246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5029 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  100 
 
 		 1620 aa  3322    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  28.18 
 
 		 1651 aa  530  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  39.41 
 
 		 1585 aa  396  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  39.41 
 
 		 1585 aa  396  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  27.9 
 
 		 1284 aa  127  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  30.45 
 
 		 1653 aa  123  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  23.99 
 
 		 650 aa  116  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  23.99 
 
 		 650 aa  115  7.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  31.46 
 
 		 941 aa  114  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  29.04 
 
 		 748 aa  112  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  25.78 
 
 		 1099 aa  112  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  24.96 
 
 		 754 aa  112  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  31.13 
 
 		 1126 aa  111  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1018 aa  110  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  31.91 
 
 		 609 aa  107  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  25.08 
 
 		 1999 aa  106  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  28.81 
 
 		 585 aa  106  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  28.39 
 
 		 611 aa  105  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  32.84 
 
 		 651 aa  103  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  27.74 
 
 		 1108 aa  103  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  31.05 
 
 		 619 aa  102  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  29.7 
 
 		 1090 aa  101  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  28.39 
 
 		 1077 aa  101  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  29.96 
 
 		 622 aa  100  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  27.67 
 
 		 636 aa  99.8  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9531  helicase ATP-binding protein  27.69 
 
 		 1137 aa  99.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  29.47 
 
 		 2245 aa  99  6e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  29.96 
 
 		 622 aa  98.6  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  28.62 
 
 		 479 aa  98.6  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  29.97 
 
 		 388 aa  97.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  27.25 
 
 		 1284 aa  96.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  26.86 
 
 		 797 aa  96.3  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  26.93 
 
 		 952 aa  95.9  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  28.27 
 
 		 1175 aa  95.9  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  26 
 
 		 632 aa  94.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  27.98 
 
 		 2310 aa  94  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.35 
 
 		 752 aa  94  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  27.92 
 
 		 629 aa  94  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  26.07 
 
 		 635 aa  93.6  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  27.08 
 
 		 655 aa  92.4  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  25.71 
 
 		 1048 aa  92  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  26.12 
 
 		 643 aa  90.5  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  26.43 
 
 		 636 aa  90.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  27.13 
 
 		 486 aa  90.9  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07014  DEAD helicases superfamily protein (Aquarius), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04350)  23.75 
 
 		 1422 aa  90.1  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  26.82 
 
 		 633 aa  89.4  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  29.83 
 
 		 553 aa  89.4  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  29.83 
 
 		 553 aa  89.4  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  26.94 
 
 		 633 aa  89  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  26.37 
 
 		 466 aa  88.2  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  24.86 
 
 		 716 aa  87.4  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  30.33 
 
 		 686 aa  87  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  26.32 
 
 		 633 aa  86.7  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  24.5 
 
 		 1190 aa  86.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  28.62 
 
 		 1189 aa  85.1  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  26.6 
 
 		 795 aa  84.3  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  25.83 
 
 		 633 aa  82.8  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  29.45 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  26.28 
 
 		 606 aa  82.8  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  30.1 
 
 		 268 aa  82.4  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  23.49 
 
 		 1427 aa  82.8  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1989  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.92 
 
 		 605 aa  81.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0620689  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.19 
 
 		 1203 aa  79.7  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  21.86 
 
 		 1002 aa  77  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  29.37 
 
 		 934 aa  75.5  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1215 aa  74.7  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  27.48 
 
 		 902 aa  74.7  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  27.19 
 
 		 715 aa  74.7  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  26.73 
 
 		 1097 aa  74.3  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  23.29 
 
 		 944 aa  74.3  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.42 
 
 		 1196 aa  73.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  27.18 
 
 		 922 aa  73.9  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  27.18 
 
 		 1087 aa  73.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  27.12 
 
 		 986 aa  73.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  28.1 
 
 		 902 aa  73.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1220 aa  73.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  24.91 
 
 		 932 aa  73.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  28.21 
 
 		 1250 aa  73.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  27.1 
 
 		 1038 aa  72.8  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  26.26 
 
 		 916 aa  72.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  30.74 
 
 		 1324 aa  72.4  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3992  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1126 aa  72  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  26.61 
 
 		 1212 aa  71.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4321  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1126 aa  70.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  27.36 
 
 		 1094 aa  70.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  26.69 
 
 		 1185 aa  70.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  29.56 
 
 		 901 aa  70.1  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  25.71 
 
 		 1163 aa  70.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  25.93 
 
 		 1151 aa  70.1  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  26.26 
 
 		 297 aa  69.7  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  25.17 
 
 		 946 aa  69.3  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  26.04 
 
 		 1408 aa  68.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4016  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1100 aa  68.6  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  28.52 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  28.34 
 
 		 521 aa  68.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1822 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1215 aa  68.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1139 aa  68.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  25.38 
 
 		 975 aa  67.8  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  25.17 
 
 		 1270 aa  67  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>