159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1991 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  39.69 
 
 		 1575 aa  761    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3745  superfamily I DNA/RNA helicase  38.28 
 
 		 1694 aa  676    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  48.61 
 
 		 1410 aa  1131    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  100 
 
 		 1387 aa  2753    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  50.71 
 
 		 2622 aa  498  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  30.92 
 
 		 1790 aa  469  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  33.14 
 
 		 1489 aa  462  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  37.76 
 
 		 1622 aa  377  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  32.71 
 
 		 1724 aa  372  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  35.28 
 
 		 1630 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  34.4 
 
 		 1474 aa  312  2.9999999999999997e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  37.3 
 
 		 1652 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  33.74 
 
 		 1629 aa  247  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  34.27 
 
 		 1697 aa  241  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  34.71 
 
 		 1649 aa  231  5e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  30.77 
 
 		 1557 aa  150  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  29.15 
 
 		 1490 aa  128  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  31.83 
 
 		 905 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  31.83 
 
 		 905 aa  116  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  28.77 
 
 		 900 aa  116  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  31.86 
 
 		 905 aa  115  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  29.84 
 
 		 905 aa  115  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  29.4 
 
 		 2002 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  31.08 
 
 		 905 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  30.28 
 
 		 907 aa  112  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  28.53 
 
 		 908 aa  109  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1722 aa  108  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  27.33 
 
 		 1959 aa  107  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  27.18 
 
 		 2204 aa  106  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  28.34 
 
 		 2207 aa  105  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  27.92 
 
 		 1986 aa  104  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1328 aa  104  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  27.84 
 
 		 1980 aa  104  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  27.71 
 
 		 2123 aa  103  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  28.43 
 
 		 903 aa  102  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1904 aa  101  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  27.98 
 
 		 1983 aa  100  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  24.11 
 
 		 1121 aa  100  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  25.78 
 
 		 1622 aa  99  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  27.29 
 
 		 1861 aa  99  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  27.5 
 
 		 1803 aa  98.6  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.03 
 
 		 1403 aa  96.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  25 
 
 		 2197 aa  95.9  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  26.76 
 
 		 1945 aa  94  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1888 aa  94.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  25.22 
 
 		 2198 aa  94  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  25.93 
 
 		 2098 aa  93.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  25.93 
 
 		 2098 aa  92.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1440  RAP domain protein  25.22 
 
 		 1081 aa  92  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.112962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  24.55 
 
 		 2096 aa  91.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  26.77 
 
 		 906 aa  91.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  25.92 
 
 		 1958 aa  91.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1575 aa  91.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  26.82 
 
 		 2016 aa  91.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  25.64 
 
 		 1991 aa  90.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  26.32 
 
 		 1973 aa  89.4  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  27.13 
 
 		 1877 aa  89.4  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  25.5 
 
 		 2045 aa  88.6  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  24.89 
 
 		 1559 aa  88.6  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  48.86 
 
 		 1523 aa  87.8  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  30.71 
 
 		 932 aa  86.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  27.62 
 
 		 1853 aa  85.9  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  25.9 
 
 		 1593 aa  86.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  25.72 
 
 		 2222 aa  85.5  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  26.73 
 
 		 2098 aa  85.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1854 aa  85.1  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1823 aa  84.3  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1801 aa  84.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  26.73 
 
 		 2101 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  27.11 
 
 		 2125 aa  84.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  26.73 
 
 		 2101 aa  84.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  27.11 
 
 		 2125 aa  84.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  27.75 
 
 		 1950 aa  84  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  27.06 
 
 		 1958 aa  82.8  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  27.31 
 
 		 2013 aa  82.4  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  26.14 
 
 		 2104 aa  82  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  26.85 
 
 		 1559 aa  81.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  30.45 
 
 		 946 aa  80.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  30.34 
 
 		 916 aa  79.7  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.73 
 
 		 1363 aa  78.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1589 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1589 aa  77  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  23.58 
 
 		 1754 aa  76.6  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  26.06 
 
 		 1589 aa  76.3  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  30.04 
 
 		 922 aa  75.9  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  24.29 
 
 		 2759 aa  75.1  0.000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  26.26 
 
 		 1571 aa  75.1  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  25.29 
 
 		 1296 aa  74.3  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1822 aa  72.4  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2605  hypothetical protein  31.52 
 
 		 1680 aa  72  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.6809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1572 aa  70.1  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  20.95 
 
 		 1367 aa  70.1  0.0000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  24.5 
 
 		 1328 aa  68.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  26.67 
 
 		 1867 aa  67.8  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  25.61 
 
 		 629 aa  67  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  25.46 
 
 		 925 aa  65.5  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.06 
 
 		 1196 aa  64.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.12 
 
 		 752 aa  65.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  30.03 
 
 		 1062 aa  63.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.13 
 
 		 1203 aa  63.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>