209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2061 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  32.56 
 
 
2002 aa  943    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  36.62 
 
 
1754 aa  1019    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  100 
 
 
2013 aa  4143    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  33.88 
 
 
1983 aa  899    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  35.38 
 
 
1973 aa  1109    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  33.61 
 
 
1950 aa  1038    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  35.97 
 
 
1958 aa  1036    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  34.73 
 
 
1958 aa  1089    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  34.25 
 
 
1991 aa  1079    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  30.52 
 
 
1593 aa  627  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  31.05 
 
 
1888 aa  589  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  40.56 
 
 
2198 aa  586  1.0000000000000001e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  39.66 
 
 
2207 aa  572  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  39.32 
 
 
1803 aa  570  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  27.66 
 
 
1559 aa  570  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  29.32 
 
 
1575 aa  566  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  39.16 
 
 
2197 aa  560  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  39.52 
 
 
2222 aa  546  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  38.05 
 
 
1980 aa  546  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  46.96 
 
 
2016 aa  543  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  31.87 
 
 
1571 aa  543  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  36.58 
 
 
2204 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  34.06 
 
 
1945 aa  525  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  37 
 
 
1986 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  35.37 
 
 
1877 aa  465  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  43.21 
 
 
1959 aa  466  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  31.7 
 
 
1854 aa  451  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  36 
 
 
1622 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  41.18 
 
 
1861 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  34.44 
 
 
2759 aa  415  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  31.85 
 
 
1853 aa  413  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  38.77 
 
 
1823 aa  406  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  31.96 
 
 
1867 aa  395  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  39.65 
 
 
1722 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  32.15 
 
 
1572 aa  392  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  33.17 
 
 
2125 aa  390  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  33.17 
 
 
2125 aa  390  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  32.49 
 
 
1589 aa  387  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  33.97 
 
 
1328 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  32.11 
 
 
1589 aa  380  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  32 
 
 
1559 aa  379  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  31.98 
 
 
1589 aa  376  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  36.36 
 
 
2096 aa  372  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  42.97 
 
 
1904 aa  374  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  41.93 
 
 
2005 aa  344  1e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  40.55 
 
 
1801 aa  341  7e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  33.1 
 
 
2045 aa  331  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34.28 
 
 
1403 aa  321  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  38.16 
 
 
2123 aa  313  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  36.27 
 
 
1822 aa  251  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  34.75 
 
 
1363 aa  251  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  35.09 
 
 
1838 aa  244  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  31.41 
 
 
1822 aa  231  8e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  30.93 
 
 
1328 aa  227  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  32.24 
 
 
2104 aa  211  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  30.78 
 
 
2098 aa  208  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  30.78 
 
 
2098 aa  207  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  31.6 
 
 
2101 aa  205  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  31.6 
 
 
2101 aa  205  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  32.77 
 
 
1296 aa  204  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  31.6 
 
 
2098 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  30.07 
 
 
1367 aa  188  7e-46  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0996  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  35.14 
 
 
1312 aa  180  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2819  hypothetical protein  25.84 
 
 
1392 aa  167  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.568772  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0830  hypothetical protein  28.63 
 
 
1506 aa  166  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  32.39 
 
 
1285 aa  163  3e-38  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30630  hypothetical protein  24.17 
 
 
1413 aa  157  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196712  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1939  DNA helicase-related protein  30.27 
 
 
402 aa  155  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0899  DNA helicase  25.05 
 
 
1412 aa  149  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.403081  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1974  hypothetical protein  24.75 
 
 
1499 aa  144  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf701  putative ATP-binding helicase  26.83 
 
 
1050 aa  125  7e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  27.91 
 
 
1629 aa  123  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2868  hypothetical protein  27.33 
 
 
1407 aa  117  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.85474  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  27.37 
 
 
1489 aa  115  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  27.29 
 
 
1490 aa  114  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2575  hypothetical protein  27.1 
 
 
1400 aa  114  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000181544 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  27.79 
 
 
1697 aa  111  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  28.54 
 
 
1649 aa  106  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  26.38 
 
 
1575 aa  105  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  28.51 
 
 
1630 aa  102  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  26.61 
 
 
1474 aa  101  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  26.65 
 
 
1622 aa  99.8  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1076  hypothetical protein  34.71 
 
 
194 aa  99.8  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000229233  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  24.74 
 
 
1410 aa  99  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  26.41 
 
 
1724 aa  91.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  26.09 
 
 
1790 aa  91.3  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  27.06 
 
 
1523 aa  89  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  26.67 
 
 
905 aa  87.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  28.71 
 
 
1652 aa  88.2  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  30.33 
 
 
906 aa  86.3  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  26.99 
 
 
907 aa  85.1  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  26.48 
 
 
905 aa  85.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24380  hypothetical protein  23.31 
 
 
1670 aa  84.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.694198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  28.21 
 
 
900 aa  84.7  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  28.73 
 
 
903 aa  84.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  25.68 
 
 
905 aa  83.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  26.27 
 
 
905 aa  83.2  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  27.31 
 
 
1387 aa  82.8  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  25.91 
 
 
905 aa  82.8  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16460  hypothetical protein  22.64 
 
 
1254 aa  82.4  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>