184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2408 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  100 
 
 		 1428 aa  2940    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  40.66 
 
 		 1408 aa  923    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  26.41 
 
 		 1403 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  27.09 
 
 		 1457 aa  141  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  27.17 
 
 		 1427 aa  134  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  27.33 
 
 		 1255 aa  129  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  24.59 
 
 		 1261 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  28.11 
 
 		 1271 aa  118  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  28.48 
 
 		 606 aa  117  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  21.75 
 
 		 1275 aa  105  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  26.61 
 
 		 629 aa  105  8e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  25.06 
 
 		 611 aa  101  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  28.14 
 
 		 934 aa  101  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  25.92 
 
 		 902 aa  96.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  26.29 
 
 		 986 aa  97.1  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  21.9 
 
 		 633 aa  95.9  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  24.35 
 
 		 650 aa  95.1  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  22.86 
 
 		 633 aa  94.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  24.21 
 
 		 650 aa  94  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1259 aa  93.2  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  23.4 
 
 		 797 aa  92.4  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  23.67 
 
 		 1048 aa  90.5  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  21.27 
 
 		 1099 aa  89.4  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  22.68 
 
 		 633 aa  89.4  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  25.17 
 
 		 759 aa  89  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  25.89 
 
 		 466 aa  88.6  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  25.39 
 
 		 759 aa  88.6  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  24.65 
 
 		 1077 aa  88.2  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  25.17 
 
 		 759 aa  87.8  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  25.38 
 
 		 759 aa  87.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  25.38 
 
 		 759 aa  87.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  23.53 
 
 		 636 aa  87.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  27.48 
 
 		 902 aa  87.4  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  25.17 
 
 		 759 aa  87  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  25.96 
 
 		 609 aa  87.4  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  24.94 
 
 		 759 aa  87.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  24.58 
 
 		 769 aa  87.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  23.91 
 
 		 769 aa  87.4  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  24.24 
 
 		 1097 aa  85.9  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  23.06 
 
 		 655 aa  85.9  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  24.28 
 
 		 759 aa  85.5  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  24.5 
 
 		 759 aa  85.1  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  24.11 
 
 		 635 aa  85.1  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  23.48 
 
 		 636 aa  83.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  29.43 
 
 		 479 aa  84  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  21.86 
 
 		 643 aa  84.3  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  22.4 
 
 		 632 aa  81.6  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  24.95 
 
 		 952 aa  81.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  23.55 
 
 		 754 aa  81.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  23.29 
 
 		 1090 aa  80.9  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  27.8 
 
 		 622 aa  80.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  24.85 
 
 		 1284 aa  79.7  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  23.62 
 
 		 315 aa  77  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  26.91 
 
 		 901 aa  77.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  27.29 
 
 		 622 aa  76.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  24.72 
 
 		 633 aa  74.7  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  26.37 
 
 		 388 aa  73.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  23.61 
 
 		 1038 aa  73.2  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  27.49 
 
 		 619 aa  72.4  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  26.06 
 
 		 925 aa  70.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  28.36 
 
 		 1189 aa  69.7  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  20.97 
 
 		 1118 aa  69.3  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  23.25 
 
 		 1228 aa  68.6  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  24.73 
 
 		 932 aa  67.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.79 
 
 		 752 aa  67.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  26.06 
 
 		 914 aa  67.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  21.68 
 
 		 585 aa  66.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0774  ATP-binding protein  27.9 
 
 		 904 aa  66.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00601607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  25 
 
 		 1126 aa  66.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  24.11 
 
 		 715 aa  66.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1018 aa  65.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.35 
 
 		 1324 aa  65.5  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  27.54 
 
 		 1999 aa  65.1  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  26.35 
 
 		 758 aa  65.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  24.67 
 
 		 1126 aa  64.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1116 aa  63.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  23.96 
 
 		 1111 aa  63.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  25.71 
 
 		 2002 aa  63.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  25.66 
 
 		 795 aa  62  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  23.99 
 
 		 1585 aa  61.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  23.99 
 
 		 1585 aa  61.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  26.1 
 
 		 1622 aa  61.6  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  26.44 
 
 		 651 aa  61.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  27.08 
 
 		 1041 aa  60.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  27.33 
 
 		 1108 aa  60.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  25.81 
 
 		 928 aa  60.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  23.57 
 
 		 941 aa  60.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  25.08 
 
 		 297 aa  60.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  24.76 
 
 		 748 aa  59.7  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  22.25 
 
 		 1270 aa  59.3  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  22.99 
 
 		 1082 aa  58.9  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  23.67 
 
 		 1653 aa  59.3  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1801 aa  59.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  22.49 
 
 		 1151 aa  58.9  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1328 aa  58.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  27.18 
 
 		 1575 aa  57.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  25.26 
 
 		 1280 aa  57.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  21.65 
 
 		 1172 aa  57  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  24.05 
 
 		 1651 aa  56.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1350 aa  57  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>