245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0901 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  58.81 
 
 		 650 aa  730    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  58.81 
 
 		 650 aa  731    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  100 
 
 		 643 aa  1281    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  45.74 
 
 		 655 aa  557  1e-157  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  44.79 
 
 		 633 aa  495  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  45.03 
 
 		 633 aa  489  1e-137  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  45.35 
 
 		 633 aa  481  1e-134  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  42.34 
 
 		 754 aa  472  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  44.44 
 
 		 633 aa  457  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  30.86 
 
 		 619 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  30.72 
 
 		 622 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  30.88 
 
 		 622 aa  290  7e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  32.63 
 
 		 636 aa  272  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  34.13 
 
 		 611 aa  270  8.999999999999999e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  29.63 
 
 		 651 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  32.3 
 
 		 609 aa  266  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  30.62 
 
 		 636 aa  259  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  31.3 
 
 		 635 aa  253  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  30.34 
 
 		 632 aa  252  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  32.9 
 
 		 748 aa  239  1e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  33.91 
 
 		 686 aa  230  7e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  33.33 
 
 		 716 aa  223  9.999999999999999e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  32.57 
 
 		 797 aa  212  1e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  32.45 
 
 		 464 aa  209  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  31.14 
 
 		 466 aa  209  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  31.09 
 
 		 952 aa  208  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  30.54 
 
 		 1999 aa  209  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  33.61 
 
 		 1090 aa  205  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  32.99 
 
 		 1077 aa  196  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  35.36 
 
 		 479 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  33.67 
 
 		 902 aa  177  5e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  32.99 
 
 		 934 aa  174  5e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  34.39 
 
 		 902 aa  173  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  34.39 
 
 		 986 aa  173  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  33.43 
 
 		 388 aa  171  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  30.9 
 
 		 941 aa  171  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  28.83 
 
 		 629 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  34.09 
 
 		 901 aa  164  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  29.49 
 
 		 2245 aa  162  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  32.29 
 
 		 1097 aa  159  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  37.91 
 
 		 752 aa  157  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  39.86 
 
 		 268 aa  156  9e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  34.19 
 
 		 486 aa  155  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  29.15 
 
 		 715 aa  152  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  31.7 
 
 		 1048 aa  151  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  29.06 
 
 		 1099 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  26.57 
 
 		 553 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  26.57 
 
 		 553 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  27.41 
 
 		 795 aa  145  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  28.84 
 
 		 585 aa  140  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  31.01 
 
 		 1653 aa  140  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  29.94 
 
 		 1189 aa  137  9e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  32.46 
 
 		 606 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1018 aa  131  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  33.96 
 
 		 237 aa  120  6e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  30.23 
 
 		 1284 aa  118  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  27.89 
 
 		 1585 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  27.89 
 
 		 1585 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  30.77 
 
 		 283 aa  114  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  29.62 
 
 		 315 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  25.91 
 
 		 759 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  25.83 
 
 		 769 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  25.91 
 
 		 759 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  26.25 
 
 		 759 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  25.91 
 
 		 759 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  26.12 
 
 		 769 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  26.12 
 
 		 759 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  25.91 
 
 		 759 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  25.91 
 
 		 759 aa  109  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  25.91 
 
 		 759 aa  109  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  26.12 
 
 		 759 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  30.81 
 
 		 1038 aa  108  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  26.9 
 
 		 2310 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  26.02 
 
 		 521 aa  101  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  26.69 
 
 		 1651 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  27.33 
 
 		 1111 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  24.69 
 
 		 1126 aa  94.4  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  25.83 
 
 		 1284 aa  92.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  26.12 
 
 		 1620 aa  90.9  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  24.91 
 
 		 297 aa  89  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  22.75 
 
 		 908 aa  88.6  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  28.04 
 
 		 1408 aa  85.9  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  25.15 
 
 		 1457 aa  85.5  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  20.83 
 
 		 900 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  21.86 
 
 		 1428 aa  84.3  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  24.68 
 
 		 1108 aa  84.7  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  29.27 
 
 		 925 aa  84  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  25.6 
 
 		 916 aa  83.6  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  23.4 
 
 		 1255 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  27.8 
 
 		 1271 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  24.12 
 
 		 903 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  26.81 
 
 		 928 aa  82.8  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  21.01 
 
 		 905 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  26.55 
 
 		 932 aa  82  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  21.08 
 
 		 905 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  24.33 
 
 		 922 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  24.73 
 
 		 1190 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  25.08 
 
 		 1041 aa  78.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  27.7 
 
 		 1557 aa  78.6  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1275 aa  78.2  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>