207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_81113 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  100 
 
 
1999 aa  4129    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  35.57 
 
 
2245 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  33.46 
 
 
795 aa  267  2e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  29.46 
 
 
1077 aa  218  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  33.78 
 
 
655 aa  216  2.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  32.69 
 
 
650 aa  212  7e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  29.57 
 
 
466 aa  211  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  32.89 
 
 
650 aa  210  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  30.54 
 
 
643 aa  205  7e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  36.68 
 
 
1189 aa  199  4.0000000000000005e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  30.7 
 
 
1090 aa  197  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  31.03 
 
 
797 aa  196  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  36.16 
 
 
479 aa  195  8e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  31.09 
 
 
754 aa  195  9e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  30.75 
 
 
952 aa  194  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  29.68 
 
 
636 aa  188  8e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  39.45 
 
 
315 aa  187  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  33.06 
 
 
609 aa  184  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  29.4 
 
 
622 aa  183  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  29.4 
 
 
622 aa  181  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  29.66 
 
 
635 aa  180  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  27.99 
 
 
748 aa  179  5e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  29.4 
 
 
632 aa  178  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  29.43 
 
 
553 aa  176  5.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  29.43 
 
 
553 aa  176  5.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  28.14 
 
 
633 aa  175  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  36.96 
 
 
388 aa  175  9e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  29.51 
 
 
716 aa  174  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  28.16 
 
 
464 aa  173  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  27.32 
 
 
636 aa  172  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  29.1 
 
 
619 aa  171  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  31.39 
 
 
611 aa  169  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  30.16 
 
 
651 aa  168  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  29.59 
 
 
633 aa  168  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  27 
 
 
633 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  27.49 
 
 
633 aa  166  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  39.5 
 
 
268 aa  166  5.0000000000000005e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  28.54 
 
 
686 aa  156  2.9999999999999998e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  26.32 
 
 
1099 aa  133  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  29.43 
 
 
1048 aa  119  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  28.79 
 
 
934 aa  119  7.999999999999999e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  26.33 
 
 
715 aa  118  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  26.15 
 
 
1585 aa  117  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  26.15 
 
 
1585 aa  117  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  27.38 
 
 
902 aa  117  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  28.02 
 
 
986 aa  111  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.39 
 
 
752 aa  110  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  24.69 
 
 
1620 aa  106  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  30.3 
 
 
901 aa  105  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  28.57 
 
 
902 aa  105  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  26.01 
 
 
1427 aa  103  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  29.72 
 
 
1097 aa  102  9e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  26.36 
 
 
585 aa  101  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  24.57 
 
 
944 aa  99.8  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  27.67 
 
 
1653 aa  99.8  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  26.71 
 
 
486 aa  99  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  26.52 
 
 
521 aa  98.6  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  22.83 
 
 
1190 aa  97.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  28.17 
 
 
283 aa  97.4  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07014  DEAD helicases superfamily protein (Aquarius), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04350)  27.56 
 
 
1422 aa  96.7  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  28.46 
 
 
606 aa  96.3  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33296  predicted protein  27.08 
 
 
634 aa  95.9  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  25.66 
 
 
941 aa  95.1  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  26.13 
 
 
769 aa  95.5  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  27.06 
 
 
1038 aa  94.7  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  26.18 
 
 
759 aa  94  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  26.77 
 
 
1018 aa  93.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  25.89 
 
 
769 aa  93.6  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  25.89 
 
 
759 aa  93.2  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  25.89 
 
 
759 aa  93.2  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  25.89 
 
 
759 aa  92.8  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  25.69 
 
 
759 aa  92.8  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  25.69 
 
 
759 aa  91.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  25.69 
 
 
759 aa  92  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  25.15 
 
 
759 aa  91.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  26.18 
 
 
922 aa  89.4  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  25.6 
 
 
2310 aa  87.8  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.24 
 
 
1203 aa  87.4  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  25.3 
 
 
759 aa  87.4  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  27.3 
 
 
1651 aa  85.9  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  24.64 
 
 
1108 aa  85.9  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14090  predicted protein  39.34 
 
 
219 aa  85.5  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  30.81 
 
 
237 aa  85.1  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  25.9 
 
 
1284 aa  84  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  25.32 
 
 
916 aa  80.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  27.74 
 
 
297 aa  80.9  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  26.87 
 
 
1790 aa  79.7  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  27.85 
 
 
946 aa  79.7  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  23.23 
 
 
903 aa  75.5  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  27.52 
 
 
1198 aa  74.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  25.28 
 
 
1082 aa  74.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  22.92 
 
 
906 aa  73.9  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  28.4 
 
 
1408 aa  73.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  23.13 
 
 
1002 aa  72.8  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.57 
 
 
1196 aa  72.8  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  24.28 
 
 
1228 aa  72.8  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  26.79 
 
 
932 aa  72.4  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  26.74 
 
 
1250 aa  70.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  26.21 
 
 
1126 aa  70.5  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  24.49 
 
 
1151 aa  70.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>