More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_7073 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  98.95 
 
 
2101 aa  4102    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
2098 aa  4235    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  64.14 
 
 
2098 aa  2572    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  88.31 
 
 
2104 aa  3753    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  64.04 
 
 
2098 aa  2581    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  98.95 
 
 
2101 aa  4102    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34.36 
 
 
1403 aa  258  8e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  31.97 
 
 
1822 aa  218  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  31.32 
 
 
1838 aa  217  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  34.07 
 
 
2002 aa  213  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  28.43 
 
 
1822 aa  207  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  32.14 
 
 
1622 aa  207  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  28.7 
 
 
2013 aa  205  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  32.02 
 
 
1803 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  33.53 
 
 
1950 aa  202  7e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  36.61 
 
 
1296 aa  199  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  32.38 
 
 
2207 aa  199  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  32.24 
 
 
1983 aa  198  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  33.27 
 
 
1958 aa  197  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  32.51 
 
 
1973 aa  197  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  32.81 
 
 
1986 aa  196  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  35.64 
 
 
1363 aa  196  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  31.19 
 
 
1888 aa  192  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0996  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  33.17 
 
 
1312 aa  191  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  30.98 
 
 
1959 aa  190  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  32.65 
 
 
1867 aa  189  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  33.75 
 
 
2197 aa  189  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  30.61 
 
 
1801 aa  189  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  32.44 
 
 
2204 aa  189  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  38.33 
 
 
2125 aa  188  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  38.33 
 
 
2125 aa  188  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  31.43 
 
 
2016 aa  187  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  30.87 
 
 
1722 aa  186  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  33.27 
 
 
1958 aa  186  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  29.49 
 
 
2198 aa  184  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  33.06 
 
 
1991 aa  184  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  30.78 
 
 
2759 aa  183  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  32.49 
 
 
1367 aa  183  4e-44  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  31.4 
 
 
1328 aa  182  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  33.26 
 
 
2045 aa  182  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  35.45 
 
 
2005 aa  182  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  31.09 
 
 
1328 aa  181  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  31.7 
 
 
1854 aa  180  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  31.88 
 
 
1754 aa  181  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  31.12 
 
 
2222 aa  180  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  32.24 
 
 
1877 aa  180  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  30.82 
 
 
1559 aa  178  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  32.17 
 
 
1823 aa  177  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  28.55 
 
 
1945 aa  176  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  29.63 
 
 
2123 aa  175  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  30.58 
 
 
1904 aa  173  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  33.33 
 
 
1285 aa  173  3e-41  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  31.1 
 
 
2096 aa  172  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  30.57 
 
 
1853 aa  171  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  31.28 
 
 
1575 aa  170  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  30.37 
 
 
1571 aa  169  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  31.31 
 
 
1593 aa  167  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  30.24 
 
 
1572 aa  163  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  31.41 
 
 
1861 aa  160  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  30.38 
 
 
1589 aa  159  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  30.46 
 
 
1589 aa  159  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  30.65 
 
 
1980 aa  158  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  30.19 
 
 
1589 aa  157  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  30.72 
 
 
1559 aa  152  9e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2697  serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 
691 aa  140  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1113  serine/threonine protein kinase  35.44 
 
 
817 aa  140  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1503  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.01 
 
 
862 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf701  putative ATP-binding helicase  26.92 
 
 
1050 aa  100  4e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  27.23 
 
 
1622 aa  96.3  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  29.31 
 
 
903 aa  93.2  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  28.26 
 
 
1652 aa  89  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  28.12 
 
 
1630 aa  87.8  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  27.02 
 
 
907 aa  86.7  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  27.38 
 
 
906 aa  86.3  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  23.3 
 
 
1121 aa  86.3  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  27.89 
 
 
1697 aa  85.9  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  28.35 
 
 
1557 aa  85.9  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  29.11 
 
 
908 aa  85.9  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  25.36 
 
 
1474 aa  85.9  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  26.42 
 
 
1387 aa  84.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3745  superfamily I DNA/RNA helicase  25.63 
 
 
1694 aa  83.6  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  29.18 
 
 
946 aa  81.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  26.25 
 
 
900 aa  82  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  24.64 
 
 
1490 aa  80.9  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  27.27 
 
 
905 aa  79.7  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  25.29 
 
 
905 aa  78.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  25.29 
 
 
905 aa  78.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  24.62 
 
 
1002 aa  77.8  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  25.15 
 
 
1790 aa  77.4  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  26.17 
 
 
905 aa  77  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  26.09 
 
 
905 aa  77  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  27.27 
 
 
629 aa  77  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  25.71 
 
 
633 aa  76.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0870  serine/threonine protein kinase  30.47 
 
 
903 aa  75.9  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87865  normal  0.209355 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  27.21 
 
 
1649 aa  75.5  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0052  serine/threonine protein kinase  36.92 
 
 
475 aa  72.8  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  27.41 
 
 
1410 aa  72.8  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  28.34 
 
 
633 aa  72.4  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  27.49 
 
 
1629 aa  72.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.34 
 
 
614 aa  71.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>