249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1828 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  68.99 
 
 		 633 aa  909    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  93.21 
 
 		 633 aa  1203    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  93.52 
 
 		 633 aa  1201    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  100 
 
 		 633 aa  1278    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  43.79 
 
 		 650 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  43.48 
 
 		 650 aa  503  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  45.35 
 
 		 643 aa  472  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  42.37 
 
 		 655 aa  460  9.999999999999999e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  40 
 
 		 754 aa  445  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  32.21 
 
 		 609 aa  270  8e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  31.56 
 
 		 635 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  32.08 
 
 		 636 aa  265  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  32.02 
 
 		 632 aa  265  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  32.98 
 
 		 611 aa  260  7e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  31.45 
 
 		 636 aa  256  7e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  30.57 
 
 		 622 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  30.76 
 
 		 622 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  29.7 
 
 		 619 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  33.02 
 
 		 748 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  33.91 
 
 		 686 aa  241  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  28.82 
 
 		 651 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  34.35 
 
 		 716 aa  239  2e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  29.64 
 
 		 466 aa  192  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  31.55 
 
 		 952 aa  190  9e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  27.52 
 
 		 1090 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  30.63 
 
 		 464 aa  184  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  27.73 
 
 		 797 aa  178  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  35.02 
 
 		 479 aa  176  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  27.56 
 
 		 902 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  28.19 
 
 		 1999 aa  175  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  28.4 
 
 		 1099 aa  170  8e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  33.46 
 
 		 902 aa  167  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  33.33 
 
 		 986 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  32.44 
 
 		 934 aa  162  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  26.58 
 
 		 1077 aa  161  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  26.79 
 
 		 2245 aa  154  4e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  35.19 
 
 		 388 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  30.11 
 
 		 629 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  34.98 
 
 		 901 aa  147  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  26.11 
 
 		 585 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  26.75 
 
 		 553 aa  144  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  26.75 
 
 		 553 aa  144  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  36.59 
 
 		 268 aa  142  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  27.83 
 
 		 715 aa  136  9e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  28.57 
 
 		 941 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  27.59 
 
 		 1038 aa  130  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  24.62 
 
 		 795 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  30.72 
 
 		 1048 aa  128  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  30.41 
 
 		 1097 aa  127  5e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  33.1 
 
 		 315 aa  125  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34.31 
 
 		 752 aa  123  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1018 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  29.51 
 
 		 1189 aa  118  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  28.06 
 
 		 486 aa  115  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  29.25 
 
 		 1653 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  24.63 
 
 		 769 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  24.7 
 
 		 521 aa  110  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  24.63 
 
 		 759 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  24.89 
 
 		 759 aa  109  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  24.63 
 
 		 759 aa  109  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  24.41 
 
 		 759 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  23.64 
 
 		 759 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  23.64 
 
 		 759 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  23.98 
 
 		 759 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  26.37 
 
 		 606 aa  107  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  24.84 
 
 		 769 aa  107  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  24.68 
 
 		 759 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  23.98 
 
 		 759 aa  105  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  28.65 
 
 		 1284 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  34.05 
 
 		 237 aa  102  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  27.44 
 
 		 1585 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  27.44 
 
 		 1585 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  24.28 
 
 		 1002 aa  96.3  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  21.9 
 
 		 1428 aa  95.9  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  28.47 
 
 		 1111 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  25.35 
 
 		 1427 aa  92  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  26.94 
 
 		 1620 aa  89  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  29.22 
 
 		 283 aa  88.2  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  25.39 
 
 		 1175 aa  87.8  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  26.33 
 
 		 944 aa  87  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  22.4 
 
 		 1190 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  25 
 
 		 932 aa  84.7  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  25.78 
 
 		 922 aa  84.3  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  26.8 
 
 		 297 aa  82.8  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  29.08 
 
 		 2098 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  26.54 
 
 		 1082 aa  80.9  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  29.08 
 
 		 2098 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  24.16 
 
 		 1108 aa  81.3  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07014  DEAD helicases superfamily protein (Aquarius), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04350)  22.2 
 
 		 1422 aa  79.3  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1116 aa  79  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1823 aa  77.8  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  24.67 
 
 		 1408 aa  77.4  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  23.79 
 
 		 1457 aa  77  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  22.72 
 
 		 659 aa  76.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1126 aa  75.1  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  25.6 
 
 		 1261 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  28.62 
 
 		 2002 aa  74.7  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  26.07 
 
 		 1270 aa  74.7  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  24.26 
 
 		 916 aa  74.3  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  22.36 
 
 		 1271 aa  73.9  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>