183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0920 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  32.78 
 
 
1490 aa  671    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  100 
 
 
1622 aa  3335    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  41.41 
 
 
1790 aa  1245    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  32.58 
 
 
1489 aa  642    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  69.03 
 
 
1630 aa  2282    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  31.7 
 
 
1575 aa  612  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  28.98 
 
 
1474 aa  586  1.0000000000000001e-165  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  29.58 
 
 
1724 aa  504  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  29.15 
 
 
1523 aa  467  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  28.47 
 
 
1697 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3745  superfamily I DNA/RNA helicase  33.51 
 
 
1694 aa  419  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  32.67 
 
 
2622 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  37.76 
 
 
1387 aa  370  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  37.43 
 
 
1410 aa  370  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  32.69 
 
 
1629 aa  322  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  36.29 
 
 
1652 aa  322  3.9999999999999996e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  38.64 
 
 
1649 aa  305  5.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  29.6 
 
 
1557 aa  168  9e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  28.76 
 
 
1722 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.27 
 
 
1403 aa  131  9.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  30.57 
 
 
1973 aa  129  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  30.84 
 
 
1991 aa  129  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  26.81 
 
 
1754 aa  125  8e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  27.96 
 
 
900 aa  124  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  29.08 
 
 
1950 aa  123  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  29.08 
 
 
1958 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  29.35 
 
 
2222 aa  123  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  28.6 
 
 
2002 aa  122  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  27.68 
 
 
905 aa  122  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  28.67 
 
 
2198 aa  121  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  27.74 
 
 
1986 aa  121  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  26.97 
 
 
905 aa  121  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  27.45 
 
 
905 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  27.45 
 
 
905 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  27.49 
 
 
907 aa  119  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  27.21 
 
 
905 aa  119  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  27.45 
 
 
1958 aa  117  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  28.85 
 
 
2016 aa  116  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  29.44 
 
 
2207 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  25.16 
 
 
1367 aa  114  1.0000000000000001e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  28.79 
 
 
1980 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  26.77 
 
 
908 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  29.06 
 
 
2204 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  28.26 
 
 
1622 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  29.25 
 
 
2197 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  28.45 
 
 
1803 aa  112  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  27.84 
 
 
1904 aa  112  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  24.64 
 
 
906 aa  112  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  29.67 
 
 
1823 aa  110  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  30.67 
 
 
2098 aa  109  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  30.67 
 
 
2098 aa  109  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  29.6 
 
 
1296 aa  108  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  24.8 
 
 
1121 aa  107  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  29.63 
 
 
1945 aa  106  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  29.31 
 
 
2045 aa  106  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  29.61 
 
 
903 aa  105  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  27.99 
 
 
2096 aa  105  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  29.26 
 
 
1888 aa  104  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  26.83 
 
 
1559 aa  104  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  27.5 
 
 
1983 aa  103  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  27.94 
 
 
1861 aa  102  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  27.55 
 
 
2123 aa  102  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  27.87 
 
 
1853 aa  102  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  26.48 
 
 
1959 aa  102  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  27.68 
 
 
1328 aa  102  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  26.28 
 
 
1854 aa  101  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  28.34 
 
 
1559 aa  100  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  26.65 
 
 
2013 aa  99.8  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  25.8 
 
 
1801 aa  99  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  24.31 
 
 
2759 aa  98.6  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  25.99 
 
 
1575 aa  98.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  28.21 
 
 
1877 aa  98.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  24.82 
 
 
1572 aa  96.7  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  27.78 
 
 
1593 aa  96.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 
2098 aa  95.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 
2101 aa  95.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 
2101 aa  95.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.98 
 
 
1363 aa  95.1  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  27.67 
 
 
1328 aa  93.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  26.99 
 
 
2104 aa  92  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.06 
 
 
1203 aa  91.3  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1440  RAP domain protein  23.86 
 
 
1081 aa  91.3  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.112962  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  23.75 
 
 
1822 aa  89.4  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  27.76 
 
 
1867 aa  89  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  27.51 
 
 
1285 aa  87.4  0.000000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  29.12 
 
 
2125 aa  86.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  29.12 
 
 
2125 aa  86.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.32 
 
 
1196 aa  86.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0996  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.54 
 
 
1312 aa  86.7  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  28.91 
 
 
946 aa  85.5  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  26.17 
 
 
1589 aa  82.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  25.69 
 
 
1589 aa  82  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  27.47 
 
 
1571 aa  80.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  25.96 
 
 
1589 aa  80.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  26.02 
 
 
1838 aa  80.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  25.05 
 
 
1822 aa  78.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  27.49 
 
 
975 aa  78.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  26.75 
 
 
1185 aa  77.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1299  hypothetical protein  21.58 
 
 
1763 aa  77  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2605  hypothetical protein  25.82 
 
 
1680 aa  73.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.6809  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>