83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2819 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0830  hypothetical protein  58.13 
 
 
1506 aa  1169    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2819  hypothetical protein  100 
 
 
1392 aa  2655    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.568772  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30630  hypothetical protein  61.11 
 
 
1413 aa  1205    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196712  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1974  hypothetical protein  54.5 
 
 
1499 aa  1085    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0899  DNA helicase  48.32 
 
 
1412 aa  806    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.403081  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2575  hypothetical protein  35.83 
 
 
1400 aa  520  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000181544 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1670  hypothetical protein  32.88 
 
 
1207 aa  510  1e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0229  hypothetical protein  32.13 
 
 
1252 aa  509  9.999999999999999e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2868  hypothetical protein  34.61 
 
 
1407 aa  498  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.85474  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24380  hypothetical protein  35.63 
 
 
1670 aa  474  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.694198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16460  hypothetical protein  34.22 
 
 
1254 aa  384  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3697  hypothetical protein  31.17 
 
 
1274 aa  261  6e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141497  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  29 
 
 
1877 aa  180  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  25.73 
 
 
2013 aa  172  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  28.48 
 
 
1593 aa  170  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  27.03 
 
 
1854 aa  169  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  26.56 
 
 
1559 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  27.55 
 
 
1959 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  29.23 
 
 
1571 aa  155  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  23.4 
 
 
1622 aa  146  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  27.61 
 
 
2002 aa  145  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  28.54 
 
 
1559 aa  145  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  27.91 
 
 
2198 aa  144  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  26.3 
 
 
2096 aa  143  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  27.6 
 
 
1572 aa  143  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  26.77 
 
 
1958 aa  141  7e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  27.44 
 
 
1575 aa  141  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  27.76 
 
 
1861 aa  140  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  28.17 
 
 
2197 aa  140  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  24.91 
 
 
1589 aa  139  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  28 
 
 
1589 aa  139  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  27.37 
 
 
1589 aa  138  9e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  32.43 
 
 
1328 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  27.93 
 
 
2016 aa  136  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  26.6 
 
 
1853 aa  136  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  28.36 
 
 
2222 aa  136  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  28.01 
 
 
1986 aa  136  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  28.82 
 
 
1980 aa  135  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  26.7 
 
 
1823 aa  135  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  28.85 
 
 
1983 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  27.8 
 
 
2204 aa  134  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  25.46 
 
 
1904 aa  133  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  26.04 
 
 
1754 aa  133  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  27.07 
 
 
1803 aa  133  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  27.16 
 
 
2207 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  29.33 
 
 
1945 aa  132  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  26.57 
 
 
1973 aa  127  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  26.96 
 
 
1867 aa  127  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  23.5 
 
 
2759 aa  127  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  27.86 
 
 
1991 aa  126  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  23.34 
 
 
1722 aa  125  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  26.19 
 
 
2045 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23940  hypothetical protein  26.89 
 
 
1217 aa  121  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25 
 
 
1403 aa  119  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  26.03 
 
 
1950 aa  115  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  25.63 
 
 
1801 aa  114  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  24.57 
 
 
1888 aa  113  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  25.78 
 
 
1958 aa  111  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  28.86 
 
 
2125 aa  100  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  26.39 
 
 
2123 aa  100  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  28.86 
 
 
2125 aa  100  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.69 
 
 
1363 aa  99.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  22.34 
 
 
1296 aa  92.8  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  26.85 
 
 
2005 aa  82.4  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  28.06 
 
 
2098 aa  80.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  28.06 
 
 
2098 aa  79.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  22.71 
 
 
1328 aa  77.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  22.05 
 
 
1285 aa  67.4  0.000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  25.41 
 
 
2104 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 
2098 aa  62  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 
2101 aa  62  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 
2101 aa  62  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0996  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  21.77 
 
 
1312 aa  61.6  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  21.22 
 
 
1367 aa  55.8  0.000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  21.52 
 
 
1822 aa  54.3  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  26.16 
 
 
1822 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  42.47 
 
 
1838 aa  54.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  22.43 
 
 
1474 aa  48.9  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  20.24 
 
 
900 aa  47  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  21.53 
 
 
905 aa  46.2  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  21.53 
 
 
905 aa  46.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1076  hypothetical protein  24.57 
 
 
194 aa  45.8  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000229233  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  19.7 
 
 
905 aa  45.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>