23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3661 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3661  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits  100 
 
 		 1035 aa  1986    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0693  superfamily protein I DNA/RNA helicase  36.3 
 
 		 934 aa  294  7e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.62 
 
 		 1196 aa  226  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.77 
 
 		 1203 aa  198  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  29.61 
 
 		 946 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  22.14 
 
 		 906 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  26.63 
 
 		 903 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  21.08 
 
 		 900 aa  60.1  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  20.75 
 
 		 907 aa  59.7  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  23.77 
 
 		 1296 aa  57.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  24.89 
 
 		 905 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  20.07 
 
 		 1121 aa  57  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  22.51 
 
 		 905 aa  57  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  21.76 
 
 		 905 aa  57  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  22.51 
 
 		 905 aa  57  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  20.63 
 
 		 905 aa  55.1  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  22.27 
 
 		 908 aa  51.2  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  27.98 
 
 		 932 aa  50.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  24.37 
 
 		 1622 aa  49.7  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  26.32 
 
 		 1557 aa  48.9  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1062 aa  46.2  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  32.67 
 
 		 611 aa  45.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  23.76 
 
 		 1367 aa  45.1  0.008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>