241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4216 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  100 
 
 
619 aa  1181    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  79.52 
 
 
651 aa  876    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  96.95 
 
 
622 aa  1078    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  95.82 
 
 
622 aa  1066    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  37.16 
 
 
754 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  37.33 
 
 
636 aa  363  4e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  35.99 
 
 
636 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  33.84 
 
 
655 aa  357  3.9999999999999996e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  37.21 
 
 
611 aa  355  1e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  35.16 
 
 
635 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  39.84 
 
 
609 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  34.8 
 
 
632 aa  338  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  35.94 
 
 
650 aa  333  8e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  34.94 
 
 
650 aa  330  6e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  31.02 
 
 
643 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  34.09 
 
 
686 aa  282  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  31.29 
 
 
716 aa  268  2e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  29.91 
 
 
633 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  29.94 
 
 
633 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  29.75 
 
 
633 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  28.86 
 
 
633 aa  261  2e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  39.45 
 
 
466 aa  260  4e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  34.89 
 
 
748 aa  258  2e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  37.04 
 
 
464 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  33.47 
 
 
797 aa  225  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  30.8 
 
 
1090 aa  220  6e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  35.17 
 
 
1077 aa  219  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  33.69 
 
 
952 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  33.69 
 
 
1097 aa  203  9e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  35.56 
 
 
986 aa  201  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  37.92 
 
 
752 aa  196  9e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  37.41 
 
 
902 aa  192  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  34.52 
 
 
479 aa  192  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  30.72 
 
 
1048 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  29.21 
 
 
1999 aa  179  9e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  44.79 
 
 
901 aa  178  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  31.35 
 
 
2245 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  40.41 
 
 
902 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  38.21 
 
 
1189 aa  164  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  41.45 
 
 
268 aa  162  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  32.81 
 
 
388 aa  159  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  30.21 
 
 
486 aa  155  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  41.46 
 
 
934 aa  154  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  32.66 
 
 
629 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  32.07 
 
 
553 aa  146  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  32.07 
 
 
553 aa  146  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  26.5 
 
 
1099 aa  144  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  30.16 
 
 
585 aa  144  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  38.2 
 
 
941 aa  143  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  32.27 
 
 
795 aa  143  8e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  33.9 
 
 
315 aa  140  6e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  39.75 
 
 
237 aa  139  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  34.03 
 
 
606 aa  133  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  27.63 
 
 
715 aa  125  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  36.14 
 
 
283 aa  122  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  27.32 
 
 
759 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  27.5 
 
 
759 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  27.32 
 
 
759 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  27.59 
 
 
769 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  27.32 
 
 
759 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  26.86 
 
 
759 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  26.99 
 
 
759 aa  115  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  26.5 
 
 
759 aa  115  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  35.08 
 
 
1018 aa  115  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  26.86 
 
 
759 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  27.76 
 
 
769 aa  114  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  26.68 
 
 
759 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  28.2 
 
 
1190 aa  104  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  31.05 
 
 
1620 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  26.91 
 
 
2310 aa  101  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  28.31 
 
 
1653 aa  101  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  28.43 
 
 
1038 aa  97.4  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  30.74 
 
 
1427 aa  95.5  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  28.18 
 
 
922 aa  95.1  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  24.93 
 
 
1284 aa  95.1  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  29.41 
 
 
297 aa  94.7  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  30.4 
 
 
916 aa  94  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  27.47 
 
 
521 aa  94  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  29.28 
 
 
944 aa  93.2  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  27.13 
 
 
1175 aa  92.8  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  28.4 
 
 
1271 aa  92  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  29.13 
 
 
1427 aa  89.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  28.32 
 
 
1585 aa  87  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  28.32 
 
 
1585 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  30.04 
 
 
1116 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  33.49 
 
 
254 aa  85.5  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  28.83 
 
 
1126 aa  85.5  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07014  DEAD helicases superfamily protein (Aquarius), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04350)  27.65 
 
 
1422 aa  85.1  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  26.91 
 
 
932 aa  84.7  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  32.12 
 
 
659 aa  84  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  28.57 
 
 
1275 aa  83.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.62 
 
 
1196 aa  82  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  25.64 
 
 
925 aa  81.3  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  29.91 
 
 
1108 aa  80.5  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  24.51 
 
 
1111 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  29.44 
 
 
1280 aa  78.2  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  31.64 
 
 
1118 aa  77.8  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  28.16 
 
 
1651 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  29.63 
 
 
903 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  27.67 
 
 
1215 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>