170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0117 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  49.2 
 
 		 1250 aa  716    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  50.11 
 
 		 1228 aa  723    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  100 
 
 		 1324 aa  2586    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  47.35 
 
 		 1143 aa  702    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  47.35 
 
 		 1143 aa  702    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  47.85 
 
 		 1151 aa  714    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  46.97 
 
 		 1143 aa  698    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  47.74 
 
 		 1163 aa  736    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  48.63 
 
 		 1139 aa  729    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  45.88 
 
 		 1215 aa  660    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  44.23 
 
 		 1215 aa  615  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  43.76 
 
 		 1270 aa  594  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  37.75 
 
 		 1247 aa  576  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  40.73 
 
 		 1153 aa  538  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  40.42 
 
 		 1198 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  45.65 
 
 		 1350 aa  425  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  55.35 
 
 		 1196 aa  414  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  38.65 
 
 		 1175 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  33.41 
 
 		 1126 aa  378  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  52.41 
 
 		 1280 aa  259  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  44.39 
 
 		 1082 aa  245  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  34.57 
 
 		 1172 aa  235  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  36.1 
 
 		 1116 aa  229  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  37.05 
 
 		 1118 aa  227  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  44.04 
 
 		 1121 aa  219  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4059  hypothetical protein  49.76 
 
 		 522 aa  188  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  28.72 
 
 		 606 aa  110  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  31.12 
 
 		 1259 aa  106  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  29.24 
 
 		 1271 aa  103  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  28.54 
 
 		 1275 aa  100  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  29.16 
 
 		 986 aa  94  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  30.75 
 
 		 902 aa  90.1  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  27.3 
 
 		 1255 aa  90.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  30.73 
 
 		 934 aa  88.2  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  27.14 
 
 		 1038 aa  88.2  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  24.89 
 
 		 585 aa  87  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  28.61 
 
 		 902 aa  85.9  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  30.38 
 
 		 609 aa  82  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  29.59 
 
 		 901 aa  79  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  32.42 
 
 		 553 aa  77.8  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  32.42 
 
 		 553 aa  77.8  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  23.43 
 
 		 1090 aa  77  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  23.36 
 
 		 1077 aa  75.9  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  27.27 
 
 		 2245 aa  74.7  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  32.26 
 
 		 619 aa  74.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.79 
 
 		 752 aa  74.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  26.69 
 
 		 633 aa  74.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  31.52 
 
 		 651 aa  74.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  26.25 
 
 		 932 aa  74.3  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  28.52 
 
 		 925 aa  73.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  24.82 
 
 		 635 aa  73.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  31.85 
 
 		 622 aa  72.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  23.53 
 
 		 797 aa  72.8  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  30.74 
 
 		 1620 aa  72.4  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  24.63 
 
 		 486 aa  72.4  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  27.34 
 
 		 922 aa  72.4  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  26.04 
 
 		 633 aa  72  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  25.27 
 
 		 633 aa  71.6  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  30.89 
 
 		 622 aa  71.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  27.27 
 
 		 1427 aa  70.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  28.73 
 
 		 946 aa  70.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  28.62 
 
 		 629 aa  70.1  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  26.74 
 
 		 479 aa  70.1  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  23.65 
 
 		 611 aa  69.3  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  24.94 
 
 		 636 aa  68.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  24.05 
 
 		 494 aa  67  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  27.48 
 
 		 1999 aa  67  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  28.1 
 
 		 464 aa  67.8  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  25.9 
 
 		 1585 aa  66.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  29.39 
 
 		 521 aa  66.6  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  29.33 
 
 		 1189 aa  66.6  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  25.9 
 
 		 1585 aa  66.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  26.67 
 
 		 487 aa  66.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  30 
 
 		 1403 aa  65.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.79 
 
 		 1428 aa  65.1  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  24.83 
 
 		 632 aa  65.1  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  24.64 
 
 		 1048 aa  64.7  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  26.44 
 
 		 916 aa  64.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1018 aa  64.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  24.15 
 
 		 1002 aa  63.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  26.44 
 
 		 466 aa  63.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  25 
 
 		 1121 aa  63.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  26.6 
 
 		 297 aa  63.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  25.5 
 
 		 655 aa  63.5  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  25.12 
 
 		 686 aa  63.2  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2796  transcription factor jumonji, jmjC  46.75 
 
 		 193 aa  62.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132584  hitchhiker  0.00000604093 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5369  hypothetical protein  27.01 
 
 		 454 aa  63.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.974948  normal  0.108224 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  30.53 
 
 		 659 aa  62.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1063  ABC transporter related protein  53.85 
 
 		 671 aa  62.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  23.23 
 
 		 1099 aa  61.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  24.82 
 
 		 1097 aa  60.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  28.43 
 
 		 480 aa  60.1  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  29.86 
 
 		 512 aa  60.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  25.95 
 
 		 636 aa  59.3  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  24.4 
 
 		 715 aa  59.7  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  25.61 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  22.79 
 
 		 1111 aa  59.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  23.86 
 
 		 1653 aa  58.9  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  25.29 
 
 		 754 aa  58.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  25.42 
 
 		 795 aa  58.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>