87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1889 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1889  hypothetical protein  100 
 
 		 1092 aa  2226    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  31.05 
 
 		 1056 aa  356  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  30.86 
 
 		 1094 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4321  hypothetical protein  30.87 
 
 		 1126 aa  299  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  28.53 
 
 		 1220 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  42.35 
 
 		 1157 aa  260  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  41.86 
 
 		 1087 aa  250  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2785  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.57 
 
 		 1477 aa  243  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.464639 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3992  hypothetical protein  33.87 
 
 		 1126 aa  239  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3443  superfamily I DNA/RNA helicase  34.68 
 
 		 1061 aa  221  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1899  hypothetical protein  34.79 
 
 		 549 aa  219  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.571929  hitchhiker  0.00194399 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4016  hypothetical protein  37.63 
 
 		 1100 aa  217  9e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1989  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  35.12 
 
 		 605 aa  217  9e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0620689  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1784  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  35.21 
 
 		 1164 aa  215  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0724834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00472  hypothetical protein  31.7 
 
 		 1049 aa  182  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0358017  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  28.81 
 
 		 1132 aa  102  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1898  hypothetical protein  34.62 
 
 		 498 aa  95.9  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170657 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  27.81 
 
 		 958 aa  90.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  26.14 
 
 		 1178 aa  82.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  27.48 
 
 		 1185 aa  81.3  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  26.84 
 
 		 946 aa  80.5  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1176 aa  78.2  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0412  hypothetical protein  32.77 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.629297  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  24.81 
 
 		 1002 aa  77  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.18 
 
 		 1196 aa  75.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  24.92 
 
 		 1178 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.95 
 
 		 1203 aa  75.1  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  23.84 
 
 		 975 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  24.19 
 
 		 932 aa  70.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  24.42 
 
 		 922 aa  68.6  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1062 aa  68.2  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1126 aa  66.2  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  28.62 
 
 		 925 aa  66.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23060  hypothetical protein  37.93 
 
 		 178 aa  64.3  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  24.73 
 
 		 916 aa  64.3  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1116 aa  63.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  23.1 
 
 		 914 aa  60.1  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  23.01 
 
 		 1190 aa  60.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  24.56 
 
 		 1171 aa  57  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  23.99 
 
 		 1099 aa  56.2  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  25.09 
 
 		 585 aa  56.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  24.81 
 
 		 903 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  26.88 
 
 		 629 aa  53.9  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  25.81 
 
 		 928 aa  53.5  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5347  DNA topoisomerase  22.33 
 
 		 1335 aa  53.5  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  22.92 
 
 		 632 aa  52.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.97 
 
 		 1363 aa  52.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  24.84 
 
 		 914 aa  52  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  23.25 
 
 		 635 aa  52  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  26.85 
 
 		 758 aa  51.6  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  24.05 
 
 		 1041 aa  51.6  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  23.38 
 
 		 636 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  23.49 
 
 		 622 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  22.44 
 
 		 1622 aa  49.7  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  25 
 
 		 606 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  26.01 
 
 		 797 aa  49.7  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  23.49 
 
 		 619 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  23.84 
 
 		 655 aa  49.7  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.27 
 
 		 254 aa  49.7  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0634  superfamily I DNA/RNA helicase  23.48 
 
 		 1584 aa  48.9  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  23.49 
 
 		 622 aa  48.9  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  23.99 
 
 		 715 aa  48.9  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  21.83 
 
 		 905 aa  48.5  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  21.83 
 
 		 905 aa  48.5  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  27.95 
 
 		 901 aa  48.1  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.46 
 
 		 1403 aa  47.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1801 aa  48.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  22.42 
 
 		 905 aa  47.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  21.07 
 
 		 905 aa  47.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  23.3 
 
 		 466 aa  47.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  23.08 
 
 		 754 aa  47  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  21.67 
 
 		 636 aa  47  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  39.13 
 
 		 1559 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  21.2 
 
 		 905 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  21.83 
 
 		 900 aa  47  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  26.04 
 
 		 1328 aa  46.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  34.29 
 
 		 1861 aa  46.6  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  25.54 
 
 		 902 aa  46.6  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  23.18 
 
 		 908 aa  46.2  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  22.65 
 
 		 941 aa  45.8  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  50 
 
 		 1722 aa  45.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  23.76 
 
 		 1888 aa  45.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  21.55 
 
 		 643 aa  45.1  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  23.82 
 
 		 1620 aa  45.1  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  21.48 
 
 		 907 aa  45.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  25 
 
 		 1328 aa  44.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  38.24 
 
 		 1593 aa  44.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>