234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1455 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  100 
 
 		 758 aa  1572    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0774  ATP-binding protein  62.47 
 
 		 904 aa  917    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00601607  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  65.33 
 
 		 914 aa  957    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  37.05 
 
 		 925 aa  423  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  35.87 
 
 		 916 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  35.45 
 
 		 932 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  37.5 
 
 		 928 aa  369  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  35.35 
 
 		 922 aa  370  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.66 
 
 		 1203 aa  110  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  26.18 
 
 		 900 aa  108  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.39 
 
 		 1196 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  24.83 
 
 		 905 aa  107  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  24.83 
 
 		 905 aa  107  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  23.5 
 
 		 1121 aa  103  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  25.65 
 
 		 905 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  25.48 
 
 		 905 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  24.17 
 
 		 1002 aa  99  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  25.48 
 
 		 905 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  25.65 
 
 		 906 aa  97.4  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  27.53 
 
 		 903 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  26.83 
 
 		 1523 aa  88.6  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  30.17 
 
 		 946 aa  87  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  27.5 
 
 		 907 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  30.66 
 
 		 1557 aa  82  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  27.2 
 
 		 629 aa  81.3  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  28.27 
 
 		 908 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  27.9 
 
 		 934 aa  78.6  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  31.01 
 
 		 1474 aa  75.1  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  25.81 
 
 		 975 aa  74.7  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  28.57 
 
 		 1082 aa  73.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  25.84 
 
 		 902 aa  72.4  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  46.75 
 
 		 2013 aa  70.9  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  29.32 
 
 		 643 aa  70.9  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  39.8 
 
 		 1983 aa  70.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  41.38 
 
 		 1722 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  27.55 
 
 		 754 aa  70.5  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  25.21 
 
 		 986 aa  70.1  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  28.85 
 
 		 1132 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  37.63 
 
 		 1958 aa  68.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  30.65 
 
 		 901 aa  68.9  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  28.29 
 
 		 1575 aa  68.6  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  36.63 
 
 		 1950 aa  68.6  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  39.13 
 
 		 1991 aa  68.2  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  38.71 
 
 		 1959 aa  68.2  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  25 
 
 		 1062 aa  68.2  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  29.37 
 
 		 1171 aa  68.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  25.99 
 
 		 902 aa  67.8  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  32 
 
 		 1888 aa  67.4  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  25.87 
 
 		 759 aa  67  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  25.87 
 
 		 759 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  39.8 
 
 		 2002 aa  67  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  25.87 
 
 		 759 aa  66.6  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  28.04 
 
 		 1490 aa  65.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  25.08 
 
 		 958 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  25.87 
 
 		 759 aa  66.6  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  25.87 
 
 		 759 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  26.77 
 
 		 611 aa  66.6  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1121 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  25.87 
 
 		 759 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  35.25 
 
 		 1801 aa  66.6  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  25.95 
 
 		 1099 aa  66.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  30.6 
 
 		 1980 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  35.85 
 
 		 1986 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  31.95 
 
 		 2098 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  25.9 
 
 		 650 aa  65.5  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  39.2 
 
 		 1958 aa  65.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  26.39 
 
 		 769 aa  65.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  26.22 
 
 		 759 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  47.06 
 
 		 1822 aa  65.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  29.97 
 
 		 1410 aa  65.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  23.75 
 
 		 650 aa  65.1  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.35 
 
 		 1428 aa  65.1  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  25.52 
 
 		 759 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  28.28 
 
 		 1190 aa  65.1  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  38.1 
 
 		 2204 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  32.59 
 
 		 1854 aa  64.7  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  23.16 
 
 		 1630 aa  64.7  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  24.05 
 
 		 1973 aa  64.7  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  30.97 
 
 		 2016 aa  64.7  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  25.56 
 
 		 633 aa  64.7  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  39.13 
 
 		 2207 aa  64.3  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  25.52 
 
 		 759 aa  64.7  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  25.67 
 
 		 1585 aa  64.7  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  25.67 
 
 		 1585 aa  64.7  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  25.86 
 
 		 633 aa  64.3  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  39.13 
 
 		 1803 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  26.47 
 
 		 632 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  39.29 
 
 		 2125 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  25.45 
 
 		 606 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  39.29 
 
 		 2125 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  40.24 
 
 		 1572 aa  63.9  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  35.48 
 
 		 1593 aa  63.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  36.29 
 
 		 2197 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  36.96 
 
 		 2222 aa  62.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1724 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  29.21 
 
 		 1629 aa  63.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1116 aa  63.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  40.23 
 
 		 1945 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  31.36 
 
 		 2098 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  27.18 
 
 		 769 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>