175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1108 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  46.82 
 
 		 1823 aa  1441    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  26.76 
 
 		 1622 aa  667    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  100 
 
 		 1867 aa  3709    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  37.19 
 
 		 1593 aa  468  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  33.94 
 
 		 2759 aa  465  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  37.72 
 
 		 1991 aa  444  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  36.91 
 
 		 1877 aa  447  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  36.99 
 
 		 1861 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  36.38 
 
 		 1950 aa  442  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  35.59 
 
 		 1958 aa  437  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  35.84 
 
 		 1958 aa  437  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  32.46 
 
 		 1854 aa  432  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  41.13 
 
 		 2016 aa  433  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  38.79 
 
 		 1754 aa  429  1e-118  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  42.17 
 
 		 2222 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  35.81 
 
 		 1559 aa  426  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1575 aa  422  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  31.74 
 
 		 1559 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  39.68 
 
 		 2198 aa  420  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  37.08 
 
 		 2197 aa  420  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  36.33 
 
 		 1945 aa  420  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  37.06 
 
 		 1980 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1328 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  35.54 
 
 		 2207 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  33.64 
 
 		 1973 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  40.24 
 
 		 2204 aa  412  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  34.53 
 
 		 1803 aa  406  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  32.08 
 
 		 2013 aa  404  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  43.03 
 
 		 1571 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  34.66 
 
 		 1888 aa  397  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  33.47 
 
 		 1589 aa  395  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  32.3 
 
 		 1853 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  33.42 
 
 		 1589 aa  393  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1589 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  39.57 
 
 		 2096 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  34.37 
 
 		 1986 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  39.86 
 
 		 1904 aa  383  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  32.03 
 
 		 1572 aa  383  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  35.56 
 
 		 1983 aa  374  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  31.77 
 
 		 2002 aa  369  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  33.51 
 
 		 1959 aa  350  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  38.55 
 
 		 2045 aa  350  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  37.06 
 
 		 1722 aa  350  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  36.16 
 
 		 1801 aa  337  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  40.46 
 
 		 2123 aa  332  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  37.22 
 
 		 1403 aa  321  7e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  33.38 
 
 		 2125 aa  314  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  33.38 
 
 		 2125 aa  314  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  36.35 
 
 		 2005 aa  300  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  37.82 
 
 		 1822 aa  270  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  37.15 
 
 		 1838 aa  270  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  34.72 
 
 		 1822 aa  262  5.0000000000000005e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  33.46 
 
 		 1363 aa  226  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  33.55 
 
 		 1328 aa  218  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  33.09 
 
 		 2098 aa  208  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  32.91 
 
 		 2098 aa  207  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  36.41 
 
 		 1296 aa  204  9e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  33.4 
 
 		 2101 aa  202  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  33.4 
 
 		 2101 aa  202  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  31.81 
 
 		 2104 aa  201  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  33.02 
 
 		 2098 aa  200  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0996  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.19 
 
 		 1312 aa  187  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  26.39 
 
 		 1367 aa  146  4e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30630  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1413 aa  145  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.196712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2575  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1400 aa  145  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000181544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2868  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1407 aa  143  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.85474  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0830  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1506 aa  138  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  33.12 
 
 		 1285 aa  137  1.9999999999999998e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0899  DNA helicase  26.7 
 
 		 1412 aa  125  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.403081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  29.35 
 
 		 1489 aa  125  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2819  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1392 aa  125  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.568772  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  27.19 
 
 		 1474 aa  110  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  30.09 
 
 		 1649 aa  109  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  29.98 
 
 		 1490 aa  106  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  28.18 
 
 		 1697 aa  104  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  28.51 
 
 		 1629 aa  103  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16460  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1254 aa  103  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1076  hypothetical protein  34.34 
 
 		 194 aa  102  9e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000229233  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1974  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1499 aa  101  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  30.48 
 
 		 2622 aa  96.3  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf701  putative ATP-binding helicase  21.94 
 
 		 1050 aa  94.4  2e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  28.27 
 
 		 1622 aa  92.8  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3745  superfamily I DNA/RNA helicase  30.13 
 
 		 1694 aa  90.9  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  29.18 
 
 		 1410 aa  90.9  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  24.1 
 
 		 1121 aa  89  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  25.05 
 
 		 1557 aa  88.6  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1652 aa  85.9  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  28.51 
 
 		 1575 aa  86.3  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  28.77 
 
 		 1630 aa  84.7  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24380  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1670 aa  84.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.694198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  26.64 
 
 		 1790 aa  81.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  27.81 
 
 		 903 aa  81.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  30.31 
 
 		 629 aa  79.7  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  28.19 
 
 		 907 aa  77.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  27.59 
 
 		 905 aa  77.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  26.5 
 
 		 906 aa  77  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  29.97 
 
 		 946 aa  75.9  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  27.93 
 
 		 905 aa  75.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  27.63 
 
 		 1387 aa  73.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1670  hypothetical protein  27.9 
 
 		 1207 aa  74.3  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>