155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1440 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1440  RAP domain protein  100 
 
 		 1081 aa  2165    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.112962  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  35.51 
 
 		 1121 aa  627  1e-178  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  26.24 
 
 		 903 aa  149  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  25.75 
 
 		 908 aa  134  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  25.28 
 
 		 900 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  24.67 
 
 		 905 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  24.67 
 
 		 905 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  26.29 
 
 		 907 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  27.08 
 
 		 905 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  23.71 
 
 		 905 aa  126  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  25.22 
 
 		 905 aa  124  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  24.73 
 
 		 906 aa  122  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  20.48 
 
 		 946 aa  116  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  25.58 
 
 		 1490 aa  101  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  22.39 
 
 		 1630 aa  99.4  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.46 
 
 		 1196 aa  98.6  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  26.34 
 
 		 1629 aa  98.2  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  25.18 
 
 		 1697 aa  96.3  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  26.42 
 
 		 1557 aa  96.3  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  24.89 
 
 		 1575 aa  94.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1474 aa  93.2  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  23.5 
 
 		 1387 aa  91.7  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  23.86 
 
 		 1622 aa  90.9  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  21.8 
 
 		 1523 aa  90.9  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  22.26 
 
 		 1410 aa  90.9  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  22.93 
 
 		 1489 aa  87.4  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  25.72 
 
 		 1649 aa  87.8  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1652 aa  86.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  22.55 
 
 		 1973 aa  85.9  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.57 
 
 		 1203 aa  83.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  24.08 
 
 		 1790 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  25.47 
 
 		 1622 aa  79  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3745  superfamily I DNA/RNA helicase  23.09 
 
 		 1694 aa  78.2  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  21.7 
 
 		 2104 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  22.3 
 
 		 1363 aa  77.4  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  23.42 
 
 		 2207 aa  77.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  23.04 
 
 		 1803 aa  76.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  22.44 
 
 		 1328 aa  74.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  20.94 
 
 		 2098 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  21.33 
 
 		 2098 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  26.63 
 
 		 1296 aa  73.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  24.36 
 
 		 1367 aa  73.2  0.00000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  20.64 
 
 		 2101 aa  72.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  20.64 
 
 		 2101 aa  72.8  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  29.82 
 
 		 925 aa  71.6  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  24.07 
 
 		 1991 aa  71.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  22.58 
 
 		 2098 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  25.72 
 
 		 916 aa  70.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  24.91 
 
 		 932 aa  70.1  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  22.93 
 
 		 1724 aa  70.1  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  21.7 
 
 		 2197 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  21.86 
 
 		 1822 aa  68.9  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  21.95 
 
 		 1983 aa  68.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  26.09 
 
 		 922 aa  68.6  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1126 aa  68.2  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  27.63 
 
 		 629 aa  68.2  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  21.97 
 
 		 2622 aa  67.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  22.15 
 
 		 1980 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  21.22 
 
 		 2204 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  21.79 
 
 		 1950 aa  67  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  24.92 
 
 		 2125 aa  66.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  24.92 
 
 		 2125 aa  66.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  20.49 
 
 		 585 aa  66.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  27.19 
 
 		 958 aa  65.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  22.48 
 
 		 2198 aa  65.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  24.71 
 
 		 1559 aa  65.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  21.06 
 
 		 1958 aa  65.5  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  19.7 
 
 		 2002 aa  64.3  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  22.24 
 
 		 1754 aa  64.3  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  21.72 
 
 		 1722 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  24.83 
 
 		 1593 aa  63.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  22.25 
 
 		 2016 aa  63.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.2 
 
 		 1403 aa  62  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  21.93 
 
 		 2045 aa  62  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1116 aa  62  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  22.36 
 
 		 1861 aa  61.6  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  22.13 
 
 		 1823 aa  62  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0693  superfamily protein I DNA/RNA helicase  19.4 
 
 		 934 aa  60.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  24.52 
 
 		 1285 aa  60.8  0.0000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  22.56 
 
 		 1571 aa  60.1  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  21.58 
 
 		 1822 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1589 aa  59.3  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  40.28 
 
 		 758 aa  59.3  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  22.3 
 
 		 1589 aa  59.3  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.39 
 
 		 752 aa  58.9  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  22.07 
 
 		 1958 aa  58.9  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  22.32 
 
 		 2005 aa  58.9  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1589 aa  58.5  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  21.22 
 
 		 1838 aa  58.2  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1888 aa  57.4  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  22.29 
 
 		 1853 aa  57  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  20.83 
 
 		 2013 aa  57  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  22.29 
 
 		 2222 aa  57  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1575 aa  56.6  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  39.39 
 
 		 928 aa  56.2  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  23.52 
 
 		 1959 aa  56.2  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  24.4 
 
 		 1108 aa  56.2  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1247 aa  55.5  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.04 
 
 		 1324 aa  55.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  22.66 
 
 		 1328 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>