217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1349 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  100 
 
 		 1822 aa  3715    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  58.32 
 
 		 1838 aa  1980    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  37.14 
 
 		 1822 aa  1207    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.42 
 
 		 1403 aa  365  5.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  36.81 
 
 		 1754 aa  283  3e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  36.74 
 
 		 2204 aa  281  7e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  37.3 
 
 		 2198 aa  276  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  34.35 
 
 		 1559 aa  273  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  37.3 
 
 		 1986 aa  270  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  35.01 
 
 		 1904 aa  270  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  35.35 
 
 		 2197 aa  269  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  35.62 
 
 		 1622 aa  268  1e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  36.08 
 
 		 1328 aa  266  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  36.84 
 
 		 2207 aa  265  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  35.17 
 
 		 2222 aa  263  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  33 
 
 		 1722 aa  262  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  36.13 
 
 		 1803 aa  261  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  33.67 
 
 		 1575 aa  258  7e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  35.52 
 
 		 1589 aa  258  9e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  34.31 
 
 		 1854 aa  257  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  35.4 
 
 		 1589 aa  257  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  37.01 
 
 		 1867 aa  256  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  35.98 
 
 		 1823 aa  255  7e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  36.07 
 
 		 1983 aa  253  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  35.29 
 
 		 1950 aa  253  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  35.42 
 
 		 1958 aa  253  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  35.36 
 
 		 2016 aa  254  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  36.88 
 
 		 1959 aa  253  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  32.94 
 
 		 1973 aa  252  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  35.65 
 
 		 1958 aa  252  4e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  36.27 
 
 		 2013 aa  251  7e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  35.14 
 
 		 1589 aa  251  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  34.08 
 
 		 1888 aa  249  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  34.78 
 
 		 1861 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  33.95 
 
 		 1945 aa  245  7e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  35.6 
 
 		 2002 aa  244  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  32.93 
 
 		 1572 aa  244  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  34.88 
 
 		 1980 aa  243  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  31.03 
 
 		 1593 aa  243  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  32.42 
 
 		 1853 aa  243  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  36.01 
 
 		 1877 aa  242  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  35.04 
 
 		 2759 aa  241  9e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  34.24 
 
 		 1571 aa  241  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  30.51 
 
 		 2045 aa  240  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  36.38 
 
 		 1991 aa  236  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  33.4 
 
 		 1801 aa  232  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  33.53 
 
 		 2098 aa  229  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  33.53 
 
 		 2098 aa  229  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  34.92 
 
 		 2125 aa  221  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  34.92 
 
 		 2125 aa  221  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  30.77 
 
 		 2096 aa  220  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  32.36 
 
 		 2101 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  32.36 
 
 		 2101 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  34.06 
 
 		 2123 aa  219  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  33.01 
 
 		 1559 aa  219  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  35.66 
 
 		 2005 aa  219  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 		 2098 aa  218  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  33 
 
 		 1363 aa  216  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  32.16 
 
 		 2104 aa  215  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  35.68 
 
 		 1296 aa  203  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  36.44 
 
 		 1328 aa  197  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0996  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  30.5 
 
 		 1312 aa  171  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  28.06 
 
 		 1367 aa  160  2e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  28.15 
 
 		 1285 aa  151  1.0000000000000001e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2575  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1400 aa  99.4  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000181544 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf701  putative ATP-binding helicase  30.54 
 
 		 1050 aa  98.6  1e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2868  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1407 aa  97.1  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.85474  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24380  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1670 aa  94.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.694198  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  30.27 
 
 		 946 aa  92  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  26.67 
 
 		 1649 aa  90.5  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  25.26 
 
 		 1697 aa  89.7  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  26.57 
 
 		 1489 aa  89.7  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  26.87 
 
 		 1557 aa  89  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  26.17 
 
 		 1410 aa  87.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  24.28 
 
 		 1629 aa  86.7  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  23.09 
 
 		 1121 aa  85.5  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1474 aa  85.1  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  28.46 
 
 		 1490 aa  84  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  32.79 
 
 		 905 aa  84.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  32.79 
 
 		 905 aa  84  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  23.42 
 
 		 1790 aa  82.8  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  26.63 
 
 		 903 aa  82.4  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1652 aa  82.4  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  28.22 
 
 		 907 aa  81.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  34.24 
 
 		 905 aa  80.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0830  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1506 aa  80.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  26.57 
 
 		 715 aa  80.1  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  33.33 
 
 		 900 aa  79.7  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  36.16 
 
 		 905 aa  79.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  36.16 
 
 		 905 aa  79.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  27.49 
 
 		 906 aa  79  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  26.75 
 
 		 1630 aa  79  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  25.05 
 
 		 1622 aa  79  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30630  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1413 aa  76.6  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  34.52 
 
 		 922 aa  73.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  26.2 
 
 		 1387 aa  72.4  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  29.54 
 
 		 1523 aa  72  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  37.23 
 
 		 932 aa  71.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  36.57 
 
 		 916 aa  71.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  33.33 
 
 		 908 aa  71.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>