156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2421 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  31.83 
 
 		 1474 aa  672    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  57.77 
 
 		 1523 aa  1473    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  100 
 
 		 1724 aa  3344    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  29.81 
 
 		 1622 aa  527  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  29.76 
 
 		 1790 aa  521  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  34.21 
 
 		 1575 aa  513  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  30.07 
 
 		 1630 aa  512  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1652 aa  494  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  31.46 
 
 		 1490 aa  459  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  30.43 
 
 		 1697 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  29.62 
 
 		 1649 aa  426  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  41.4 
 
 		 1489 aa  356  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  39.25 
 
 		 1629 aa  347  8e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3745  superfamily I DNA/RNA helicase  39.02 
 
 		 1694 aa  325  6e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  41.11 
 
 		 1410 aa  321  7.999999999999999e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  39.02 
 
 		 2622 aa  316  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  31.09 
 
 		 1557 aa  154  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2605  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1680 aa  150  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.6809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  33.02 
 
 		 1973 aa  127  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  30.58 
 
 		 1980 aa  124  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  29.36 
 
 		 1991 aa  123  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  26.55 
 
 		 907 aa  122  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  31.49 
 
 		 1958 aa  121  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  27.4 
 
 		 908 aa  119  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1722 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  27.94 
 
 		 2045 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  25.68 
 
 		 906 aa  115  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  26.14 
 
 		 900 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  25.11 
 
 		 905 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  26.2 
 
 		 905 aa  112  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  24.94 
 
 		 905 aa  112  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  26.2 
 
 		 905 aa  112  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1801 aa  112  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  30.43 
 
 		 1983 aa  111  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  28.8 
 
 		 1877 aa  111  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1888 aa  110  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  25.28 
 
 		 905 aa  111  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  29.03 
 
 		 1803 aa  109  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  28.91 
 
 		 2016 aa  109  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  29.65 
 
 		 1958 aa  109  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  29.65 
 
 		 1950 aa  108  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  28.85 
 
 		 2204 aa  107  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  29.01 
 
 		 2198 aa  106  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1328 aa  106  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  30.39 
 
 		 2002 aa  105  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  31.7 
 
 		 1575 aa  105  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  28.87 
 
 		 2207 aa  105  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  27.37 
 
 		 1861 aa  104  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1904 aa  104  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  25.05 
 
 		 1121 aa  104  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  27.58 
 
 		 1853 aa  104  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  27.66 
 
 		 1945 aa  103  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  26.64 
 
 		 2013 aa  102  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  30.28 
 
 		 2096 aa  102  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  30.35 
 
 		 1986 aa  102  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  28.92 
 
 		 2197 aa  102  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  29.41 
 
 		 2222 aa  101  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.85 
 
 		 1403 aa  99.8  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1823 aa  97.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  28.14 
 
 		 1754 aa  96.3  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1854 aa  95.9  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  28.24 
 
 		 903 aa  95.5  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  26.53 
 
 		 1559 aa  95.1  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  26.86 
 
 		 1622 aa  94.4  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  28.66 
 
 		 1559 aa  94.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1572 aa  92.4  7e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  26.4 
 
 		 2123 aa  91.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.58 
 
 		 1196 aa  90.1  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  31.7 
 
 		 1387 aa  89.7  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1299  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1763 aa  89  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  24.76 
 
 		 1959 aa  85.9  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  28.57 
 
 		 2125 aa  84.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  28.57 
 
 		 2125 aa  84.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  29.5 
 
 		 946 aa  84.7  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  25.55 
 
 		 925 aa  84  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  29.95 
 
 		 2005 aa  83.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  26.45 
 
 		 2759 aa  82.4  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  25.89 
 
 		 1296 aa  82.4  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  28.47 
 
 		 1328 aa  79  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  28.11 
 
 		 1838 aa  77.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.37 
 
 		 1363 aa  76.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  24.39 
 
 		 1593 aa  75.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  25.17 
 
 		 1367 aa  75.9  0.000000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  27.45 
 
 		 629 aa  75.9  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1440  RAP domain protein  22.5 
 
 		 1081 aa  75.1  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.112962  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  25.11 
 
 		 932 aa  74.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  22.41 
 
 		 1002 aa  73.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  25.55 
 
 		 928 aa  74.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  27.42 
 
 		 1571 aa  73.9  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  27.3 
 
 		 1653 aa  72.8  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  30 
 
 		 914 aa  72.4  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  22.46 
 
 		 914 aa  72.4  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1822 aa  70.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  25.6 
 
 		 1171 aa  70.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  24.79 
 
 		 1285 aa  70.9  0.0000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.01 
 
 		 1203 aa  71.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  27.17 
 
 		 1185 aa  70.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  28.48 
 
 		 2098 aa  68.6  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  28.48 
 
 		 2098 aa  68.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0774  ATP-binding protein  28.83 
 
 		 904 aa  67.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00601607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>