53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0693 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0693  superfamily protein I DNA/RNA helicase  100 
 
 		 934 aa  1835    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3661  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits  36.3 
 
 		 1035 aa  317  8e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.07 
 
 		 1203 aa  182  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.63 
 
 		 1196 aa  167  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  29.9 
 
 		 946 aa  97.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  24.07 
 
 		 905 aa  92.4  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  24.21 
 
 		 905 aa  90.9  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  24.11 
 
 		 905 aa  87.8  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  24.11 
 
 		 905 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  23.77 
 
 		 905 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  26.69 
 
 		 906 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  22.95 
 
 		 900 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  25.07 
 
 		 1121 aa  78.6  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  21.87 
 
 		 907 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  24.18 
 
 		 903 aa  74.7  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  21.97 
 
 		 908 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  23.85 
 
 		 1622 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  27.15 
 
 		 629 aa  64.7  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  30.11 
 
 		 1387 aa  60.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1440  RAP domain protein  18.22 
 
 		 1081 aa  60.5  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.112962  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  24.02 
 
 		 1999 aa  58.9  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  24.34 
 
 		 1790 aa  58.9  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  24.7 
 
 		 1620 aa  58.5  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5307  KAP P-loop domain-containing protein  32.61 
 
 		 770 aa  56.6  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51517  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  22.53 
 
 		 1077 aa  55.1  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  23.98 
 
 		 797 aa  53.5  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  30.77 
 
 		 651 aa  52  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  24.78 
 
 		 1111 aa  51.6  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  24.93 
 
 		 1490 aa  51.2  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.59 
 
 		 1403 aa  50.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  22.06 
 
 		 1630 aa  50.4  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  27.27 
 
 		 1523 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  25.33 
 
 		 1861 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  25.77 
 
 		 1651 aa  48.9  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  28.72 
 
 		 2016 aa  48.9  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  23.9 
 
 		 1296 aa  48.5  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  32 
 
 		 2002 aa  48.1  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  28.84 
 
 		 1132 aa  48.1  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.11 
 
 		 752 aa  47.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  21.33 
 
 		 1099 aa  47.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  26.98 
 
 		 1575 aa  46.6  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  29.23 
 
 		 1973 aa  47  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  25.89 
 
 		 922 aa  46.2  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  28.3 
 
 		 553 aa  46.2  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  27.12 
 
 		 388 aa  45.8  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  28.3 
 
 		 553 aa  46.2  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.93 
 
 		 1363 aa  45.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.36 
 
 		 1240 aa  45.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  25.38 
 
 		 1986 aa  45.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  30.17 
 
 		 622 aa  44.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  33.72 
 
 		 2045 aa  44.7  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  25.66 
 
 		 1189 aa  44.7  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  23.64 
 
 		 2096 aa  44.7  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>