233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1291 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  100 
 
 
1099 aa  2207    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  29.62 
 
 
585 aa  192  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  28.92 
 
 
754 aa  172  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  31.82 
 
 
636 aa  170  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  28.4 
 
 
633 aa  170  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  29.01 
 
 
633 aa  167  9e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  28.94 
 
 
650 aa  164  7e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  28.77 
 
 
635 aa  164  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  29.9 
 
 
611 aa  163  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  29.15 
 
 
650 aa  162  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  27.77 
 
 
633 aa  160  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  29.68 
 
 
636 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  31.17 
 
 
941 aa  160  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  29.72 
 
 
632 aa  158  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  33.33 
 
 
1653 aa  156  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  27.79 
 
 
655 aa  155  4e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  27.81 
 
 
633 aa  151  8e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  29.27 
 
 
1077 aa  150  9e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  29.06 
 
 
643 aa  149  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  26.51 
 
 
622 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  26.85 
 
 
797 aa  143  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  26.45 
 
 
1090 aa  142  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  25.41 
 
 
466 aa  141  7e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  25.52 
 
 
622 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  26.29 
 
 
619 aa  140  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  26.93 
 
 
651 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  30.65 
 
 
1018 aa  135  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  26.32 
 
 
1999 aa  133  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  27.31 
 
 
2245 aa  132  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  32.79 
 
 
1651 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  25.46 
 
 
479 aa  129  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  28.36 
 
 
716 aa  127  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  31.71 
 
 
1284 aa  126  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  27.42 
 
 
952 aa  124  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  25.77 
 
 
748 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  31.43 
 
 
1585 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  31.43 
 
 
1585 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  25.5 
 
 
609 aa  121  9e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  31.82 
 
 
902 aa  120  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  24.84 
 
 
686 aa  118  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  25.1 
 
 
464 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  25.78 
 
 
1620 aa  112  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  29.07 
 
 
934 aa  112  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  23.79 
 
 
795 aa  112  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  26.94 
 
 
1108 aa  111  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  25.49 
 
 
629 aa  111  7.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  27.88 
 
 
901 aa  111  8.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  30.03 
 
 
268 aa  110  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  24.29 
 
 
553 aa  107  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  24.29 
 
 
553 aa  107  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  30.57 
 
 
1126 aa  106  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  23.14 
 
 
715 aa  107  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  23.69 
 
 
1175 aa  106  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  27.76 
 
 
606 aa  105  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.15 
 
 
752 aa  104  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  28.22 
 
 
1284 aa  103  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  28.38 
 
 
902 aa  101  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  21.91 
 
 
769 aa  100  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  29.43 
 
 
986 aa  100  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  22.38 
 
 
759 aa  100  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  21.76 
 
 
759 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  35.53 
 
 
254 aa  100  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  22.22 
 
 
759 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  22.22 
 
 
759 aa  100  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  22.22 
 
 
759 aa  100  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  21.91 
 
 
759 aa  99.4  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  21.6 
 
 
759 aa  98.6  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  28.27 
 
 
1190 aa  98.6  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  27.83 
 
 
1212 aa  98.6  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  24.54 
 
 
388 aa  98.2  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  28.01 
 
 
1189 aa  98.2  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  22.07 
 
 
759 aa  97.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  21.71 
 
 
769 aa  97.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  28.57 
 
 
486 aa  95.9  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  21.91 
 
 
759 aa  94.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  23.12 
 
 
944 aa  91.7  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  25.07 
 
 
1048 aa  91.7  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  27.67 
 
 
2310 aa  90.1  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.3 
 
 
1196 aa  89.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.75 
 
 
1203 aa  90.1  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  21.27 
 
 
1428 aa  89.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  23.24 
 
 
1097 aa  86.7  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  28.98 
 
 
315 aa  86.7  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  26.6 
 
 
1111 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  28.86 
 
 
975 aa  82  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  26.09 
 
 
1408 aa  80.9  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9531  helicase ATP-binding protein  22.48 
 
 
1137 aa  81.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  22.26 
 
 
1126 aa  80.1  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  28 
 
 
297 aa  80.1  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2944  serine/threonine kinase protein  35.38 
 
 
762 aa  79.7  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  25.43 
 
 
1151 aa  79.7  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  27.55 
 
 
1038 aa  79.3  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  27.04 
 
 
1557 aa  78.2  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  31.15 
 
 
1143 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  31.15 
 
 
1143 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  20.87 
 
 
1350 aa  76.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  28.88 
 
 
521 aa  74.7  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1899  hypothetical protein  23.39 
 
 
549 aa  74.7  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.571929  hitchhiker  0.00194399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  25.33 
 
 
1280 aa  74.3  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  26.69 
 
 
1172 aa  74.3  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>