86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1076 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1076  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  390  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000229233  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  41.36 
 
 		 1403 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  45.96 
 
 		 1622 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  40.12 
 
 		 1991 aa  117  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  40.83 
 
 		 1722 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  35.2 
 
 		 1853 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  35.09 
 
 		 1559 aa  108  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  32.8 
 
 		 1973 aa  108  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  36.05 
 
 		 1854 aa  107  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  35.85 
 
 		 1571 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  42.07 
 
 		 1904 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  34.13 
 
 		 2222 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  39.31 
 
 		 1959 aa  105  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  43.2 
 
 		 2759 aa  105  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  32.93 
 
 		 2016 aa  104  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  33.92 
 
 		 1877 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  36.02 
 
 		 2045 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  33.15 
 
 		 1958 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  38.18 
 
 		 1983 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  34.71 
 
 		 2013 aa  99.4  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  40.74 
 
 		 1867 aa  99  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  35.5 
 
 		 2096 aa  98.6  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  38.32 
 
 		 1986 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  35.54 
 
 		 2204 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  35.54 
 
 		 2197 aa  98.6  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  34.15 
 
 		 2198 aa  97.8  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  33.33 
 
 		 1593 aa  97.8  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  33.74 
 
 		 1980 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  45.19 
 
 		 1888 aa  97.4  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  34.44 
 
 		 1754 aa  97.4  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  36.14 
 
 		 1801 aa  94.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  31.79 
 
 		 1328 aa  94.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  32.93 
 
 		 2207 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  42.34 
 
 		 1950 aa  94  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  32.6 
 
 		 1861 aa  94  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  38.12 
 
 		 1575 aa  93.2  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  42.34 
 
 		 1958 aa  93.6  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  32.93 
 
 		 1803 aa  92  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  30.91 
 
 		 1559 aa  87.8  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  41.12 
 
 		 1823 aa  87  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  43.62 
 
 		 2002 aa  87  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  29.12 
 
 		 1945 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  35.98 
 
 		 2123 aa  84.3  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  37.04 
 
 		 1589 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  38.24 
 
 		 1589 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  40.22 
 
 		 1589 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  30.46 
 
 		 1572 aa  69.7  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1822 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  31.82 
 
 		 1649 aa  61.2  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  33.64 
 
 		 1489 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  26.71 
 
 		 1822 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  24.39 
 
 		 1838 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  34.68 
 
 		 1474 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0229  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1252 aa  52  0.000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  27.52 
 
 		 1575 aa  51.2  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  30.63 
 
 		 1490 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0830  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1506 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  29.91 
 
 		 1629 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1724 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1652 aa  48.9  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  30.71 
 
 		 2622 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  32.95 
 
 		 1697 aa  48.5  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  32.06 
 
 		 1121 aa  48.5  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  29.33 
 
 		 309 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2819  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1392 aa  45.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.568772  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30630  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1413 aa  45.1  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  25.33 
 
 		 2098 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1440  RAP domain protein  27.78 
 
 		 1081 aa  44.3  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.112962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  25.33 
 
 		 2098 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  23.29 
 
 		 2104 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0899  DNA helicase  22.02 
 
 		 1412 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.403081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  23.38 
 
 		 1328 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 		 2098 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1670  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1207 aa  43.9  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  31.67 
 
 		 1523 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 		 2101 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 		 2101 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  23.85 
 
 		 1410 aa  42  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  28.44 
 
 		 1630 aa  41.6  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1671  hypothetical protein  28.75 
 
 		 90 aa  42  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3623  hypothetical protein  29.17 
 
 		 293 aa  41.6  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.510989  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  23.33 
 
 		 284 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0546  hypothetical protein  26.13 
 
 		 123 aa  41.6  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0884882  normal  0.680217 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2516  hypothetical protein  29.59 
 
 		 316 aa  41.2  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0713675  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  23.33 
 
 		 284 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  23.33 
 
 		 284 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>