aa  89.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  25.29 
 
 		 1270 aa  87.8  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  30.43 
 
 		 1082 aa  87.8  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  23.67 
 
 		 1284 aa  86.7  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  24.78 
 
 		 2310 aa  86.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1116 aa  85.9  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1139 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  23.53 
 
 		 1250 aa  84.7  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1118 aa  84.7  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  24.36 
 
 		 1408 aa  84  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.48 
 
 		 1428 aa  83.6  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  31.25 
 
 		 1212 aa  82  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  24.69 
 
 		 1261 aa  82  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  25.95 
 
 		 1427 aa  82  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1215 aa  81.6  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  28.03 
 
 		 1163 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1172 aa  80.9  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  26.47 
 
 		 1126 aa  80.9  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  24.6 
 
 		 1002 aa  80.9  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1126 aa  80.5  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  23.73 
 
 		 2045 aa  80.5  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>