246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0299 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  70.25 
 
 		 932 aa  1347    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  100 
 
 		 916 aa  1893    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  85.46 
 
 		 922 aa  1619    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  37.74 
 
 		 928 aa  553  1e-156  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  32.59 
 
 		 925 aa  480  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  34.72 
 
 		 914 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  35.87 
 
 		 758 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0774  ATP-binding protein  35.16 
 
 		 904 aa  360  9.999999999999999e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00601607  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.28 
 
 		 1203 aa  110  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  25.89 
 
 		 903 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  32.81 
 
 		 1132 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  27.85 
 
 		 1002 aa  104  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.44 
 
 		 1196 aa  104  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  29.41 
 
 		 629 aa  98.6  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  25.29 
 
 		 946 aa  96.3  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  30.4 
 
 		 619 aa  94  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  28.77 
 
 		 606 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  29.82 
 
 		 622 aa  92.4  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  26.13 
 
 		 902 aa  92  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  26.25 
 
 		 466 aa  92  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  25.09 
 
 		 905 aa  91.7  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  29.45 
 
 		 622 aa  90.5  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  26.01 
 
 		 908 aa  90.1  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  25.52 
 
 		 907 aa  89.4  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  25.36 
 
 		 905 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5347  DNA topoisomerase  28.27 
 
 		 1335 aa  89.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  25.96 
 
 		 905 aa  89  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  25.96 
 
 		 905 aa  89  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  29.71 
 
 		 934 aa  88.6  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  29.93 
 
 		 1121 aa  88.6  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  25 
 
 		 905 aa  87.8  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  26.07 
 
 		 900 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  27.27 
 
 		 650 aa  87  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  27.27 
 
 		 650 aa  85.1  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  27.56 
 
 		 1523 aa  84.3  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  24.74 
 
 		 633 aa  84.3  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  28.32 
 
 		 902 aa  84  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  27.03 
 
 		 754 aa  83.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1062 aa  84  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  23.21 
 
 		 914 aa  84  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  25.6 
 
 		 643 aa  84  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  27.36 
 
 		 609 aa  84  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  27.17 
 
 		 986 aa  83.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  32.3 
 
 		 958 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  25.88 
 
 		 716 aa  82.4  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  27.42 
 
 		 1171 aa  82.8  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  26.56 
 
 		 906 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  25.32 
 
 		 1999 aa  81.3  0.00000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  28.4 
 
 		 901 aa  80.9  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  27.8 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  25.63 
 
 		 633 aa  80.5  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  28.96 
 
 		 1557 aa  80.5  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  29.56 
 
 		 1410 aa  79.7  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1474 aa  80.1  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  30.34 
 
 		 1387 aa  80.1  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  24.16 
 
 		 633 aa  79  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  28.48 
 
 		 651 aa  77.8  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.76 
 
 		 752 aa  77.4  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  28.8 
 
 		 1296 aa  75.1  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  27.31 
 
 		 611 aa  74.7  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  24.26 
 
 		 633 aa  74.3  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  25.91 
 
 		 1490 aa  74.3  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1823 aa  73.6  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  27.01 
 
 		 797 aa  73.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  26.26 
 
 		 1620 aa  72.4  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  28.72 
 
 		 1489 aa  72.8  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  24.89 
 
 		 2123 aa  72  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  27.04 
 
 		 655 aa  71.6  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  36.57 
 
 		 1822 aa  71.2  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1247 aa  71.2  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  27.36 
 
 		 1157 aa  70.5  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  36.57 
 
 		 1838 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1440  RAP domain protein  25.72 
 
 		 1081 aa  70.5  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.112962  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  26.07 
 
 		 585 aa  70.5  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  26.88 
 
 		 1077 aa  70.1  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.14 
 
 		 1363 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  27.16 
 
 		 975 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  27.87 
 
 		 795 aa  70.1  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1176 aa  68.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  25.55 
 
 		 1094 aa  68.2  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  29.04 
 
 		 769 aa  68.2  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  25.52 
 
 		 1196 aa  67.8  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  26.54 
 
 		 1151 aa  67.8  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  26.64 
 
 		 1280 aa  67  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  25 
 
 		 636 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  23.45 
 
 		 1980 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  23.05 
 
 		 2016 aa  67.4  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  23.72 
 
 		 1328 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  23.45 
 
 		 2207 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  28.39 
 
 		 759 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  22.34 
 
 		 1408 aa  66.6  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  25.25 
 
 		 1056 aa  67  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1116 aa  66.2  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  23.57 
 
 		 1350 aa  66.6  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1121 aa  67  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  22.95 
 
 		 1986 aa  67  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  21.37 
 
 		 1959 aa  67  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1220 aa  65.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  28.39 
 
 		 769 aa  66.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  24.45 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>