189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0470 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  100 
 
 		 2045 aa  4121    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  42.45 
 
 		 1722 aa  506  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  41.02 
 
 		 1904 aa  479  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  45.96 
 
 		 1801 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  41.59 
 
 		 2207 aa  426  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  43.4 
 
 		 2123 aa  424  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  40.45 
 
 		 1803 aa  415  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  42.44 
 
 		 2096 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  44.42 
 
 		 2016 aa  397  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  39.73 
 
 		 2197 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  37.46 
 
 		 1945 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  43.73 
 
 		 2222 aa  389  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  42.36 
 
 		 2204 aa  389  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  40.31 
 
 		 1888 aa  381  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  42.99 
 
 		 1958 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  39.43 
 
 		 1958 aa  380  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  40.07 
 
 		 1950 aa  378  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  43.06 
 
 		 1861 aa  380  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  45.42 
 
 		 1571 aa  380  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  40.33 
 
 		 1877 aa  380  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  43.34 
 
 		 1980 aa  375  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  43.75 
 
 		 1559 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  43.81 
 
 		 1559 aa  377  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  45.37 
 
 		 2002 aa  373  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  41.91 
 
 		 2198 aa  369  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  44.7 
 
 		 1853 aa  370  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  44.68 
 
 		 1593 aa  369  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  43.15 
 
 		 1973 aa  367  1e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  45.24 
 
 		 1575 aa  366  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  44.14 
 
 		 1983 aa  365  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  43.93 
 
 		 1854 aa  365  6e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  39.7 
 
 		 1986 aa  360  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  43.99 
 
 		 1991 aa  360  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  32.46 
 
 		 1622 aa  358  7.999999999999999e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  38.14 
 
 		 1754 aa  357  1e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  32.86 
 
 		 1572 aa  355  2.9999999999999997e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  37.38 
 
 		 1823 aa  355  5.9999999999999994e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  42.09 
 
 		 1328 aa  350  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  41.58 
 
 		 1959 aa  349  4e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  38.38 
 
 		 1867 aa  346  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  41.53 
 
 		 1589 aa  338  5.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  40.89 
 
 		 1589 aa  337  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  40.59 
 
 		 1589 aa  336  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  42.77 
 
 		 2759 aa  334  1e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  35.69 
 
 		 2013 aa  330  1.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  32.86 
 
 		 1403 aa  313  2.9999999999999997e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  37.8 
 
 		 2125 aa  278  8e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  37.8 
 
 		 2125 aa  278  8e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  37.12 
 
 		 2005 aa  264  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  31.14 
 
 		 1822 aa  246  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1822 aa  239  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  33.47 
 
 		 1838 aa  219  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  28.62 
 
 		 1328 aa  191  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  36.07 
 
 		 1363 aa  189  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  34.51 
 
 		 1296 aa  187  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  31.49 
 
 		 2104 aa  185  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  29.92 
 
 		 2098 aa  182  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  29.79 
 
 		 2098 aa  182  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  33.26 
 
 		 2098 aa  182  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  33.26 
 
 		 2101 aa  181  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  33.26 
 
 		 2101 aa  181  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0996  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.81 
 
 		 1312 aa  161  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  27.27 
 
 		 1367 aa  149  6e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  29.18 
 
 		 1489 aa  138  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  28.61 
 
 		 1285 aa  137  3e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0899  DNA helicase  27.29 
 
 		 1412 aa  137  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.403081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30630  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1413 aa  137  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0830  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1506 aa  136  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  27.99 
 
 		 1649 aa  130  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  29.73 
 
 		 1410 aa  124  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  26.05 
 
 		 1629 aa  122  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2819  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1392 aa  121  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.568772  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1474 aa  120  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  29.27 
 
 		 1490 aa  119  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  29.35 
 
 		 1697 aa  118  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  27.53 
 
 		 1523 aa  116  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  27.43 
 
 		 1575 aa  116  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  29.71 
 
 		 1652 aa  115  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1974  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1499 aa  114  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  28.18 
 
 		 1790 aa  110  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  28.81 
 
 		 1630 aa  108  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  29.31 
 
 		 1622 aa  106  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2868  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1407 aa  105  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.85474  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1724 aa  105  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  27.2 
 
 		 2622 aa  103  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1076  hypothetical protein  36.02 
 
 		 194 aa  102  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000229233  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2575  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1400 aa  102  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000181544 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16460  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1254 aa  102  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  26.89 
 
 		 1557 aa  98.2  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  28.39 
 
 		 906 aa  96.3  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  26.51 
 
 		 905 aa  94.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3745  superfamily I DNA/RNA helicase  27.99 
 
 		 1694 aa  92.4  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  26.03 
 
 		 905 aa  91.3  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  26.25 
 
 		 905 aa  90.5  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf701  putative ATP-binding helicase  22.91 
 
 		 1050 aa  90.1  4e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  26.29 
 
 		 905 aa  88.6  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  26.29 
 
 		 905 aa  88.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  25.21 
 
 		 1387 aa  88.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  25.2 
 
 		 908 aa  87.8  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  26.05 
 
 		 900 aa  85.5  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>