150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4258 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  100 
 
 		 1108 aa  2257    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  32.57 
 
 		 1126 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  29.39 
 
 		 1077 aa  115  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  26.2 
 
 		 1653 aa  115  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  26.95 
 
 		 748 aa  112  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  28.97 
 
 		 797 aa  112  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  25.06 
 
 		 650 aa  112  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  26.94 
 
 		 1099 aa  111  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  29.38 
 
 		 1585 aa  110  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  29.38 
 
 		 1585 aa  110  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  24.81 
 
 		 650 aa  107  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  26.74 
 
 		 1090 aa  107  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  28.61 
 
 		 479 aa  105  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  27.74 
 
 		 1620 aa  103  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  26.72 
 
 		 388 aa  102  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  28.1 
 
 		 715 aa  101  8e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  27.17 
 
 		 716 aa  100  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  25.2 
 
 		 635 aa  99  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  27.05 
 
 		 1284 aa  97.4  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  29.15 
 
 		 941 aa  97.4  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  27.5 
 
 		 2245 aa  96.3  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  31.99 
 
 		 466 aa  91.7  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  30.96 
 
 		 1651 aa  90.9  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.7 
 
 		 752 aa  89.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  28.18 
 
 		 754 aa  89.4  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  25.47 
 
 		 636 aa  89.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  28.94 
 
 		 553 aa  87.8  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  28.94 
 
 		 553 aa  87.8  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  25.73 
 
 		 632 aa  87.8  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  25.88 
 
 		 952 aa  86.3  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  27.25 
 
 		 1284 aa  86.7  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  24.64 
 
 		 1999 aa  85.9  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  26.86 
 
 		 611 aa  85.1  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  24.68 
 
 		 643 aa  84  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  24.77 
 
 		 633 aa  84.3  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  25.61 
 
 		 633 aa  84.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  24.58 
 
 		 636 aa  83.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  30.58 
 
 		 622 aa  83.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  26.91 
 
 		 795 aa  82  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  29.97 
 
 		 619 aa  80.9  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  24.16 
 
 		 633 aa  81.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  24.32 
 
 		 633 aa  80.9  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  28.03 
 
 		 686 aa  80.5  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  25.3 
 
 		 655 aa  79.7  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  29.66 
 
 		 622 aa  79.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  26.79 
 
 		 629 aa  77.4  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  26.89 
 
 		 585 aa  75.9  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  28.89 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  27.23 
 
 		 986 aa  74.3  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  27.91 
 
 		 609 aa  73.9  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  28.4 
 
 		 268 aa  73.9  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  20 
 
 		 925 aa  73.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  27.5 
 
 		 1189 aa  73.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  29.63 
 
 		 651 aa  73.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  28.21 
 
 		 902 aa  71.2  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  26.38 
 
 		 934 aa  71.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  23.61 
 
 		 1427 aa  68.2  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.84 
 
 		 1203 aa  67.8  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  26.04 
 
 		 902 aa  66.6  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  22.19 
 
 		 1212 aa  66.2  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  27.94 
 
 		 1408 aa  65.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  24.19 
 
 		 944 aa  64.7  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  24.94 
 
 		 1175 aa  64.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  26.44 
 
 		 464 aa  63.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  26.26 
 
 		 1190 aa  63.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  24.65 
 
 		 521 aa  62.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  21.95 
 
 		 1121 aa  61.2  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.33 
 
 		 1428 aa  60.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1116 aa  60.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14090  predicted protein  34.58 
 
 		 219 aa  59.3  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  25.89 
 
 		 901 aa  59.3  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  29.45 
 
 		 946 aa  59.3  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  24.92 
 
 		 1185 aa  58.5  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  24.86 
 
 		 769 aa  58.5  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9531  helicase ATP-binding protein  26.57 
 
 		 1137 aa  58.2  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  25.24 
 
 		 606 aa  57.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  26.95 
 
 		 1877 aa  57.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  25.85 
 
 		 1038 aa  55.8  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1440  RAP domain protein  24.4 
 
 		 1081 aa  56.2  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.112962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  25.36 
 
 		 1111 aa  55.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.68 
 
 		 254 aa  55.5  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07014  DEAD helicases superfamily protein (Aquarius), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04350)  23.84 
 
 		 1422 aa  55.5  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  25.95 
 
 		 1041 aa  55.1  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1126 aa  54.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  24.05 
 
 		 759 aa  53.5  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  24.05 
 
 		 759 aa  53.5  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  23.41 
 
 		 922 aa  53.5  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  23.77 
 
 		 759 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  27.53 
 
 		 1387 aa  52.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1172 aa  52.4  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  24.05 
 
 		 759 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  24.32 
 
 		 759 aa  52.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  24.32 
 
 		 759 aa  52.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  23.9 
 
 		 1790 aa  52.4  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  36.46 
 
 		 1118 aa  52.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  28.15 
 
 		 1861 aa  52  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  23.58 
 
 		 759 aa  52  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  25.44 
 
 		 1250 aa  52  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  23.98 
 
 		 769 aa  51.6  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  24.38 
 
 		 297 aa  50.8  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>