112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1511 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  100 
 
 		 1275 aa  2647    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  42.62 
 
 		 1259 aa  1025    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  44.07 
 
 		 1271 aa  1095    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  34.96 
 
 		 1255 aa  742    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  22.31 
 
 		 1427 aa  197  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  29.39 
 
 		 1457 aa  165  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3922  superfamily I DNA/RNA helicase  27.33 
 
 		 1261 aa  154  8.999999999999999e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2280  AAA ATPase  26.71 
 
 		 1403 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00184905  decreased coverage  0.00000493751 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  31.72 
 
 		 606 aa  140  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  27.59 
 
 		 1408 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1118 aa  108  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  21.75 
 
 		 1428 aa  105  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  26.81 
 
 		 1215 aa  104  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1126 aa  101  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.54 
 
 		 1324 aa  100  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  25.81 
 
 		 1082 aa  97.4  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  26.59 
 
 		 902 aa  97.8  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  26.75 
 
 		 1270 aa  97.8  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  26.87 
 
 		 1097 aa  95.1  7e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  27.03 
 
 		 901 aa  94.7  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  25.8 
 
 		 1151 aa  94.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  26.75 
 
 		 1163 aa  94  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  25 
 
 		 486 aa  94  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  24.82 
 
 		 986 aa  92.4  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  25.25 
 
 		 1196 aa  92  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  24.68 
 
 		 1228 aa  90.9  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1116 aa  90.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  24.75 
 
 		 902 aa  89.7  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  25.6 
 
 		 934 aa  90.1  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  23.48 
 
 		 1048 aa  86.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  24.25 
 
 		 622 aa  87  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  24.85 
 
 		 619 aa  86.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1121 aa  85.9  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  24.25 
 
 		 622 aa  86.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  23.74 
 
 		 1153 aa  85.9  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1247 aa  85.1  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  29.36 
 
 		 650 aa  84.3  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  24.94 
 
 		 1143 aa  82  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1139 aa  82  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  28.4 
 
 		 650 aa  81.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.12 
 
 		 752 aa  80.5  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  26.91 
 
 		 1280 aa  80.1  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1172 aa  80.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  26.08 
 
 		 1198 aa  80.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  25.57 
 
 		 651 aa  80.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1350 aa  79  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  27.25 
 
 		 748 aa  78.6  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  26.87 
 
 		 643 aa  78.2  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  25.59 
 
 		 609 aa  75.1  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  26.64 
 
 		 754 aa  74.3  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  22.92 
 
 		 636 aa  72.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  23.28 
 
 		 636 aa  71.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  24.07 
 
 		 716 aa  70.1  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  24.59 
 
 		 1111 aa  69.7  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1215 aa  68.9  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  21.47 
 
 		 952 aa  65.9  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  24.52 
 
 		 795 aa  65.9  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  25.53 
 
 		 1651 aa  64.3  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  23.88 
 
 		 632 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  27.18 
 
 		 633 aa  63.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  22.76 
 
 		 283 aa  63.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  25.78 
 
 		 388 aa  63.2  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  26.6 
 
 		 633 aa  63.2  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  26.01 
 
 		 633 aa  62.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  21.64 
 
 		 635 aa  62  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  25 
 
 		 633 aa  60.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  26.39 
 
 		 611 aa  60.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  22.64 
 
 		 797 aa  60.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  30.39 
 
 		 1250 aa  60.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  24.56 
 
 		 1999 aa  59.7  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  24.73 
 
 		 655 aa  58.2  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  24.33 
 
 		 479 aa  57.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  26.94 
 
 		 553 aa  57  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  26.94 
 
 		 553 aa  57  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  28.9 
 
 		 1143 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  28.9 
 
 		 1143 aa  56.2  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  22.76 
 
 		 715 aa  56.6  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  25.61 
 
 		 1189 aa  55.8  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10841  exodeoxyribonuclease V 67 kD polypeptide  27.91 
 
 		 574 aa  55.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0105439  normal  0.293224 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  24.07 
 
 		 629 aa  54.3  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  24.53 
 
 		 916 aa  53.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  21.59 
 
 		 1038 aa  53.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1529  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1175 aa  53.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0907559  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  24.47 
 
 		 1585 aa  53.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  24.47 
 
 		 1585 aa  53.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  23.59 
 
 		 686 aa  52.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  25.17 
 
 		 315 aa  52.4  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9531  helicase ATP-binding protein  20.62 
 
 		 1137 aa  52.4  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1126  exonuclease V, alpha subunit  26.77 
 
 		 734 aa  51.2  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00308131  normal  0.011484 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1432  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  29.17 
 
 		 576 aa  51.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00407883  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  24.06 
 
 		 1653 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  25.69 
 
 		 922 aa  50.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.34 
 
 		 568 aa  50.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  24.06 
 
 		 1620 aa  49.7  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  22.68 
 
 		 1090 aa  49.7  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  24.83 
 
 		 464 aa  49.3  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  24.75 
 
 		 2245 aa  49.3  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1292  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  27.43 
 
 		 731 aa  48.9  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.255394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  22.98 
 
 		 932 aa  48.9  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0323  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  28.65 
 
 		 599 aa  48.5  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>