155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf701 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf701  putative ATP-binding helicase  100 
 
 
1050 aa  2113    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  29.94 
 
 
1367 aa  201  7.999999999999999e-50  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  36.83 
 
 
1285 aa  172  4e-41  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  32.79 
 
 
1296 aa  157  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  31.6 
 
 
1363 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  29.87 
 
 
1328 aa  134  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  24.38 
 
 
1973 aa  130  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  24.03 
 
 
1950 aa  128  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  28.37 
 
 
1622 aa  128  6e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0996  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  31.58 
 
 
1312 aa  127  9e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  24.03 
 
 
1958 aa  126  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  26.83 
 
 
2013 aa  125  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  25.8 
 
 
1980 aa  124  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  29.34 
 
 
1877 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  24.19 
 
 
1991 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.32 
 
 
1403 aa  120  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  23.72 
 
 
1328 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  24.78 
 
 
1722 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  24.59 
 
 
1861 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  23.69 
 
 
1823 aa  115  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  24.53 
 
 
2207 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  26.55 
 
 
2759 aa  114  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  29.13 
 
 
2123 aa  114  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  25.75 
 
 
1803 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  23.38 
 
 
2016 aa  114  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  24.64 
 
 
1801 aa  113  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  29.13 
 
 
1854 aa  113  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  22.53 
 
 
2198 aa  112  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  24.04 
 
 
1986 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  23.78 
 
 
1959 aa  111  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  28.85 
 
 
2002 aa  108  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  24.45 
 
 
1983 aa  108  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  24.9 
 
 
1853 aa  108  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  22.93 
 
 
2197 aa  108  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  25.67 
 
 
1904 aa  108  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  27.46 
 
 
1822 aa  108  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  23.92 
 
 
1945 aa  107  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  25.37 
 
 
1572 aa  106  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  24.59 
 
 
1754 aa  105  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  26.59 
 
 
2005 aa  104  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  24.21 
 
 
1575 aa  104  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  27.05 
 
 
2098 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  25.63 
 
 
1958 aa  103  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  27.05 
 
 
2098 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  22.93 
 
 
2222 aa  102  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  23.19 
 
 
1593 aa  102  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  27.65 
 
 
2104 aa  101  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 
2101 aa  101  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 
2101 aa  101  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 
2098 aa  100  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  27.55 
 
 
1888 aa  99  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  21.89 
 
 
2204 aa  99  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  30.54 
 
 
1822 aa  98.6  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  22.62 
 
 
2125 aa  97.8  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  22.62 
 
 
2125 aa  97.8  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  24.38 
 
 
1559 aa  97.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  26.29 
 
 
1559 aa  96.3  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  23.41 
 
 
1589 aa  93.2  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  25.42 
 
 
1589 aa  93.6  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  23.41 
 
 
1589 aa  93.2  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  22.34 
 
 
1571 aa  92.8  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  25 
 
 
1867 aa  92.8  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  22.91 
 
 
2045 aa  90.1  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  27.33 
 
 
1838 aa  84.7  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  24.68 
 
 
1002 aa  80.5  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  26.88 
 
 
629 aa  77  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  26.37 
 
 
903 aa  75.5  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  25.63 
 
 
611 aa  70.5  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  20.16 
 
 
2096 aa  68.2  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  24.32 
 
 
1622 aa  67.8  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  23.24 
 
 
1490 aa  67.4  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  25.67 
 
 
633 aa  67.4  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  25.85 
 
 
908 aa  66.6  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  27.59 
 
 
633 aa  65.9  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  23.88 
 
 
907 aa  65.5  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  26.24 
 
 
633 aa  65.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.46 
 
 
1196 aa  65.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  24.45 
 
 
905 aa  65.5  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  23.28 
 
 
900 aa  65.1  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  23.9 
 
 
905 aa  64.7  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  23.9 
 
 
905 aa  64.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  24.45 
 
 
905 aa  64.3  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  24.09 
 
 
925 aa  63.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  24.71 
 
 
906 aa  62.8  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  24.14 
 
 
905 aa  62.8  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  27.3 
 
 
1790 aa  61.2  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  24.73 
 
 
946 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  24.32 
 
 
636 aa  60.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  24.34 
 
 
622 aa  60.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  24.34 
 
 
659 aa  60.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  22.27 
 
 
1489 aa  60.1  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  25 
 
 
633 aa  59.3  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  44.29 
 
 
758 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0774  ATP-binding protein  41.18 
 
 
904 aa  56.2  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00601607  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  22.19 
 
 
916 aa  56.2  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  44.44 
 
 
1575 aa  56.2  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  51.02 
 
 
1557 aa  55.8  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  24.63 
 
 
619 aa  55.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  23.17 
 
 
622 aa  55.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  33.59 
 
 
1041 aa  55.5  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>