More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5347 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5347  DNA topoisomerase  100 
 
 		 1335 aa  2749    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195498 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  28.88 
 
 		 1176 aa  308  6e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  29.48 
 
 		 1171 aa  270  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  29.03 
 
 		 1178 aa  259  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  28.57 
 
 		 1178 aa  252  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  33.68 
 
 		 1190 aa  178  6e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  31.84 
 
 		 975 aa  178  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  32.22 
 
 		 914 aa  174  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1062 aa  155  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  28.96 
 
 		 1185 aa  142  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  29.55 
 
 		 932 aa  111  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  28.52 
 
 		 958 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2785  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.56 
 
 		 1477 aa  94.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.464639 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  23.62 
 
 		 1002 aa  90.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  28.27 
 
 		 916 aa  89.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  28.27 
 
 		 922 aa  88.6  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  26.21 
 
 		 1132 aa  87  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  27.05 
 
 		 1056 aa  82.4  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  27.57 
 
 		 1094 aa  81.6  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41359  predicted protein  27 
 
 		 840 aa  81.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  24.41 
 
 		 925 aa  79  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  26.6 
 
 		 797 aa  77.8  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4545  DNA topoisomerase I  27.33 
 
 		 926 aa  77.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2001  DNA topoisomerase I  26.93 
 
 		 964 aa  77  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0695  DNA topoisomerase I  26.49 
 
 		 678 aa  77  0.000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  25.35 
 
 		 690 aa  76.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1013  DNA topoisomerase I, putative  26.37 
 
 		 705 aa  76.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4016  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1100 aa  76.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1955  DNA topoisomerase I  29.19 
 
 		 784 aa  76.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.3591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0323  DNA topoisomerase I  28.47 
 
 		 820 aa  75.9  0.000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0218677  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  23.57 
 
 		 743 aa  75.5  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0750  DNA topoisomerase I  27.46 
 
 		 820 aa  75.5  0.000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  25.41 
 
 		 758 aa  75.5  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  23.31 
 
 		 689 aa  75.1  0.000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  26.69 
 
 		 1408 aa  74.3  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  24.01 
 
 		 629 aa  74.3  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  25.89 
 
 		 851 aa  73.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  25.89 
 
 		 851 aa  73.6  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2239  DNA topoisomerase I  28.34 
 
 		 922 aa  74.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0515029  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  24.23 
 
 		 704 aa  72.8  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  27 
 
 		 894 aa  72.8  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  23.37 
 
 		 695 aa  72.8  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3867  DNA topoisomerase I  26.84 
 
 		 720 aa  72.4  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.442129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  27.21 
 
 		 758 aa  72.4  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  26.73 
 
 		 914 aa  72.4  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3033  DNA topoisomerase I  27.6 
 
 		 914 aa  72  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298843  normal  0.412116 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  25.42 
 
 		 780 aa  72.4  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2419  DNA topoisomerase I  28.89 
 
 		 911 aa  72  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0527527  normal  0.116125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  25.5 
 
 		 1087 aa  71.6  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2437  DNA topoisomerase I  25.75 
 
 		 936 aa  71.6  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0547767  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  24.4 
 
 		 700 aa  71.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3010  DNA topoisomerase I  25.42 
 
 		 783 aa  71.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.846821  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1803  DNA topoisomerase I  26.21 
 
 		 859 aa  70.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.120095  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1211  DNA topoisomerase I  29.49 
 
 		 849 aa  71.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4733  DNA topoisomerase I  28.25 
 
 		 916 aa  71.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.767724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  24.67 
 
 		 703 aa  71.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  23.45 
 
 		 700 aa  70.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0196  DNA topoisomerase  26.21 
 
 		 835 aa  70.9  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  23.75 
 
 		 765 aa  70.5  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  23.75 
 
 		 765 aa  70.5  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1784  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25 
 
 		 1164 aa  70.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0724834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  24.74 
 
 		 706 aa  69.7  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2482  DNA topoisomerase I  26.52 
 
 		 720 aa  69.7  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0421727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  25.24 
 
 		 779 aa  70.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  25.86 
 
 		 694 aa  69.7  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1899  hypothetical protein  26.69 
 
 		 549 aa  70.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.571929  hitchhiker  0.00194399 
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  23.57 
 
 		 703 aa  69.7  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8444  DNA topoisomerase I  30.19 
 
 		 944 aa  69.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0264145 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  27.91 
 
 		 841 aa  69.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  24.05 
 
 		 700 aa  69.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3992  hypothetical protein  24.33 
 
 		 1126 aa  69.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  24.83 
 
 		 831 aa  69.3  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2343  DNA topoisomerase I  27.43 
 
 		 841 aa  69.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.767533 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1220 aa  69.3  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1505  DNA topoisomerase I  27.45 
 
 		 896 aa  69.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  25.24 
 
 		 759 aa  69.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3469  DNA topoisomerase I  26.52 
 
 		 891 aa  69.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.661677  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  25.24 
 
 		 759 aa  68.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1989  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.77 
 
 		 605 aa  68.9  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0620689  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  25.17 
 
 		 703 aa  68.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2277  DNA topoisomerase I  26.19 
 
 		 854 aa  68.6  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0137658 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  24.61 
 
 		 779 aa  68.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3535  DNA topoisomerase I  25.99 
 
 		 911 aa  68.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  24.27 
 
 		 756 aa  68.6  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  24.83 
 
 		 776 aa  68.6  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1164  DNA topoisomerase I  24.92 
 
 		 879 aa  68.2  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9223  DNA topoisomerase  25.3 
 
 		 883 aa  68.6  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4321  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1126 aa  67.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  24.48 
 
 		 831 aa  68.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  26.35 
 
 		 836 aa  67.8  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1208  DNA topoisomerase I  26.99 
 
 		 721 aa  67  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000400838  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  23.47 
 
 		 768 aa  67.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3443  superfamily I DNA/RNA helicase  27.06 
 
 		 1061 aa  67  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1712  DNA topoisomerase I  26 
 
 		 911 aa  67.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.583112  normal  0.397735 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0334  DNA topoisomerase I  26.9 
 
 		 825 aa  67  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2316  DNA topoisomerase I  26.94 
 
 		 880 aa  67.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2339  DNA topoisomerase I  25.77 
 
 		 893 aa  67  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.786994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2326  DNA topoisomerase I  25.56 
 
 		 799 aa  67  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.240337  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3826  DNA topoisomerase I  25.52 
 
 		 852 aa  67.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801079  normal  0.0383535 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3847  DNA topoisomerase I  26.69 
 
 		 977 aa  67  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0674028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>