241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4371 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  79.29 
 
 
651 aa  872    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  96.95 
 
 
619 aa  1080    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  98.55 
 
 
622 aa  1171    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  100 
 
 
622 aa  1187    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  37.15 
 
 
754 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  37.11 
 
 
636 aa  366  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  33.84 
 
 
655 aa  357  2.9999999999999997e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  35.62 
 
 
635 aa  357  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  35.73 
 
 
636 aa  355  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  39.67 
 
 
609 aa  353  7e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  36.59 
 
 
611 aa  347  3e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  34.55 
 
 
632 aa  337  5e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  35.89 
 
 
650 aa  330  4e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  34.89 
 
 
650 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  31.1 
 
 
643 aa  301  3e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  34.6 
 
 
686 aa  284  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  30.81 
 
 
716 aa  268  2e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  29.03 
 
 
633 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  28.42 
 
 
633 aa  261  2e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  29.28 
 
 
633 aa  261  3e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  29.28 
 
 
633 aa  261  3e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  39.11 
 
 
466 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  33.81 
 
 
748 aa  251  2e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  37.21 
 
 
464 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  33.83 
 
 
797 aa  226  6e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  35.4 
 
 
1077 aa  221  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  30.74 
 
 
1090 aa  220  7e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  34 
 
 
952 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  28.63 
 
 
1097 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  36.65 
 
 
986 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  35.61 
 
 
902 aa  191  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  38.34 
 
 
752 aa  190  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  33.73 
 
 
479 aa  190  7e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  31.21 
 
 
1048 aa  183  9.000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  29.4 
 
 
1999 aa  182  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  44.4 
 
 
901 aa  176  9e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  31.7 
 
 
2245 aa  165  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  40.07 
 
 
902 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  37.87 
 
 
1189 aa  163  9e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  41.09 
 
 
268 aa  160  5e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  32.81 
 
 
388 aa  158  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  41.46 
 
 
934 aa  153  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  29.64 
 
 
486 aa  150  7e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  32.28 
 
 
629 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  32.07 
 
 
553 aa  145  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  32.07 
 
 
553 aa  145  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  32.27 
 
 
795 aa  143  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  25.52 
 
 
1099 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  40.17 
 
 
237 aa  141  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  37.85 
 
 
941 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  30.05 
 
 
585 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  33.9 
 
 
315 aa  139  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  33.68 
 
 
606 aa  131  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  27.4 
 
 
715 aa  125  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  27.77 
 
 
759 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  27.59 
 
 
759 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  27.59 
 
 
759 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  27.59 
 
 
759 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  35.74 
 
 
283 aa  121  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  27.12 
 
 
759 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  26.86 
 
 
769 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  26.76 
 
 
759 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  27.26 
 
 
759 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  27.12 
 
 
759 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  26.94 
 
 
759 aa  115  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  27.97 
 
 
769 aa  114  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  33.11 
 
 
1018 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  27.83 
 
 
2310 aa  107  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  29.96 
 
 
1620 aa  100  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  27.45 
 
 
1190 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  27.68 
 
 
1653 aa  99.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  31.11 
 
 
1427 aa  97.8  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  29.91 
 
 
944 aa  97.1  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  28.43 
 
 
1038 aa  96.3  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  28.54 
 
 
521 aa  95.9  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  26.49 
 
 
1175 aa  95.5  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  27.98 
 
 
1271 aa  93.6  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  29.07 
 
 
297 aa  93.6  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  24.71 
 
 
1284 aa  92.8  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  29.82 
 
 
916 aa  92.8  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  27.68 
 
 
922 aa  92  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  25.35 
 
 
1126 aa  89  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07014  DEAD helicases superfamily protein (Aquarius), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04350)  28.3 
 
 
1422 aa  88.6  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  29.13 
 
 
1427 aa  88.2  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  25.54 
 
 
1116 aa  87.4  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  24.25 
 
 
1275 aa  87  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  27.96 
 
 
1585 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  27.96 
 
 
1585 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  31.1 
 
 
659 aa  84.3  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  33.01 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  26.79 
 
 
932 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.92 
 
 
1196 aa  79.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  25.27 
 
 
925 aa  79.7  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  29.66 
 
 
1108 aa  79.3  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  24.18 
 
 
1111 aa  78.2  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  28.62 
 
 
903 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.29 
 
 
1428 aa  77.4  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  28.5 
 
 
1280 aa  77  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  26.31 
 
 
1118 aa  77  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  27.67 
 
 
1215 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>