More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2871 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.22 
 
 		 1196 aa  643    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 1203 aa  2402    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3661  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits  27.87 
 
 		 1035 aa  204  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0693  superfamily protein I DNA/RNA helicase  30.12 
 
 		 934 aa  185  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  39.87 
 
 		 946 aa  179  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  25.92 
 
 		 906 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  23.68 
 
 		 925 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  25.96 
 
 		 922 aa  132  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  25.72 
 
 		 905 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  26.76 
 
 		 900 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  25.91 
 
 		 905 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  30.46 
 
 		 903 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  28 
 
 		 928 aa  129  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  27.84 
 
 		 908 aa  127  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  25.45 
 
 		 905 aa  126  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  26.21 
 
 		 907 aa  125  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  26.05 
 
 		 914 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  25.59 
 
 		 916 aa  120  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  26.28 
 
 		 905 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  26.28 
 
 		 905 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  28.53 
 
 		 932 aa  117  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  24.92 
 
 		 758 aa  116  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  27.34 
 
 		 1002 aa  112  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  28.47 
 
 		 1132 aa  109  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0774  ATP-binding protein  25.78 
 
 		 904 aa  104  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00601607  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  33.93 
 
 		 553 aa  102  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  33.93 
 
 		 553 aa  102  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  28.9 
 
 		 1697 aa  102  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  31.32 
 
 		 1094 aa  100  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  26.56 
 
 		 975 aa  98.2  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  25.37 
 
 		 1790 aa  97.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  31.74 
 
 		 606 aa  96.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  24.94 
 
 		 1178 aa  95.5  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  27.06 
 
 		 1622 aa  95.1  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  26.98 
 
 		 1190 aa  95.1  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  30.3 
 
 		 1490 aa  94  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  31.29 
 
 		 1185 aa  94  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  29.73 
 
 		 1557 aa  93.2  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  26.88 
 
 		 914 aa  93.2  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  25.69 
 
 		 1171 aa  92.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  25.26 
 
 		 1099 aa  92.4  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3745  superfamily I DNA/RNA helicase  30.91 
 
 		 1694 aa  92  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  31.82 
 
 		 464 aa  92  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.74 
 
 		 1363 aa  91.7  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  28.04 
 
 		 1999 aa  91.3  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  28.65 
 
 		 1489 aa  90.1  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  28.78 
 
 		 1056 aa  90.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  26.33 
 
 		 958 aa  89.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  22.86 
 
 		 1653 aa  89.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1062 aa  89.4  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1440  RAP domain protein  25.57 
 
 		 1081 aa  89  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.112962  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  25.18 
 
 		 1178 aa  88.6  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  28.79 
 
 		 629 aa  88.2  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  29.93 
 
 		 1087 aa  87.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  28.93 
 
 		 388 aa  86.3  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  28.62 
 
 		 479 aa  86.3  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  28.85 
 
 		 1328 aa  86.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  27.92 
 
 		 1575 aa  85.5  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  24.7 
 
 		 1121 aa  85.5  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  31.79 
 
 		 2005 aa  84.7  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  25.58 
 
 		 611 aa  84.3  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  26.3 
 
 		 716 aa  84.3  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  30.1 
 
 		 1157 aa  84  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  29.3 
 
 		 797 aa  83.6  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  26.2 
 
 		 1630 aa  83.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  32.74 
 
 		 902 aa  84  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  30.41 
 
 		 1973 aa  83.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  25.76 
 
 		 1038 aa  83.2  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  29.87 
 
 		 2204 aa  82  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  22.45 
 
 		 1474 aa  82  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  30.15 
 
 		 759 aa  80.9  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  26.19 
 
 		 1620 aa  80.9  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1823 aa  80.1  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  26.41 
 
 		 1090 aa  80.1  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1888 aa  80.1  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  30.15 
 
 		 769 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  27.57 
 
 		 1803 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  28.32 
 
 		 486 aa  80.1  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  27.62 
 
 		 2622 aa  79.7  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  26.71 
 
 		 2123 aa  79.7  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  30.62 
 
 		 1523 aa  79.7  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  27.92 
 
 		 769 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  30.15 
 
 		 759 aa  79.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  28.67 
 
 		 759 aa  79.3  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  28.67 
 
 		 759 aa  79  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  28.32 
 
 		 759 aa  79  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  25.63 
 
 		 2013 aa  79  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  28.67 
 
 		 759 aa  78.6  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  27.97 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  28.32 
 
 		 759 aa  78.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  28.32 
 
 		 759 aa  78.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  26.92 
 
 		 650 aa  78.2  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  28.28 
 
 		 754 aa  78.2  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  29.41 
 
 		 1410 aa  77.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  28.01 
 
 		 1220 aa  77.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  28.67 
 
 		 2002 aa  77.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1176 aa  77.4  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  28.32 
 
 		 759 aa  77  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  30.18 
 
 		 941 aa  77  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  26.92 
 
 		 650 aa  77  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>