64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5307 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5307  KAP P-loop domain-containing protein  100 
 
 		 770 aa  1559    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  25.93 
 
 		 628 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  25.93 
 
 		 628 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  25.93 
 
 		 628 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  24.95 
 
 		 622 aa  86.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  25.96 
 
 		 644 aa  84.7  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  24.12 
 
 		 650 aa  84.3  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.93 
 
 		 1196 aa  82.4  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  25.06 
 
 		 647 aa  81.6  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  25.72 
 
 		 615 aa  76.6  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  23.09 
 
 		 623 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  25.11 
 
 		 925 aa  70.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  24 
 
 		 594 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  24.52 
 
 		 671 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0149  hypothetical protein  27.08 
 
 		 787 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  22.32 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.74 
 
 		 1203 aa  62.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  26.54 
 
 		 601 aa  60.8  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1503  diguanylate phosphodiesterase  26.34 
 
 		 731 aa  60.1  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.293201  hitchhiker  0.000197979 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0414  KAP P-loop domain-containing protein  23.86 
 
 		 565 aa  60.1  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  24.31 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  25.08 
 
 		 564 aa  58.2  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2745  hypothetical protein  34.82 
 
 		 1065 aa  57.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00032694  normal  0.196454 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3525  KAP P-loop domain-containing protein  22.25 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.88 
 
 		 393 aa  57.4  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0693  superfamily protein I DNA/RNA helicase  32.61 
 
 		 934 aa  57  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.78 
 
 		 316 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  24.32 
 
 		 471 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  26.61 
 
 		 328 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2433  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.83 
 
 		 445 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  25.73 
 
 		 591 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.8 
 
 		 309 aa  54.7  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3681  KAP P-loop domain-containing protein  21.99 
 
 		 488 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.34 
 
 		 445 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.46 
 
 		 316 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  23.64 
 
 		 611 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.44 
 
 		 324 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.14 
 
 		 578 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0185927  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2638  KAP P-loop domain-containing protein  21.3 
 
 		 459 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0998856 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2413  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.14 
 
 		 579 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588037  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23 
 
 		 830 aa  52.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1545  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.7 
 
 		 578 aa  51.6  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  30.13 
 
 		 902 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6789  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.37 
 
 		 1554 aa  51.2  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3760  KAP P-loop domain-containing protein  25.36 
 
 		 542 aa  50.8  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0432517 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5045  KAP P-loop domain protein  21.34 
 
 		 1093 aa  50.8  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0382  putative Chase2 sensor protein  30.07 
 
 		 783 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  21.7 
 
 		 463 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  24.59 
 
 		 461 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  21.7 
 
 		 463 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2534  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.53 
 
 		 941 aa  48.9  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.687385  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  23.05 
 
 		 715 aa  48.5  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0472  hypothetical protein  22.3 
 
 		 510 aa  48.5  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3806  KAP P-loop domain protein  21.58 
 
 		 579 aa  48.1  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.58 
 
 		 830 aa  48.1  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3731  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.55 
 
 		 652 aa  48.1  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.016109  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0361  Clp domain-containing protein  29.1 
 
 		 765 aa  47.8  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.722952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.84 
 
 		 457 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168227 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  22.82 
 
 		 728 aa  45.8  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.5 
 
 		 495 aa  45.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.84 
 
 		 1711 aa  45.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0709  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1064 aa  45.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  34.52 
 
 		 518 aa  45.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.15 
 
 		 657 aa  44.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.814877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>