169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2942 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  100 
 
 		 1801 aa  3655    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  32.92 
 
 		 1722 aa  823    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  48.12 
 
 		 2123 aa  570  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  39.58 
 
 		 2096 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  45.96 
 
 		 2045 aa  457  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  47.53 
 
 		 1904 aa  438  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  43.22 
 
 		 1575 aa  383  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  36.89 
 
 		 1877 aa  379  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  42.61 
 
 		 1861 aa  379  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  38.39 
 
 		 1593 aa  377  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  39.08 
 
 		 1854 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  35.8 
 
 		 1853 aa  374  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  29.26 
 
 		 1622 aa  368  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  34.53 
 
 		 1559 aa  364  8e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  36.75 
 
 		 1888 aa  363  2e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  38.7 
 
 		 1572 aa  362  3e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  42.65 
 
 		 1559 aa  357  8.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  40.55 
 
 		 1571 aa  357  1e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  39.88 
 
 		 1823 aa  356  2.9999999999999997e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  41.97 
 
 		 1328 aa  352  3e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  32.66 
 
 		 1589 aa  343  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  36.9 
 
 		 2759 aa  343  2e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  33.29 
 
 		 1589 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  39.96 
 
 		 2207 aa  342  5e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  40.55 
 
 		 2013 aa  342  5e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  40.04 
 
 		 1589 aa  341  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  38.68 
 
 		 1958 aa  340  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  40.33 
 
 		 1803 aa  340  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  39.83 
 
 		 1945 aa  339  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  36.18 
 
 		 1867 aa  337  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  39.58 
 
 		 1754 aa  336  3e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  42.31 
 
 		 1991 aa  335  3e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  36.11 
 
 		 2197 aa  335  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  40.62 
 
 		 1973 aa  335  6e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  40.53 
 
 		 1983 aa  332  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  37.36 
 
 		 2204 aa  331  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  38.61 
 
 		 2016 aa  326  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  37.61 
 
 		 2002 aa  325  3e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  36.29 
 
 		 1980 aa  325  4e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  38.45 
 
 		 2222 aa  323  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  41.24 
 
 		 2198 aa  323  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  34.04 
 
 		 1959 aa  317  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  40.13 
 
 		 1950 aa  314  9e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  37.14 
 
 		 1986 aa  313  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  37.84 
 
 		 1958 aa  311  8e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34.09 
 
 		 1403 aa  283  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  36.89 
 
 		 2005 aa  251  9e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  34.44 
 
 		 2125 aa  238  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  34.44 
 
 		 2125 aa  238  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  33.33 
 
 		 1822 aa  234  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  33.4 
 
 		 1822 aa  232  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  34.58 
 
 		 1838 aa  228  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  31.11 
 
 		 2098 aa  213  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  32.6 
 
 		 2098 aa  212  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34.72 
 
 		 1363 aa  201  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  28.47 
 
 		 1296 aa  196  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  31.67 
 
 		 2104 aa  194  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  30.72 
 
 		 2101 aa  190  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  30.72 
 
 		 2101 aa  190  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  30.61 
 
 		 2098 aa  188  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  29.89 
 
 		 1328 aa  184  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  27.98 
 
 		 1367 aa  152  4e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0996  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.16 
 
 		 1312 aa  152  6e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0899  DNA helicase  25.9 
 
 		 1412 aa  139  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.403081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  28.14 
 
 		 1285 aa  138  9e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  28.79 
 
 		 1490 aa  125  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  25.97 
 
 		 1649 aa  122  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30630  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1413 aa  120  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0830  hypothetical protein  28.2 
 
 		 1506 aa  119  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  28.41 
 
 		 1629 aa  119  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  27.56 
 
 		 1697 aa  117  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  27.67 
 
 		 1489 aa  116  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf701  putative ATP-binding helicase  24.64 
 
 		 1050 aa  112  4.0000000000000004e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  26.44 
 
 		 1575 aa  112  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2819  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1392 aa  110  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.568772  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1652 aa  109  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  26.71 
 
 		 1410 aa  107  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  26.88 
 
 		 1630 aa  106  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  26.24 
 
 		 1724 aa  105  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2868  hypothetical protein  25 
 
 		 1407 aa  105  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.85474  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  24.89 
 
 		 1474 aa  103  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  26.84 
 
 		 1523 aa  103  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  22.97 
 
 		 1790 aa  103  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2575  hypothetical protein  25.16 
 
 		 1400 aa  100  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000181544 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  25.8 
 
 		 1622 aa  99.4  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1076  hypothetical protein  36.14 
 
 		 194 aa  94.7  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000229233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  25.75 
 
 		 1387 aa  83.2  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  26.25 
 
 		 1557 aa  82  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  25.33 
 
 		 2622 aa  79  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24380  hypothetical protein  22.8 
 
 		 1670 aa  78.6  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.694198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16460  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1254 aa  76.3  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  24.48 
 
 		 907 aa  75.9  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3745  superfamily I DNA/RNA helicase  25.92 
 
 		 1694 aa  75.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1974  hypothetical protein  22.36 
 
 		 1499 aa  74.7  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  24.29 
 
 		 905 aa  71.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  24.29 
 
 		 905 aa  72  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  24.42 
 
 		 908 aa  71.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  23.97 
 
 		 900 aa  71.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  25 
 
 		 715 aa  68.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  22.82 
 
 		 906 aa  67.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>