206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_61353 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  100 
 
 
716 aa  1463    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  40.34 
 
 
686 aa  451  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  33.86 
 
 
748 aa  366  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  34.42 
 
 
609 aa  306  8.000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  34.41 
 
 
650 aa  273  6e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  34.07 
 
 
650 aa  269  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  30.73 
 
 
622 aa  267  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  31.29 
 
 
622 aa  267  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  30.82 
 
 
619 aa  263  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  30.85 
 
 
655 aa  262  1e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  32.71 
 
 
651 aa  259  9e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  33.45 
 
 
611 aa  251  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  34.84 
 
 
464 aa  250  8e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  30.29 
 
 
754 aa  246  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  34.51 
 
 
632 aa  244  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  32.9 
 
 
635 aa  243  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  34.48 
 
 
633 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  32.09 
 
 
636 aa  242  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  34.3 
 
 
633 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  33.6 
 
 
636 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  34.35 
 
 
633 aa  239  2e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  34 
 
 
633 aa  226  8e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  33.03 
 
 
643 aa  220  6e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  30.78 
 
 
1090 aa  216  9e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  32.23 
 
 
1077 aa  209  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  30.31 
 
 
797 aa  209  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  31.78 
 
 
466 aa  189  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  29.51 
 
 
1999 aa  173  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.9 
 
 
752 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  28.69 
 
 
952 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  29.93 
 
 
2245 aa  164  8.000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  30 
 
 
479 aa  147  6e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  27.27 
 
 
553 aa  145  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  27.27 
 
 
553 aa  145  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  35.02 
 
 
902 aa  145  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  28.93 
 
 
629 aa  145  4e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  29.79 
 
 
388 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  37.44 
 
 
237 aa  137  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  26.57 
 
 
715 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  34.88 
 
 
934 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  33.66 
 
 
268 aa  129  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  28.36 
 
 
1099 aa  127  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  32.73 
 
 
986 aa  127  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  27.76 
 
 
759 aa  126  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  27.52 
 
 
759 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  27.87 
 
 
759 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  27.52 
 
 
759 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  27.52 
 
 
759 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  27.87 
 
 
759 aa  125  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  27.53 
 
 
759 aa  124  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  28.19 
 
 
769 aa  124  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  30.5 
 
 
1048 aa  124  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  27.51 
 
 
769 aa  124  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  27.87 
 
 
759 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  31.96 
 
 
902 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  32.53 
 
 
901 aa  122  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  34.4 
 
 
1097 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  27.46 
 
 
759 aa  120  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  30.64 
 
 
1653 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  29.27 
 
 
606 aa  112  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  28.66 
 
 
941 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  30.14 
 
 
795 aa  110  9.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  24.9 
 
 
585 aa  110  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  26.97 
 
 
315 aa  103  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  23.6 
 
 
1427 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  27.17 
 
 
1108 aa  100  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  32.37 
 
 
1189 aa  98.2  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  28.16 
 
 
486 aa  95.5  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  28.85 
 
 
283 aa  94.7  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  28.17 
 
 
1284 aa  94.7  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  28.02 
 
 
1018 aa  92  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  27.3 
 
 
1038 aa  91.7  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  22.52 
 
 
1212 aa  91.3  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  28.35 
 
 
1041 aa  89.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  28.57 
 
 
1116 aa  89.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  28.87 
 
 
297 aa  89  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  24.49 
 
 
1408 aa  88.6  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  26.45 
 
 
1585 aa  87.4  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  24.86 
 
 
1620 aa  87.4  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  26.45 
 
 
1585 aa  87.4  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  27.22 
 
 
922 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  25.88 
 
 
916 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  28.47 
 
 
521 aa  82.4  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.95 
 
 
1203 aa  81.6  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  24.83 
 
 
2310 aa  81.3  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  24.18 
 
 
1270 aa  81.3  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  26.19 
 
 
1271 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  35.94 
 
 
1190 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  21.34 
 
 
907 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14090  predicted protein  33.33 
 
 
219 aa  78.2  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  27.49 
 
 
1126 aa  78.2  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.34 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  26.86 
 
 
1284 aa  77.8  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  24.69 
 
 
932 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  25 
 
 
1082 aa  76.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  22.01 
 
 
1175 aa  76.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  20 
 
 
900 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07014  DEAD helicases superfamily protein (Aquarius), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04350)  23.1 
 
 
1422 aa  75.9  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  24.5 
 
 
1259 aa  75.5  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  27.03 
 
 
1651 aa  75.1  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.98348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>