251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1672 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  100 
 
 		 946 aa  1892    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.87 
 
 		 1203 aa  173  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  39.53 
 
 		 903 aa  164  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.47 
 
 		 1196 aa  160  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  33.33 
 
 		 905 aa  153  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  33.33 
 
 		 905 aa  153  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  32.77 
 
 		 900 aa  152  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  32.49 
 
 		 907 aa  151  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  32.96 
 
 		 908 aa  148  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  31.65 
 
 		 905 aa  146  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  31.74 
 
 		 905 aa  146  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  31.65 
 
 		 905 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  22.65 
 
 		 1132 aa  145  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  32.27 
 
 		 906 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  23.67 
 
 		 1121 aa  122  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  24.58 
 
 		 1002 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1440  RAP domain protein  20.48 
 
 		 1081 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.112962  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  28.29 
 
 		 932 aa  110  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.71 
 
 		 1363 aa  107  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  25.65 
 
 		 925 aa  104  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  28.12 
 
 		 1185 aa  100  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.27 
 
 		 1403 aa  99  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0693  superfamily protein I DNA/RNA helicase  29.9 
 
 		 934 aa  97.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  25.29 
 
 		 916 aa  96.3  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  26.55 
 
 		 1062 aa  95.5  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  29.62 
 
 		 2204 aa  92.4  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  30.27 
 
 		 1822 aa  92  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  30.65 
 
 		 2098 aa  92  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  30.65 
 
 		 2098 aa  91.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  26.92 
 
 		 922 aa  91.3  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  31.1 
 
 		 914 aa  91.3  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  32.37 
 
 		 1490 aa  90.5  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  29.59 
 
 		 1790 aa  90.5  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  31.67 
 
 		 1489 aa  90.5  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  28.46 
 
 		 2198 aa  89.4  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  27.3 
 
 		 1328 aa  89.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  28.66 
 
 		 1959 aa  89  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  30.29 
 
 		 2197 aa  88.6  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  29.04 
 
 		 1557 aa  88.2  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  30.17 
 
 		 758 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  26.07 
 
 		 958 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  27.97 
 
 		 1838 aa  86.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  29.68 
 
 		 1754 aa  86.7  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  29.25 
 
 		 1622 aa  85.5  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1652 aa  85.9  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  28.96 
 
 		 629 aa  85.1  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  27.11 
 
 		 2207 aa  85.1  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  27.43 
 
 		 2016 aa  85.1  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  28.73 
 
 		 2002 aa  84.7  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1474 aa  84  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  25.91 
 
 		 1296 aa  84  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  28.82 
 
 		 928 aa  83.2  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  30.77 
 
 		 1980 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  33.53 
 
 		 1575 aa  83.2  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  27.12 
 
 		 795 aa  83.6  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  29.22 
 
 		 1958 aa  82.8  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  26.99 
 
 		 1983 aa  82.4  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  28.39 
 
 		 1803 aa  82  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  27.12 
 
 		 1171 aa  81.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  26.9 
 
 		 1630 aa  81.6  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  30.3 
 
 		 1190 aa  81.3  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  30.45 
 
 		 1387 aa  81.3  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1889  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1092 aa  80.5  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  28.12 
 
 		 1038 aa  80.9  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  28.53 
 
 		 1973 aa  80.5  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  27.96 
 
 		 1157 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  28.18 
 
 		 2222 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  28.94 
 
 		 2101 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  28.94 
 
 		 2101 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  27.85 
 
 		 1999 aa  79.7  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  24.17 
 
 		 2013 aa  79.3  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  24.57 
 
 		 914 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3443  superfamily I DNA/RNA helicase  27.18 
 
 		 1061 aa  79  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  28.94 
 
 		 2098 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  28.88 
 
 		 2104 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  30.06 
 
 		 1950 aa  78.6  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  27.43 
 
 		 1178 aa  78.6  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  30.06 
 
 		 1958 aa  78.2  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  30.42 
 
 		 1523 aa  77.8  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  28.62 
 
 		 1629 aa  78.2  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  28.09 
 
 		 1724 aa  77.4  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  26.37 
 
 		 1697 aa  77  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0774  ATP-binding protein  27.15 
 
 		 904 aa  77  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00601607  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  28.7 
 
 		 2125 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  32.41 
 
 		 752 aa  77.4  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  28.7 
 
 		 2125 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  26.9 
 
 		 1986 aa  77.4  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  26.64 
 
 		 1087 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  30.06 
 
 		 1220 aa  77  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  26.88 
 
 		 635 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  25.67 
 
 		 1945 aa  75.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3661  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits  29.61 
 
 		 1035 aa  75.5  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  27.76 
 
 		 2123 aa  74.7  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1328 aa  74.7  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  26.67 
 
 		 1090 aa  74.3  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3992  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1126 aa  73.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4016  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1100 aa  74.3  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  29.11 
 
 		 606 aa  73.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1722 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  27.44 
 
 		 797 aa  73.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>