162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2207 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  100 
 
 
1255 aa  2583    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  37.7 
 
 
1271 aa  747    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  35.04 
 
 
1275 aa  754    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  37.96 
 
 
1259 aa  728    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  28.92 
 
 
1457 aa  157  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  31.15 
 
 
606 aa  153  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  30.7 
 
 
1403 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  28.79 
 
 
1261 aa  147  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  28.35 
 
 
1427 aa  145  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  27.29 
 
 
1408 aa  140  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.54 
 
 
1428 aa  132  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  27.75 
 
 
486 aa  116  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  27.71 
 
 
1116 aa  112  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  27.85 
 
 
934 aa  110  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  29.15 
 
 
901 aa  108  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  24.49 
 
 
1118 aa  108  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  28.84 
 
 
902 aa  104  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  26.91 
 
 
1097 aa  103  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  26.44 
 
 
1163 aa  103  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  28.36 
 
 
1247 aa  102  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  27.64 
 
 
1215 aa  102  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  26.52 
 
 
1153 aa  100  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  25 
 
 
1126 aa  98.2  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  26.72 
 
 
986 aa  98.2  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  25.05 
 
 
1048 aa  97.8  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  27.16 
 
 
1215 aa  95.9  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  25.98 
 
 
902 aa  94.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  27.01 
 
 
1151 aa  93.2  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.04 
 
 
1324 aa  92  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  28.18 
 
 
1082 aa  90.5  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  27.06 
 
 
643 aa  90.1  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  26.89 
 
 
1270 aa  89.7  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  25.31 
 
 
1196 aa  85.1  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  29.64 
 
 
629 aa  83.2  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  26.99 
 
 
1198 aa  82.8  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  26.3 
 
 
1228 aa  82  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  26.56 
 
 
1280 aa  81.6  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  26.52 
 
 
1139 aa  81.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  30.22 
 
 
650 aa  80.5  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  25.67 
 
 
1143 aa  80.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  30.22 
 
 
650 aa  79.7  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  23.5 
 
 
1172 aa  78.6  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  23.31 
 
 
611 aa  77.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  26.46 
 
 
1250 aa  77  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  25.06 
 
 
1143 aa  76.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  25.06 
 
 
1143 aa  76.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  29.78 
 
 
609 aa  76.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  29.64 
 
 
651 aa  76.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  22.76 
 
 
686 aa  75.9  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  25.12 
 
 
1121 aa  75.5  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.95 
 
 
752 aa  75.5  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  25.94 
 
 
633 aa  75.1  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  28.93 
 
 
619 aa  74.7  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  29.64 
 
 
622 aa  73.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  24.57 
 
 
466 aa  73.2  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  25.6 
 
 
633 aa  73.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  24.05 
 
 
754 aa  72.8  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  24.88 
 
 
1350 aa  72.4  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  28.93 
 
 
622 aa  71.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  26.61 
 
 
1175 aa  71.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  25.76 
 
 
633 aa  70.1  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  24.91 
 
 
633 aa  69.7  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  23.86 
 
 
632 aa  70.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  25 
 
 
636 aa  69.7  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  23.86 
 
 
1111 aa  69.3  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  24.92 
 
 
716 aa  69.3  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  23.53 
 
 
952 aa  68.6  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  23.52 
 
 
748 aa  68.2  0.0000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  25 
 
 
655 aa  67.8  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  28.57 
 
 
388 aa  66.2  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  26.81 
 
 
1620 aa  66.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  28.82 
 
 
315 aa  66.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  27.18 
 
 
553 aa  66.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  27.18 
 
 
553 aa  66.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  29.84 
 
 
1980 aa  65.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  25.57 
 
 
1585 aa  64.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  25.57 
 
 
1585 aa  64.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  23.54 
 
 
797 aa  64.7  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  25.98 
 
 
1559 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.3 
 
 
1196 aa  63.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  28.62 
 
 
941 aa  63.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  25.57 
 
 
914 aa  62.8  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  27.49 
 
 
2005 aa  62.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  24.6 
 
 
479 aa  61.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  23.92 
 
 
283 aa  60.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  22.47 
 
 
635 aa  60.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  26.5 
 
 
715 aa  60.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  27 
 
 
1722 aa  59.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  26.4 
 
 
2759 aa  58.9  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  23.47 
 
 
922 aa  58.5  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  37.23 
 
 
1126 aa  58.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  22.9 
 
 
636 aa  57.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  24.81 
 
 
1018 aa  57.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  25.25 
 
 
2310 aa  56.2  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  26.25 
 
 
2245 aa  56.2  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  25.89 
 
 
1904 aa  56.2  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2658  Exodeoxyribonuclease V  29.17 
 
 
659 aa  56.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0285632  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  22.1 
 
 
585 aa  55.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  23.06 
 
 
1653 aa  55.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  27.37 
 
 
494 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>